nti使用手冊中文版

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1、第一章安裝和執(zhí)行程序第一章　安裝和執(zhí)行程序　VectorNTI目前為網(wǎng)絡(luò)版本，需要連到主機(jī)確認(rèn)用戶權(quán)力后才能運(yùn)作。廠商并沒有針對授權(quán)時間進(jìn)行限制，因此只要設(shè)定好LicenseServer的相關(guān)設(shè)定即可使用，不需要額外進(jìn)行申請。但用戶IP位置必須位于海洋大學(xué)校內(nèi)，方可與授權(quán)服務(wù)器聯(lián)機(jī)。請下載下面這個檔案進(jìn)行安裝http://vectornti.cs.ntou.edu.tw/VectorNTIAdvance10.exe以下將說明如何設(shè)定的過程，變更為自服務(wù)器取得授權(quán)的方式：1.選取開始→程序集→Invitr

2、ogen→VectorNTIAdvance10→LicenseManager(圖1.1)。圖1.1授權(quán)設(shè)定2.在Applications頁面中(圖1.2)，點選下面的Dynamic按鈕，上面四個字段請?zhí)钌鲜褂谜叩男彰?，系所單位，電話和電子郵件位置，最下面一欄URLofDLS請入以下字符串：http://vectornti.cs.ntou.edu.tw:8080/vntidls.cgi。DLSServerrequiresauthentication目前不需要勾選。http://gbl.cs.ntou.ed

3、u.tw/CMBB_REFIX/main/nti1VectorNTI教育訓(xùn)練手冊圖1.2授權(quán)設(shè)定窗體3.在InternetSettings(圖1.3)里面建議選取DirectConnection，這樣當(dāng)IE設(shè)定Proxy之后，才不會導(dǎo)致VectorNTI因為IP不在校內(nèi)而不能聯(lián)機(jī)。圖1.3VectorNTI授權(quán)網(wǎng)絡(luò)設(shè)定　　4.設(shè)定之后可以點選TestConnection，程序會自動聯(lián)機(jī)測試，如果在右邊的聯(lián)機(jī)結(jié)果顯示ConnectionOK(圖1.4)，就表示設(shè)定成功；如果顯示Connectionerro

4、r，則表示聯(lián)機(jī)不成功，如果有開啟防火墻/防病毒軟件，請關(guān)閉或調(diào)整設(shè)定后再試一次。圖1.4VectorNTI授權(quán)網(wǎng)絡(luò)設(shè)定，成功右下角會顯示ConnectOKhttp://gbl.cs.ntou.edu.tw/CMBB_REFIX/main/nti2第一章安裝和執(zhí)行程序5.設(shè)定成功后，在Dynamiclicense的頁面記得按下Apply，最后在Applications(圖1.5)把所有項目的Demomode改成Dynamiclicense。圖1.5授權(quán)設(shè)定，將所有的Demomode改為Dynamiclic

5、ense　　　6.依上述流程開啟VectorNTI應(yīng)該都可以正常用戶許可證運(yùn)作，如果發(fā)生聯(lián)機(jī)問題請與本中心的人員聯(lián)絡(luò)?！÷?lián)機(jī)設(shè)定完成后就可以開始執(zhí)行程序來操作了，首先NTI的文件夾有許多項目可供選擇：其中一個為主程序(VectorNTI)，而其他的功能項目是附加在主程序底下，可以各別開啟操作，也可以在主程序下面執(zhí)行(圖1.6)。圖1.6VectorNTI主程序及附屬程序各別開啟主程序開啟http://gbl.cs.ntou.edu.tw/CMBB_REFIX/main/nti3VectorNTI教育訓(xùn)練

6、手冊首次進(jìn)入主程序后系統(tǒng)將提示是否允許將新數(shù)據(jù)填入VectorNTI數(shù)據(jù)庫中，點選OK。這樣DNAmolecules，proteins，enzymes，oligos，andgelmarkers將組成NTI的數(shù)據(jù)庫，并出現(xiàn)下列三個窗口(圖1.7)。圖1.7左邊為文字窗口，右邊為圖譜窗口，下方為序列窗口圖譜窗口文字窗口序列窗口　　　　這三個窗口為文字窗口、圖譜窗口和序列窗口。文字窗口會將分析結(jié)果，作簡單的文字?jǐn)⑹?，并且可以自動做注記；圖譜窗口會將序列以一個卡通圖形進(jìn)行說明，同時具有繪圖的功能；序列窗口會將分

7、析結(jié)果，標(biāo)定在序列上面，以序列呈現(xiàn)出來?！　〗酉聛砭褪菍⑿蛄屑虞d程序中，我們可以將實驗或是搜尋所獲得的序列數(shù)據(jù)放進(jìn)程序，本文將以一個針對斑馬魚基因篩選實驗所得到的序列作為范例。加載序列最直接的方式是從程序的左上角點選File→Open將序列檔案開啟，但是注意檔案必須為GenBank/GenPept，EMBL/SWISS-PROT或FASTA、ASCII等格式，要在符合格式的情況下才能順利開啟序列。另一種方式是用剪貼的方式將序列貼入程序中，將在第二章介紹。http://gbl.cs.ntou.edu.tw

8、/CMBB_REFIX/main/nti4第二章數(shù)據(jù)庫建立和儲存序列第二章　數(shù)據(jù)庫建立和儲存序列　在了解主程序的樣子之后，接下來必須要先了解NTI的數(shù)據(jù)是如何儲存和讀取，并且建立自己的序列數(shù)據(jù)庫。NTI的程序中會有一個內(nèi)建好的數(shù)據(jù)庫，在同時把存盤的路徑預(yù)先設(shè)定在數(shù)據(jù)庫的位置之中。我們自身主機(jī)的數(shù)據(jù)庫叫做LocalDatabase，同時NTI提供了數(shù)據(jù)庫分享的功能，可以透過網(wǎng)絡(luò)和其他主機(jī)交換或分享序列數(shù)據(jù)?！∪绾谓⒆约旱臄?shù)據(jù)庫？首先在主程序