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1、第五章遺傳信息的傳遞第四節(jié)轉(zhuǎn)錄RNA的生物合成DNA指導(dǎo)下的RNA的合成：轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄后RNA的加工RNA指導(dǎo)下的RNA的合成：病毒RNA的復(fù)制轉(zhuǎn)錄、有義鏈和反義鏈E.coliRNA聚合酶a-鵝膏蕈堿二、啟動(dòng)子與轉(zhuǎn)錄因子大腸桿菌RNA聚合酶的啟動(dòng)子大腸桿菌不同的o因子識(shí)別不同序列的啟子：(二)真核生物的啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子1.類別I啟動(dòng)子啟動(dòng)子包括：核心啟動(dòng)子：-5?+20,足以啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄，效率很低上游調(diào)控元件(UCE):-180?-107,增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的起始二者各有一個(gè)富含GC的特異序列，約85%相同。RNA聚合酶I的轉(zhuǎn)錄因子有：上游
2、結(jié)合因子(upstreambindingfactor，UBFi):單鏈多肽，它特異地結(jié)合在核心啟動(dòng)子和UCE的富含GC的元件上選擇因子1(selectivityfactorhSL,):四聚體蛋白質(zhì)，含有1個(gè)TBP(TATA-結(jié)合蛋白)和3個(gè)TAFI2.類別II啟動(dòng)子順式作用元件(cis-actingelement)DNA序列反式作用因子(trans-actingfactor)蛋白因子(多)類別II啟動(dòng)子包括四類調(diào)控元件基本啟動(dòng)子起始子上游元件應(yīng)答元件協(xié)助RNA聚合酶II起作用的轉(zhuǎn)錄因子分為：(1)通用因子(基本因子)：作用
3、于基本啟動(dòng)子和起始子，決定轉(zhuǎn)錄的起始位點(diǎn)。(2)上游因子：作用于上游元件，其活性不受調(diào)控。提高啟動(dòng)的效率，是那些功能相當(dāng)高的啟動(dòng)子所必需的。(3)誘導(dǎo)型因子：作用與上游因子相同，但是受到調(diào)控。它們結(jié)合的元件叫做應(yīng)答元件。一個(gè)僅含有被基礎(chǔ)因子和上游因子所識(shí)別的元件的啟動(dòng)子能在任何種類的細(xì)胞中進(jìn)行轉(zhuǎn)錄?？梢娺@種啟動(dòng)子擔(dān)負(fù)著細(xì)胞中那些組成型基因，有時(shí)也叫做持家基因(housekeepinggene)的表達(dá)。起始子(initiator,Inr):轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)位置處有一保守序列真核RNA聚合酶II需要許多其它蛋白因子真核RNA聚合酶n和
4、轉(zhuǎn)錄因子在啟動(dòng)子上的裝配應(yīng)答元件熱休克元件HSE共有序列CNNGAANNTCCNNG可被熱休克因子HSF識(shí)別血清效應(yīng)元件SRE共有序列CCATATTAGG可被血清效應(yīng)因子SRF識(shí)別和作用干擾素一Y的效應(yīng)元件IGRE的共有序列TTNCNNNAA可被信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄活化蛋白STAT識(shí)別和作用。1.類型III啟動(dòng)子RNA聚合酶m的啟動(dòng)子有兩種：5SrRNA、tRNA和scRNA基因的啟動(dòng)子在起始位點(diǎn)的下游，即在基因的內(nèi)部，稱為內(nèi)部啟動(dòng)子兩種內(nèi)部啟動(dòng)子都是由兩個(gè)短序列元件構(gòu)成的，兩個(gè)元件用可變的序列分隔開。snRNA（核內(nèi)小RNA）
5、基因的啟動(dòng)子為上游啟動(dòng)子。三、終止子（terminator）和終止因子大腸桿菌兩類終止子的回文結(jié)構(gòu)不依賴Rho?因子的終止子：含富GC的回文序列和寡聚U序列。（二）真核細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄終止RNA聚合酶II的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物在3’末端切斷，然后腺苷酸化，而無終止作用。在結(jié)構(gòu)基因最后一個(gè)外顯示子的V端，常有一組共同序列AATAAA,其下游還有相當(dāng)多的GT序列。這些序列稱為轉(zhuǎn)錄修飾點(diǎn)。當(dāng)RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄出AAUAAA后，聚腺苷酸特異因子（CPSF）能識(shí)別它并與它結(jié)合。在CPSF以及切割活化因子（CstF）等因子的指導(dǎo)下，特異的核酸內(nèi)切酶在
6、AAUAAA下游11-30核苷酸處切斷RNA鏈，mRNA前體（hnRNA）的轉(zhuǎn)錄即告終止。四、真核生物轉(zhuǎn)錄（與原核生物轉(zhuǎn)錄比較）4.6.7.8.StandardssamecopynumberinallcellsexpressedinallcellsmediumcopynumberadvantageouscorrectionmoreaccurateStandardsCommonlyusedstandardsGlyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenasemRNABeta-actinmRNAMHC
7、I(majorhistocompatabilitycomplexI)mRNACyclophilinmRNAmRNAsforcertainribosomalproteinsE.g.RPLPO(ribosomalprotein,large,P0;alsoknownas36B4,P0,L10E,RPPO,PRLPO,60SacidicribosomalproteinP0,ribosomalproteinL10,ArbporacidicribosomalphosphoproteinP0)28Sor18SrRNAUsesofRNas
8、eProtectionAssays(RPAs)1.DeterminerelativeabundanceofanRNA2.Map5’and/or3’endsofanRNA1.Determinepresenceorabsenceofintron/exons(codingsequence，alternativ
