鴨oih、fshβ基因多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關聯(lián)研究

鴨oih、fshβ基因多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關聯(lián)研究

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1、華中農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文鴨O/H,腳基因多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關聯(lián)研究StudiesonPolymoprhisms0fDuckO/HAndFsHBGoneandTheirAssociationsWithEggPerformence碩士研究生:王蒙學號:2011302110028指導教師:龔炎長教授指導小組:龔炎長教授彭秀麗副教授俸艷萍副教授李世軍副教授專業(yè):動物遺傳育種與繁殖研究方向:家禽分子育種獲得學位名稱:農(nóng)學碩士獲得學位時間:2015.06華中農(nóng)業(yè)大學動物科技學院與動物醫(yī)學院二。一五年六月萬方數(shù)據(jù)華中農(nóng)業(yè)大學學位論文獨創(chuàng)性聲明及使用授權(quán)

2、書學位論文是否保密吞如需保密,解密時間年月目獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個人在導師指導下進行的研究_-E作及取得的研究成果。盡我所知,除了文中特別加以標注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得華中農(nóng)業(yè)大學或其他教育機構(gòu)的學位或證書而使用過的材料,指導教師對此進行了審定。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均已在論文中做了明確的說明,并表示了謝意。研究生簽名:.王豪時間:加I歲年占月·7日’㈨黼牦王彖’名:彥哌簽名日期:扣彥年6月17日簽名日期:紗c灃么月f7日萬方數(shù)據(jù)鴨OItL劂基因多態(tài)性及其與

3、產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)研究目錄中文摘要..iABSTRACT..iii縮略詞表.v1文獻綜述.11.1研究課題的由來l1.2DNA分子標記及其應用..11.3鴨基因組研究現(xiàn)狀31.4本研究涉及的候選基因研究現(xiàn)狀31.4.1卵(類粘蛋白)抑制劑基因31.4.2促卵泡激素基因41.5研究的目的和意義52實驗材料和方法.62.1實驗材料62.1.1實驗鴨群與生產(chǎn)性狀資料62.1.2主要實驗儀器和設備62.1.3主要試劑72.I.4常用溶液及其配制72.1.5主要分子生物學軟件和分子生物學網(wǎng)站92.2實驗方法92.2.1鴨血基因組DNA提取與檢測..92.2.

4、2總RNA提取102.2.3cDNA樣品準備102.2.4PCR擴增條件及產(chǎn)物檢測112.2.5PCR產(chǎn)物酶切體系及檢測112.2.6DNA池的構(gòu)建..122.2.7PCR產(chǎn)物測序與序列比對分析122.3引物設計.132.3.1鴨。!.孵基因引物設計132.3.2鴨FSHfl基因引物設計13萬方數(shù)據(jù)華中農(nóng)業(yè)大學2015屆碩士研究生學位(畢業(yè))論文2.4數(shù)據(jù)統(tǒng)計.142.4.1基因型頻率和等位基因頻率142.4.2Hardy-Weinberg群體遺傳平衡檢驗及卡方適合度檢驗142.4.3基因型與性狀關聯(lián)分析143結(jié)果與分析153.1鴨0111基

5、因結(jié)果153.1.1OIH基因引物擴增153.1.2DNA池的PCR產(chǎn)物測序.163.1.3011-1基因A一316G位點及其與產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)分析.173.1.4OIH基因A.1287C位點及其與產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)分析193.1.5A一316G和A一1287C位點重構(gòu)單倍型與產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)分析.2l3.2鴨腳基因結(jié)果一233.2.1鴨FSHfl基因引物擴增233.2.2DNA池的PCR產(chǎn)物測序.233.2.3腳基因C一82G位點及其與產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)分析.243.2.4腳基因T-308G位點及其與產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)分析273.2.5C一82G和T.308G位點重

6、構(gòu)單倍型與產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)分析.284討{念..3l4.1鴨Off/基因多態(tài)性與多個產(chǎn)蛋性狀相關314.2鴨腳基因具有高度多態(tài)性一324.3鴨腳基因變異會影響鴨的產(chǎn)蛋性狀..325小結(jié)..346結(jié)論和展望356.1本研究已取得結(jié)果.356.2本研究的特色.356.3本研究的不足和下一步研究設想.35參考文獻36附錄..4l致謝一44II萬方數(shù)據(jù)鴨OIH,FSHfl基因多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀關聯(lián)研究中文摘要本研究以卵抑制劑(011-1)基因和促卵泡激素(FSH,a)基因為鴨產(chǎn)蛋性狀相關候選基因,先克隆獲得了兩基因部分序列,并采用DNA池技術檢測了兩基

7、因的DNA多態(tài)性,兩個基因各選擇兩個SNP位點做PCR-RFLP,以連城白鴨與白改鴨雜交第3代群體為材料,檢測各個體的基因型并研究性狀的關聯(lián),主要研究結(jié)果如下:1.克隆獲得了鴨卵抑制劑(D腳基因Exonl0一Exonl2和Intoml0一Intoml2的部分序列,采用DNA池加測序的方法對鴨卵抑制劑(D四)基因編碼區(qū)及其側(cè)翼序列進行SNP掃描,共檢測到4個新的SNP位點,其中位點c.316A>G和C.1287A>C分別導致了限制性內(nèi)切酶AccI和AluI酶切位點多態(tài)性的改變。在連城白鴨與白改鴨雜交第3世代群體中,c.316A>G位點等位基因G

8、和A頻率分別為0.33和O.67,c.1287A>C位點等位基因C和A頻率分別為O.91和O.09;關聯(lián)分析結(jié)果顯示,位點c.316A>G與群體的420天產(chǎn)蛋量(P

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