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《廣西41種木腐菌DNA條形碼的研究》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、單位代碼10602學(xué)號(hào)2015011135分類號(hào)Q949.32密級(jí)公開碩士學(xué)位論文廣西41種木腐菌DNA條形碼的研究DNABarcodingResearchof41Wood-decayingFungiSpeciesinGuangxi學(xué)院：生命科學(xué)學(xué)院學(xué)科名稱：生物學(xué)研究方向：植物學(xué)年級(jí)：2015級(jí)研究生：林婷婷指導(dǎo)教師：王任翔教授完成日期：2018年6月I教授II廣西41種木腐菌DNA條形碼的研究研究生：林婷婷年級(jí)：2015級(jí)導(dǎo)師：王任翔教授學(xué)科專業(yè)：生物學(xué)研究方向：植物學(xué)摘要木腐菌是森林生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分，參與森林生態(tài)系統(tǒng)的物質(zhì)、能量循環(huán)，維持森林生態(tài)系
2、統(tǒng)的生態(tài)平衡。許多木腐菌是食用、藥用真菌，也可應(yīng)用于工農(nóng)業(yè)污染物和廢棄物的治理，具較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。但木腐菌也有危害性，木腐菌寄生或腐生于活立木或木材上會(huì)造成經(jīng)濟(jì)損失。因此，準(zhǔn)確的進(jìn)行木腐菌物種分類鑒定非常重要。廣西自然條件優(yōu)越，木腐菌資源豐富，有約300多種木腐菌被報(bào)道，其中食用木腐菌85種，藥用木腐菌127種，食藥用木腐菌51種。目前，廣西木腐菌的分類鑒定以形態(tài)學(xué)鑒定為主，但由于木腐菌具有生長(zhǎng)環(huán)境相對(duì)特殊、形態(tài)特征變化相對(duì)較大、部分物種形態(tài)差異相對(duì)較小等特點(diǎn)，較難進(jìn)行準(zhǔn)確的分類鑒定，需使用通用性更高的方法來(lái)輔助形態(tài)學(xué)進(jìn)行分類鑒定研究。DNA條形碼技術(shù)的發(fā)展有
3、效彌補(bǔ)了這方面的不足，核糖體內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列（ITS序列）已作為木腐菌研究中最普遍使用的DNA條形碼。本研究應(yīng)用DNA條形碼技術(shù)對(duì)廣西易于獲取的共271份木腐菌標(biāo)本進(jìn)行分類鑒定研究，探討基于ITS序列的DNA條形碼技術(shù)在區(qū)別和鑒定木腐菌種類方面是否具有可行性和適用性。采用處于不同狀態(tài)下的木腐菌進(jìn)行DNA條形碼的研究分析，發(fā)現(xiàn)相比形態(tài)學(xué)鑒定而言，木腐菌如被蟲啃食或腐爛不完整，或被污染等，會(huì)影響木腐菌DNA條形碼的獲取，從而影響基于DNA條形碼對(duì)木腐菌的研究與鑒定，而形態(tài)差異卻對(duì)其影響不大。本研究中成功獲取的213條木腐菌ITS序列來(lái)自41個(gè)物種，隸屬子囊菌門（A
4、scomycota）和擔(dān)子菌門（Basidiomycota）的29個(gè)屬，尚未發(fā)現(xiàn)這41種木腐菌中有共用DNA條形碼的現(xiàn)象。測(cè)序處理后發(fā)現(xiàn)所得ITS序列長(zhǎng)度在550bp-700bp左右，子囊菌門的光輪層炭殼菌（Daldiniaeschscholtzii）的ITS序列最短為556bp，擔(dān)子菌門的木腐菌ITS序列在600bp-700bp左右，每種木腐菌ITS序列長(zhǎng)度均在一定區(qū)間內(nèi)，但部分物種ITS序列的數(shù)量較少，缺乏說(shuō)服力。將得到的木腐菌ITS序列對(duì)比處理過(guò)后在NCBI上做BLAST比對(duì)分析，發(fā)現(xiàn)均能找到相似性較高的與形態(tài)學(xué)鑒定學(xué)名一致的序列，但在相似性相同的情況下
5、，有些學(xué)名一致的序列排名靠后，為BLAST比對(duì)分析帶來(lái)了一定的影響，需進(jìn)行進(jìn)一步的研究與分析。對(duì)41種木腐菌的213條ITS序列進(jìn)行多重比對(duì)分析，所得木腐菌ITS序列的堿基組成表現(xiàn)出明顯的偏向性，與ITS序列的堿基組成特點(diǎn)相符合。ITS序列間表現(xiàn)出較大的差異，與研究所采用的木腐菌種類區(qū)別較大相符合。將213條木腐菌ITS序列與NCBI上下載的41條木腐菌ITS序列一起進(jìn)行KimuraI2-parameter（K2P）遺傳距離分析，發(fā)現(xiàn)種內(nèi)平均遺傳距離為0.001，種間平均遺傳距離為0.111，可以有效區(qū)分出木腐菌大部分的種類。但對(duì)種間親緣關(guān)系比較接近的小孔菌屬
6、（Microporus），或種內(nèi)變異相對(duì)較大的云芝栓孔菌（Trametesversicolor）的區(qū)分具有一定的局限性，需對(duì)其單獨(dú)進(jìn)行K2P遺傳距離分析，才能有效區(qū)分。將254條木腐菌ITS序列一起使用鄰接法（Neighbor-joining,NJ）構(gòu)建系統(tǒng)聚類樹，可以有效區(qū)分41種木腐菌中大部分的種類，支持率在74%以上，多數(shù)為99%，少數(shù)種聚在同一支上需單獨(dú)建科或?qū)俚腘J樹才能區(qū)分。由于研究所采用的木腐菌種類散亂，物種區(qū)別較大，總數(shù)相對(duì)較多，部分種的數(shù)據(jù)較少，加上多孔菌目的部分物種分類依舊以形態(tài)學(xué)為主，系統(tǒng)分類學(xué)研究仍在發(fā)展之中。除種類較為單一的部分科屬能
7、形成單系，其他科屬的分支較為雜亂，其結(jié)果僅供參考。對(duì)部分疑難木腐菌進(jìn)行進(jìn)一步的研究分析發(fā)現(xiàn)，在NCBI網(wǎng)站中進(jìn)行BLAST比對(duì)得出的部分結(jié)果序列，可能存在分類錯(cuò)誤的問(wèn)題，也可能是比對(duì)的數(shù)據(jù)較少，得出的結(jié)果不可靠，由于缺乏相關(guān)資料，未見(jiàn)到相關(guān)標(biāo)本，不能輕易下結(jié)論。小孔菌屬物種之間的差異相對(duì)較小，云芝栓孔菌種內(nèi)變異相對(duì)較大，需增加樣品數(shù)量，嘗試結(jié)合其他DNA片段進(jìn)行進(jìn)一步的研究與分析。本研究結(jié)合形態(tài)學(xué)鑒定來(lái)對(duì)廣西41種木腐菌的213條ITS序列進(jìn)行了DNA條形碼的研究，41種木腐菌中，除小孔菌屬部分物種，綜合運(yùn)用BLAST分析、K2P遺傳距離分析、NJ樹分析等，基
8、本可以區(qū)分鑒定物種，基于ITS序列的D
