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《基因組學(xué)課件8.比較基因組學(xué).ppt》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫。
1、比較基因組學(xué)中英聯(lián)合實驗室Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學(xué)的產(chǎn)生伴隨著基因組的研究,相關(guān)信息出現(xiàn)了爆炸性增長,迫切需要對大量基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,比較基因組學(xué)作為一門重要的工具學(xué)科應(yīng)運而生。比較基因組學(xué)是通過對系統(tǒng)發(fā)育中的代表性物種之間的全方位基因和基因家族的比較分析，構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育的遺傳圖譜,來揭示基因、基因家族的起源和功能及其在進(jìn)化過程中復(fù)雜化和多樣化的機制。E
2、valuationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021果蠅基因組果蠅基因組全長180mb，2/3是euchromatin，1/3是heterochromatin；BlastSearch確定有14113個轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物（功能基因）。Science,287:2185-2195(2000)Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfil
3、e5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學(xué)定義利用不同物種基因組之間功能區(qū)域順序上、組織結(jié)構(gòu)上的同源性克隆新基因揭示基因功能闡明物種進(jìn)化關(guān)系、基因組的內(nèi)在結(jié)構(gòu)Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學(xué)的應(yīng)用揭示非編碼功能序列發(fā)現(xiàn)新基因發(fā)現(xiàn)功能性SNP闡述物種間的進(jìn)化史闡明人類疾病過程的分子機制Evaluat
4、iononly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學(xué)與進(jìn)化古細(xì)菌---產(chǎn)甲烷球菌與原核生物共同之處：染色體組織與結(jié)構(gòu)：環(huán)狀基因組、基因的操縱子結(jié)構(gòu)等能量產(chǎn)生和固氮基因與有很高的同源性與細(xì)胞分裂有關(guān)的蛋白質(zhì)、20多個編碼無機離子運輸?shù)鞍椎腛RF與細(xì)菌基因同源調(diào)控模式類似于原核生物與真核生物共同之處：細(xì)胞遺傳信息傳遞，尤其是轉(zhuǎn)錄和翻譯系統(tǒng)分泌系統(tǒng)說明該細(xì)菌與真核生物親緣關(guān)系較近。Evaluation
5、only.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021比較基因組學(xué)與進(jìn)化比較基因組學(xué)提供的結(jié)果表明，在進(jìn)化系統(tǒng)樹上，古細(xì)菌與真核生物親緣關(guān)系比原核生物更近。自養(yǎng)生物的三個分支，細(xì)菌、古細(xì)菌和真核生物中，細(xì)菌的分化發(fā)生較早。Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyL
6、td.9/2/2021比較基因組學(xué)的具體應(yīng)用方法和策略序列的比對分析確定基因組序列的進(jìn)化關(guān)系基因共線性synteny：染色體片段的分析物種序列的優(yōu)化選擇對DNA序列的信息注釋Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021基因組成的相似性基因共線性synteny：基因排列順序的一致性宏觀共線性：遺傳連鎖圖上錨定標(biāo)記排列次序的一致性微觀共線性：物理圖上基因序列的一致排列進(jìn)化距離非常近的物種間
7、保持很好的微觀共線性在進(jìn)化過程中，基因共線性被各種因素所破壞，進(jìn)化距離越遠(yuǎn)的物種之間基因共線性越差，兩個物種之間的共線性程度可以作為衡量它們之間進(jìn)化距離的尺度Evaluationonly.CreatedwithAspose.Slidesfor.NET3.5ClientProfile5.2.0.0.Copyright2004-2011AsposePtyLtd.9/2/2021高度保守和高度變異X染色體極為保守，人類和貓的X染色體具有縱貫全條的共線性在保守性較低的區(qū)段，基因進(jìn)化速率快于整個基因組的平均進(jìn)化速率它們在種間基因組中很少表現(xiàn)共線性，甚至在同一物種的不
8、同生態(tài)型之間這些區(qū)段也會發(fā)生較大變異當(dāng)用基因共線性程度估算物種分化
