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《研究生論文：樟科和忍冬科的dna條形碼篩選研究》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、湖北中醫(yī)藥大學(xué)碩士學(xué)位論文樟科和忍冬科的DNA條形碼篩選研究姓名：劉震申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：中藥學(xué)指導(dǎo)教師：陳科力20100527中文摘要目的：通過對(duì)四條不同的DNA片段(psbA-trnH,171a必rbcL，和ITS2)進(jìn)行篩選，尋找適合樟科和忍冬科植物鑒定的DNA條形碼序列。方法：使用psbA-trnH,rbcL、1"11atl(和核ITS2的通用引物對(duì)樟科和忍冬科植物進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序，比較各序列擴(kuò)增和測序效率、種內(nèi)和種間變異，進(jìn)行barcodinggap分析，采用BLASTl和NearestDiStance方法評(píng)價(jià)不同序列的鑒定能力。結(jié)果：所采集試驗(yàn)樣本及拓展分析
2、數(shù)據(jù)相結(jié)合，使用BLASTl的方法對(duì)樟科植物35個(gè)屬，117物種，175樣本的研究發(fā)現(xiàn)，psbA-trnH序列在樟科植物中的鑒定成功率在種水平上為84．0％，屬水平上為92．3％。而在忍冬科13個(gè)屬32個(gè)物種54個(gè)樣本中，ITS2的鑒定成功率最高，物種水平上為96．3％，屬水平為100％。結(jié)論：葉綠體間隔區(qū)psbA-trnH序列可以作為樟科植物的DNA條形碼候選序列，而ITS2序列可以作為忍冬科DNA條形碼的候選序列，同時(shí)我們推薦psbA-trnH序列作為忍冬科植物DNA條形碼鑒定的補(bǔ)充序列。關(guān)鍵詞：DNA條形碼；樟科；忍冬科；psbA-trnI毛,m8瑙rbcL；ITS2Ap
3、pIicationofDNAbarcodinginthePIantsofLauraceaeandCaprifoIiaceaeramiIYSpeciaIity：ScienceofChinesemateriamedicaAuthor：ZhenLiuTutor：Ke-IithenAbstractObjective：ThiSStudyaimstodeterminethecandidatesequencesthatcanbeusedasDNAbarcodeinLauraceaeandCaprifoliaceaefamily．Methods：PCRamplification，sequenc
4、ingefficiency，differentialintra—andinter—specificdivergences，DNAbarcodinggap，andidentificationefficiencywereusedtoevaluatethefourdifferentDNAsequencesofpsbA—trnH,matK。fbcLandITS2．Results：①Thedisetiminationabi1ityofpsbA—trnHin175plantsamplesbelongingto117speciesfrom35diStinctgeneraofLauraceae
5、wastested．ItwasfoundthattherateofsuccessfulidentificationwithpsbA-trnllwere84．0％and92．3％atthespeciesandgenuslevel，respectively．②WetestedITS2regionforitssuitabi1ityasDNAbarcodesofCaprifoliaceaefamilyacross54samplesbelongingto32speciesfrom13genera．TheITS2whoserateofsuccessinidentificationingen
6、eraleveliS100％andinspeciesiS96．3％．Conelusion：Bycomparing／Yat＆rbcLandITS2，itwasfoundthatthepsbA—。trnHregioniSthebestmarkerfortheidentificationofLauraceaespecies．TheITS2canbeusedasacandidatesequenceofDNAbarcodetoidentifythespeciesinCaprifoliaceaefamily，andpsbA—trnHasacomplementarybarcodetoITS2
7、forCaprifoliaceae．ⅡKeyWords：DNAbarcoding；Lauraceae；Caprifoliaceae；psbA——trnl鷥,Illaf噩rboL；ITS2Ill湖北中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人聲明：所呈交的學(xué)位論文是在導(dǎo)師的指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。除了論文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，本論文不包含其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得湖北中醫(yī)藥大學(xué)或其他單位的學(xué)位或證書而使用過的材料。對(duì)本文的研究做出貢獻(xiàn)的個(gè)人和集體，均已在
