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《image j分析粒徑尺寸及分布》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線(xiàn)閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、Morphologicalstudy:focalcontactsformationForquantificationofvinculinpositivecontactsareas,weusedthefreewareimageanalysisImageJ(NIH,http://rsb.info.nih.gov/ij/).Weopenedtherawimage,convertedittoan8-bitfile,andusedtheunsharpmaskfeature(settings1:0.2)beforeremovingtheimage
2、background(rollingballradius10).Aftersmoothing,theresultingimage,whichappearssimilartotheoriginalphotomicrographbutwithminimalbackground,wasthenconvertedtoabinaryimagebysettingathreshold.Thresholdvaluesweredeterminedempiricallybyselectingasetting,whichgavethemostaccurat
3、ebinaryimageforasubsetofrandomlyselectedphotomicrographswithvaryingpeptidesdensities.Thecellareawasdeterminedbymanualdelineationonrawfluorescentimages,totalcontactareaandmeancontactareapercellwerecalculatedby‘‘a(chǎn)nalyseparticules’’inImageJ,contactssmallerthan3pixelswereno
4、ttakenintoaccount.首先用工具欄里的直線(xiàn)工具，沿SEM、TEM的標(biāo)尺（bar）拉出一條等長(zhǎng)的直線(xiàn)，在菜單欄里找到measure點(diǎn)擊，得到標(biāo)尺對(duì)應(yīng)的長(zhǎng)度數(shù)據(jù)（彈出的數(shù)據(jù)欄）；接著用同樣的步驟測(cè)量你的particles;最后導(dǎo)出你的數(shù)據(jù)，放到excel、origin里處理就行了~測(cè)量的值是相對(duì)值，要利用bar的相對(duì)值和實(shí)際值進(jìn)行換算~乘下除下就行了~首先要在measur里面選擇spatialcalibration，將這里面標(biāo)尺與自己圖片里面的標(biāo)尺對(duì)應(yīng)，最后選擇measurements，features里面選擇直線(xiàn)。自己在圖
5、片里面畫(huà)線(xiàn)，用長(zhǎng)度除以晶粒數(shù)就ok了不知道這個(gè)是不是你想要的?？梢杂胠ineprofile測(cè)量尺寸，但是你要知道imageJ是根據(jù)光的強(qiáng)弱來(lái)測(cè)量的，不一定準(zhǔn)，如果你的圖片使用AFM做的，可以直接用AFM的軟件處理會(huì)更準(zhǔn)確。最后一張圖是3D效果。1.jpg2.jpg3.jpg4.jpg5.jpg好幾次在論壇里看到有蟲(chóng)友問(wèn)關(guān)于金相圖片中如何測(cè)量顆粒尺寸以及使用什么圖像處理軟件的問(wèn)題，作為一個(gè)去年剛畢業(yè)并有過(guò)相關(guān)金相圖片處理經(jīng)驗(yàn)的過(guò)來(lái)人，決定寫(xiě)下關(guān)于這方面的經(jīng)驗(yàn)，希望對(duì)大家有一定的幫助，在這里我使用的圖片處理軟件有兩個(gè)：PHOTOSHOP和
6、IMAGE-PRO-PLUS。現(xiàn)在介紹如下：1，首先我們用PHOTOSHOP把金相圖片中需要測(cè)量的顆粒盡可能的用魔棒工具選擇出來(lái)然后進(jìn)行反選把背景刪掉，例如：原始的金相圖片為，然后我們用PHOTOSHOP把里面要測(cè)量的顆粒選出后的圖片為，到這里前期的處理工作做完了，下面我們將使用IMAGE-PRO-PLUS來(lái)進(jìn)行相應(yīng)的顆粒尺寸測(cè)量2，首先打開(kāi)IMAGE-PRO-PLUS，選擇COMPLETE點(diǎn)OK,進(jìn)入軟件后點(diǎn)DONE,然后點(diǎn)FILE-OPEN,打開(kāi)你剛用PHOTOSHOP處理后的圖片，點(diǎn)這個(gè)圖標(biāo)對(duì)金相圖片進(jìn)行處理（可以使金相中的顆粒
7、看的更加清楚,處理完后點(diǎn)擊圖標(biāo)然后會(huì)彈出個(gè)對(duì)話(huà)框,這里有三個(gè)選項(xiàng)，一般你的顆粒是暗色的，背景是白色的話(huà)就選擇DARK這個(gè)選項(xiàng)，反之也行，擇好后點(diǎn)COUNT按鍵，這樣軟件就會(huì)自動(dòng)給你金相圖片中的顆粒進(jìn)行編號(hào)。如圖，進(jìn)行完編號(hào)后我們就開(kāi)始來(lái)進(jìn)行相應(yīng)的測(cè)量了。3，在2中彈出的對(duì)話(huà)框里選擇MEASURE按鍵，選擇下拉列表中的SELECTMEASUREMENTS,彈出對(duì)話(huà)框，在下拉列表中選擇你要測(cè)量的各項(xiàng)數(shù)據(jù)，如果是測(cè)量顆粒尺寸的話(huà)一般選擇AREA(顆粒面積)、perimeter(顆粒的周長(zhǎng))、DIAMETER(MEAN)(顆粒平均尺寸)（一般
8、不建議選這項(xiàng)，因?yàn)橛密浖y(cè)出的顆粒尺寸值會(huì)有誤差，后面會(huì)講）。選好后如圖，然后點(diǎn)下面的MEASURE，這樣軟件就會(huì)自動(dòng)測(cè)量。點(diǎn)完MEASURE后剛才的對(duì)話(huà)框會(huì)自動(dòng)關(guān)閉，然后我們回來(lái)剛才的那個(gè)COUNT/SIZE對(duì)話(huà)框，選
