關(guān)于生物節(jié)律的數(shù)學(xué)模型

關(guān)于生物節(jié)律的數(shù)學(xué)模型

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1、關(guān)于生物節(jié)律的數(shù)學(xué)模型摘要:為了對(duì)人體的生命節(jié)律進(jìn)行有效的解釋,通過(guò)對(duì)人體生物鐘的分析,得到生命節(jié)律的變化的實(shí)質(zhì)就是生物鐘的變化,而人體生物鐘是在多個(gè)基因及蛋白的共同作用下進(jìn)行調(diào)節(jié)的,為了將生物鐘很好地運(yùn)用數(shù)學(xué)語(yǔ)言進(jìn)行表達(dá),本文采用系統(tǒng)動(dòng)力學(xué)方程模型對(duì)生物鐘進(jìn)行解釋,其中,整個(gè)生命體就是系統(tǒng),由于節(jié)律有振幅和頻率的變化,因此,本文對(duì)其兩種情況分別建立分叉判別模型和勞思—赫爾維茨判據(jù)對(duì)其分析,同時(shí)本文還描述了當(dāng)振幅和頻率都發(fā)生變化的時(shí)候的處理方法,即將分叉判別模型和勞思—赫爾維茨判據(jù)共同作用即可,為了很好的檢驗(yàn)本文所建立的模型的準(zhǔn)確性及實(shí)際運(yùn)用意義,本文

2、通過(guò)對(duì)心肌細(xì)胞進(jìn)行分析處理,得到了心臟在用內(nèi)在和外在的影響的情況下的振蕩圖形,與實(shí)際振蕩基本一致,從而驗(yàn)證了該模型的準(zhǔn)確性及實(shí)際意義。關(guān)鍵字:系統(tǒng)動(dòng)力學(xué)、分叉、勞思—赫爾維茨判據(jù)、混沌一、問(wèn)題的重述自然界的生命體或者人工智能系統(tǒng)中,可以發(fā)現(xiàn)有許多周期或者近似周期節(jié)律的現(xiàn)象存在。這些周期節(jié)律的現(xiàn)象會(huì)根據(jù)自身內(nèi)部的反饋機(jī)制以及外界的刺激或者外界輸入的變化而變化:(A)或者節(jié)律變快了,但是振幅變化不太大;(B)或者振幅變化很大,但是節(jié)律相對(duì)穩(wěn)定;(C)亦或者兩者都會(huì)有較大的變化。例如,正常人的心跳節(jié)律在有外界刺激時(shí)就會(huì)有(A)類現(xiàn)象的出現(xiàn);正常人和病人的體溫

3、晝夜變化又會(huì)有(B)類現(xiàn)象的出現(xiàn)。問(wèn):(1)請(qǐng)?jiān)O(shè)計(jì)若干數(shù)學(xué)模型,以便能夠充分反映上述描述的這些節(jié)律現(xiàn)象,并解釋模型產(chǎn)生這些現(xiàn)象的機(jī)制。(2)考慮將設(shè)計(jì)的模型具體運(yùn)用于某一個(gè)具有實(shí)際背景的系統(tǒng)中,并評(píng)價(jià)模型的優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)。二、模型假設(shè)三、符號(hào)說(shuō)明表示Michaelis常數(shù)表示各部分的最大速率定義:小寫(xiě)(或reverb)、(或bmall)、(或clock)、、、、、表示相應(yīng)基因,而大寫(xiě)的上述字母則表示相應(yīng)蛋白表示CLOCK蛋白與BMALL蛋白的異二聚體四、問(wèn)題分析生物節(jié)律現(xiàn)象的各種變化,根本上是由生物鐘決定的。生物鐘是指激發(fā)生物體內(nèi)的生物節(jié)律并使之穩(wěn)定維持的

