dnastar使用說(shuō)明

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1、DNAstar中文使用說(shuō)明書(shū)目錄DNAStar的安裝與升級(jí)……………………………………………….….6EditSeq的使用方法……………………………………………………….7打開(kāi)已有序列尋找開(kāi)放讀框DNA序列翻譯遺傳密碼選擇使用遺傳密碼修改序列的反向互補(bǔ)及反向轉(zhuǎn)換BLAST檢索序列信息查看序列校讀序列的保存與輸出GeneQuest的使用方法……………………………………………………12打開(kāi)已有分析文件GeneQuest的DNA分析方法用分析方法操作方法參數(shù)改變結(jié)果展示優(yōu)化Feature注釋BLAST檢索EntrezDatabase檢索GeneQ

2、uest的其他特點(diǎn)保存分析文件43MapDraw的使用方法………………………………………………………18新酶切圖制作過(guò)瀘器類(lèi)型應(yīng)用頻率過(guò)瀘器應(yīng)用手動(dòng)過(guò)瀘器使用過(guò)瀘器一覽表使用MustCutHere/Don’tCutHere調(diào)色板工具酶信息顯示環(huán)形展示ORF圖顯示擇選保存,退出MegAlign的使用方法…………………………………………………….23創(chuàng)建隊(duì)列文件序列設(shè)置PairwiseAlignment使用DotPlotMethod多序列比較PhylogeneticTree查看查看隊(duì)列報(bào)告Decorations/ConsensiMegAlign

3、文件保存PrimerSelect的使用方法……………………….….………………….28創(chuàng)建PrimerSelect文件定義引物特點(diǎn)查找引物對(duì)瀏覽其他的引物信息按特征對(duì)引物分類(lèi)引物長(zhǎng)度改變?cè)谝镏幸胪蛔冊(cè)O(shè)計(jì)新引物使用寡核苷酸訂購(gòu)表格保存PrimerSelect文件Protean的使用方法…………………………………………..…………34創(chuàng)建蛋白質(zhì)分析文件Protean’s蛋白質(zhì)分析方法應(yīng)用分析方法方法參數(shù)改變優(yōu)化結(jié)果顯示使用蛋白酶消化與SDSPAGEFeature注釋BLAST檢索二級(jí)結(jié)構(gòu)模擬展示滴定曲線43保存分析文件SeqManII的使用

4、方法………………………………………….…………39輸入序列片段Pre-AssemblyOptions操作檢查修整的數(shù)據(jù)序列裝配查看范圍和構(gòu)建結(jié)果去除矛盾堿基和缺口手動(dòng)修改序列末端文件保存與序列輸出43DNAStar的安裝與升級(jí)如果您以前已經(jīng)安裝了Lasergene而且目前有升級(jí)和服務(wù)聯(lián)系,您就可以通過(guò)英特網(wǎng)來(lái)升級(jí)您現(xiàn)有的版本,各種模塊(module)都是以自解壓形式存儲(chǔ)的,你可以選擇性的下載安裝。必備條件您的用戶(hù)名和會(huì)員號(hào)是必需的,可以在安裝盤(pán)上找到。程序升級(jí)備份您已有的Lasergene,找到您要升級(jí)的執(zhí)行程序,并把它轉(zhuǎn)移到備份的文件夾中

5、。連接到DNAstar網(wǎng)站的主頁(yè)(http://www.dnastar.com),從菜單中的Customers中點(diǎn)擊LasergeneUpdates點(diǎn),安提示輸入密碼和用戶(hù)名(與會(huì)員名相同),這樣就會(huì)打開(kāi)下載頁(yè)面。找到windows軟件(Windows95/98/NTSoftware.),就可以下載您想要的模塊了。模塊下載完畢以后,雙擊文件將其解壓縮完畢??吹健癆pplicationname”hasbeenupdated.說(shuō)明升級(jí)完畢。軟件安裝本節(jié)介紹若何從CD在PC機(jī)(Windows)上安裝Lasergene。注意安裝是盡量關(guān)閉所有其它程

6、序以保證安裝順利進(jìn)行。必備條件一張個(gè)人的Lasergene安裝盤(pán);一張Lasergene軟件光碟;足夠的硬盤(pán)空間和內(nèi)存:至少30Mb的硬盤(pán),32Mb的RAM。從光盤(pán)安裝Lasergene插入安裝盤(pán)和安裝光盤(pán),雙擊安裝圖標(biāo),則出現(xiàn)下面的窗口,點(diǎn)擊繼續(xù)則出現(xiàn)安裝窗口。隨后一次出現(xiàn)下面窗口,請(qǐng)按照提示做出選擇然后點(diǎn)擊Next,直至完成安裝。EditSeq的使用方法EditSeq是能夠迅速、正確地輸入,并且修改DNA或蛋白質(zhì)序列工具。每個(gè)EditSeq文件都可以分為三個(gè)可編輯的部分,上邊的一部分為序列文件,中間的一部分里是評(píng)論,底部是序列的注釋。4

7、3EditSeq能讀取大部分的序列格式——包括FASTA,GenBank,ABI、GCG和ASCII格式。你可以使用菜單命令或拖拽方式輸入序列文件。另外,序列也許通過(guò)使用鍵盤(pán)輸入,或者從其他地方復(fù)制、粘貼得到。經(jīng)Entrez或BLAST檢索得到的序列可以直接從因特網(wǎng)或企業(yè)內(nèi)部互聯(lián)網(wǎng)服務(wù)器下載。序列被打開(kāi)后,EditSeq能使用標(biāo)準(zhǔn)或者指定的遺傳密碼進(jìn)行翻譯,或者反翻譯,尋找開(kāi)放讀框,還可以進(jìn)行閱讀校對(duì)。另外,EditSeq能以GenBank,F(xiàn)ASTA和GCG格式輸出序列。如果在使用這軟件中需要幫助,可以和DNASTAR聯(lián)絡(luò)。電話(huà):(608

8、)258-7420,傳真:(608)258-7439,電子信件:support@dnastar.com,或者經(jīng)http://www.dnastar.com.打開(kāi)已有序列我們從用蘋(píng)

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