堆肥中高效纖維素降解菌的篩選與鑒定

堆肥中高效纖維素降解菌的篩選與鑒定

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1、堆肥中高效纖維素降解菌的篩選與鑒定李丹花,喬莉娟,岳丹,昝立峰,段保寧,白蘭所(邯鄲學(xué)院生命科學(xué)與工程學(xué)院,河北邯鄲056005)摘要:從邯鄲地區(qū)堆肥中分離出5株具有纖維素降解能力的菌株,纖維素降解能力的初步鑒定結(jié)果顯示,M1菌株具有較強(qiáng)的纖維素降解能力。對(duì)M1菌株進(jìn)行分子鑒定和生長(zhǎng)特性的初步鑒定,結(jié)果表明,M1菌株應(yīng)當(dāng)歸屬于假單胞菌屬(Pseudomonassp.),菌株的溫度生長(zhǎng)范圍為10~45°C,最適生長(zhǎng)溫度為30°C,pH6~8菌株均可生長(zhǎng),最適條件為pH6。.jyqkL,加入玻璃珠振蕩培養(yǎng)1h備用。1.2培養(yǎng)基配方羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基組分為:CMC-Na1

2、0.00g、KH2PO41.00g、NaCl0.10g、MgSO4·7H2O0.30g、NaNO32.50g、FeCl30.01g、CaCl20.10g、瓊脂18.00g、蒸餾水1L;剛果紅纖維素瓊脂培養(yǎng)基組分為:CMC-Na10.00g、KH2PO41.00g、NaCl0.10g、MgSO4·7H2O0.30g、NaNO32.50g、FeCl30.01g、CaCl20.10g、剛果紅0.20g、瓊脂18.00g、蒸餾水1L;LB培養(yǎng)基組分:蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl10g,瓊脂15g,蒸餾水1L,pH7.0。所有培養(yǎng)基于121℃下滅菌30min備用。1.

3、3菌種的分離純化發(fā)酵物菌液按照梯度稀釋法稀釋?zhuān)∠♂尪葹椋保埃病保埃档膽覞嵋海玻埃唉蹋谭謩e涂布于羧甲基纖維素鈉分離培養(yǎng)基中培養(yǎng),培養(yǎng)物放入28℃恒溫箱培養(yǎng),將長(zhǎng)出的菌落接種至LB培養(yǎng)基上進(jìn)行劃線(xiàn)純化。1.4分解纖維素能力鑒定將純化好的菌株點(diǎn)接到剛果紅纖維素瓊脂培養(yǎng)基上,28℃恒溫箱培養(yǎng)5d,量取透明圈直徑(D)和菌圈直徑(d),并計(jì)算出比值HC(D/d),從而判定菌株的纖維素分解能力。1.5菌株的分子鑒定用細(xì)菌DNA提取試劑盒(北京索萊寶科技有限公司)提取細(xì)菌基因組DNA,以基因組DNA為模板,27F和1492R為16SrDNA引物進(jìn)行分子鑒定。PCR產(chǎn)物瓊脂糖

4、凝膠回收試劑盒(北京索萊寶科技有限公司)回收大約1.5kb的目的條帶,連接到pGM-T載體(北京索萊寶科技有限公司)上,轉(zhuǎn)化至E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞中,將陽(yáng)性重組子送北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司測(cè)序。將測(cè)定得到的16SrDNA序列通過(guò)BLAST軟件與GenBank中相關(guān)序列進(jìn)行比對(duì),并利用MEGA5.0軟件進(jìn)行聚類(lèi)分析構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。1.6不同溫度對(duì)菌株M1生長(zhǎng)的影響將M1菌株的菌液以1%的接種量接種于5mLLB培養(yǎng)基中,分別培養(yǎng)于10、15、20、25、30、35、40、45、50、55和60℃系列搖床內(nèi),搖床轉(zhuǎn)速為100r/min,2d后測(cè)定菌株的生長(zhǎng)量。每個(gè)

5、處理重復(fù)3次。1.7不同pH對(duì)菌株M1生長(zhǎng)的影響將M1菌株的菌液以1%的接種量分別接種于pH2.0、4.0、6.0和8.0的5mLLB培養(yǎng)基中,置于30℃、100r/min的搖床上培養(yǎng),2d后測(cè)定菌株的生長(zhǎng)量。每個(gè)處理重復(fù)3次。2結(jié)果與分析2.1菌株分解纖維素能力鑒定腐熟發(fā)酵物樣品經(jīng)羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基分離培養(yǎng)和LB培養(yǎng)基劃線(xiàn)純化培養(yǎng)后共得到5株形態(tài)不同的菌株,分別命名為M1-M5。5株菌都可以在羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基上生長(zhǎng),具有降解纖維素的能力。同時(shí)測(cè)定菌株在剛果紅纖維素瓊脂培養(yǎng)基中生長(zhǎng)時(shí)的HC值(D/d),對(duì)篩選到的菌種進(jìn)行分解纖維素能力的初步鑒定,結(jié)果如表1所示。

6、M1-M5菌株的HC值表明,M1菌株的HC值最高。前人研究表明[4],HC值超過(guò)2.50的菌株纖維素酶活性高,M1菌株的HC值為2.50,具有較強(qiáng)的纖維素降解能力。2.2菌株鑒定結(jié)果將菌株M1的16SrDNA測(cè)序結(jié)果用BLAST軟件進(jìn)行同源性比較,菌株M1的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)如圖1所示。結(jié)果表明,M1菌株序列與多個(gè)假單胞菌屬(Pseudomonassp.)菌株的16SrDNA序列相似性都達(dá)到99%,與Pseudomonassp.JC5菌株處在同一個(gè)分支上,因此,將菌株M1歸屬于Pseudomonassp.。2.3M1菌株生長(zhǎng)特性M1菌株生長(zhǎng)特性如圖2所示,由圖2可知,菌株的溫

7、度生長(zhǎng)范圍為10~45℃,最適生長(zhǎng)溫度在30℃左右,當(dāng)溫度高于45℃時(shí),菌株幾乎不能生長(zhǎng)。pH6~8條件下菌株均可生長(zhǎng),最適條件為pH6,pH<4或pH>10,菌株均不能生長(zhǎng)。3小結(jié)與討論本試驗(yàn)從腐熟堆肥發(fā)酵物中篩選到5株形態(tài)不同的菌株。分別命名為M1-M5。5株菌都可以在羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基上生長(zhǎng),具有降解纖維素的能力。同時(shí)測(cè)定菌株在剛果紅纖維素瓊脂培養(yǎng)基中生長(zhǎng)時(shí)的HC值,M1菌株的HC值最高(2.50),具有較強(qiáng)的纖維素降解能力。對(duì)菌株M1進(jìn)行分子鑒定,結(jié)果表明,M1菌株序列與多個(gè)假單胞菌屬菌株的16SrDNA序列相似性都達(dá)到99%,與Pseud

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