4、內(nèi)部定時(shí)機(jī)制。生命科學(xué)家發(fā)現(xiàn),生物鐘是多種多樣的,就人體而言,已發(fā)現(xiàn)一百多種。人體的生理指標(biāo),如體溫、血壓、脈搏;人的體力、情緒、智力和婦女的月經(jīng)周期;體內(nèi)的信號(hào),如腦電波、心電波、經(jīng)絡(luò)電位、體電磁場(chǎng)的變化等等,都會(huì)隨著晝夜變化作各種周期性變化。生物鐘主要是由生物體內(nèi)的一種被稱作時(shí)鐘基因的細(xì)胞核或細(xì)胞質(zhì)決定的。生物鐘基因普遍存在于生物體內(nèi),起著調(diào)控機(jī)體生命活動(dòng)和近日節(jié)律運(yùn)轉(zhuǎn)的作用,它們及其編碼的蛋白質(zhì)產(chǎn)物構(gòu)成的自主調(diào)控的轉(zhuǎn)錄和翻譯負(fù)反饋環(huán)是生物鐘運(yùn)轉(zhuǎn)的分子機(jī)制。在生物體內(nèi),存在著不止一個(gè)時(shí)鐘基因,同時(shí)還存在著大量對(duì)生物體的時(shí)鐘基因有影響的基因,時(shí)鐘基因

5、之間相互耦合或彼此之間相互影響會(huì)同時(shí)對(duì)生物節(jié)律變化起作用。由于生物體內(nèi)的生物鐘存在對(duì)光或其他外界噪聲、濕度以及溫度等的敏感性,所以生物體的時(shí)鐘基因與外界環(huán)境存在著一定的關(guān)系??偠灾锕?jié)律是系統(tǒng)作用的結(jié)果。從系統(tǒng)科學(xué)的觀點(diǎn)考慮,它是一個(gè)負(fù)反饋控制的系統(tǒng)。因此,可以運(yùn)用系統(tǒng)動(dòng)力學(xué)的有關(guān)方法建立數(shù)學(xué)模型,以反映題目所描述的節(jié)律現(xiàn)象。(意義???)對(duì)于一般的生化系統(tǒng)來(lái)說(shuō),都存在著一個(gè)穩(wěn)定態(tài)。本文要判斷一個(gè)系統(tǒng)是否處于穩(wěn)定狀態(tài),必須得進(jìn)行穩(wěn)定性分析。通過(guò)對(duì)該生命節(jié)律模型的穩(wěn)定性分析,本文可以得到該系統(tǒng)的穩(wěn)定態(tài)標(biāo)準(zhǔn)。系統(tǒng)的震蕩性是生物節(jié)律發(fā)生變化的基礎(chǔ)。要產(chǎn)

6、生穩(wěn)定性震蕩,首先得滿足兩個(gè)條件:1.系統(tǒng)具有自我增加的元素,2系統(tǒng)是具有負(fù)反饋的部分相關(guān)臨界值則反映了生命節(jié)律的穩(wěn)定態(tài)和周期震蕩,通過(guò)求出相關(guān)臨界值,可以判斷生命節(jié)律變化處于何種狀態(tài)。五、模型建立生物節(jié)律的起始點(diǎn)是一種“轉(zhuǎn)錄—翻譯—抑轉(zhuǎn)錄”機(jī)制構(gòu)成的反饋環(huán)。反饋環(huán)的正性因素通過(guò)PAS結(jié)構(gòu)域相互配對(duì),結(jié)合于生物鐘基因上游的啟動(dòng)子上,啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而翻譯產(chǎn)生生物鐘蛋白,參與生物鐘現(xiàn)象。而生物鐘蛋白同時(shí)作為負(fù)性因素,進(jìn)人細(xì)胞核通過(guò)與正性因素結(jié)合而抑制生物鐘基因啟動(dòng)子的活化,使mRNA水平下降,最終蛋白自身減少,反饋抑制作用逐漸減弱,完成一個(gè)循環(huán)。各生物鐘

7、基因相互作用機(jī)制如下圖所示:per2crieclockper1cry2cry1PER1CRY2PER2CRY1CRIECLOCKBMALLREVBRBreverbbmall生物鐘基因轉(zhuǎn)錄因子主要反饋環(huán)示意圖注:-表示負(fù)反饋,+表示正反饋,表示自身震蕩生物鐘是由依賴于CLOCK/BMALL等蛋白因子的正反饋環(huán)和依賴于CRY(隱色素)等蛋白因子的負(fù)反饋環(huán)共同維持的有機(jī)系統(tǒng)。CLOCK基因生物鐘的組織中起著中心作用,Bmall是Clock基因的分子伴侶,二者的相應(yīng)蛋白相互作用形成二聚體,激活Perl,Per2,Per3,Cryl和Cry2基因的轉(zhuǎn)錄。PER1

8、,PER2,PER3,CRY1和CRY2蛋白相互作用形成二聚體或三聚合物,將PEP1、PER2

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