玉米3個(gè)百粒重qtl近等基因系的構(gòu)建及精細(xì)定位

玉米3個(gè)百粒重qtl近等基因系的構(gòu)建及精細(xì)定位

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1、河南農(nóng)業(yè):大學(xué)2012屆碩士學(xué)位論文摘要農(nóng)作物大多數(shù)重要的農(nóng)藝性狀為多基因控制的數(shù)量性狀,遺傳基礎(chǔ)比較復(fù)雜,又容易受環(huán)境條件影響。隨著玉米基因組測(cè)序的基本完成,圖位克隆已成為QTL克隆的主要方法之一,而近等基因系的構(gòu)建是對(duì)QTL進(jìn)行精細(xì)定位和圖位克隆的基本前提。本研究在基于利用大粒普通玉米自交系丹232與小粒爆裂玉米自交系N04雜交構(gòu)建的RIL群體初步定位3個(gè)百粒重主效凹LqnpGWl、qnpGW5和qnpGW7的基礎(chǔ)上,通過多年連續(xù)回交和實(shí)施分子標(biāo)記輔助選擇,分別構(gòu)建了3個(gè)目標(biāo)QTL的近等基因系,并通過利用近等基因系構(gòu)建的分離群體對(duì)2

2、個(gè)目標(biāo)QTL進(jìn)行初步的精細(xì)定位。研究結(jié)果不僅驗(yàn)證了初步定位結(jié)果的真實(shí)性和可靠性,而且為目標(biāo)QTL的進(jìn)一步精細(xì)定位、克隆及其候選基因挖掘提供了重要依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.以爆裂玉米自交系N04為受體和輪回親本,通過連續(xù)4代連續(xù)回交結(jié)合對(duì)目標(biāo)QTL冪II背景的分子標(biāo)記輔助選擇,構(gòu)建了以N04為遺傳背景的qnpGWl近等基因系。BC。F,代目標(biāo)單株B8—28的背景恢復(fù)率最高,達(dá)到95.O%。通過構(gòu)建的BC。F?;亟环蛛x群體把目標(biāo)QTLqnpGWl定位于第1染色體umc2145"--umc2532標(biāo)記區(qū)間,距離雙側(cè)標(biāo)記距離為2.0CM矛11

3、7.1cM,可解釋24.96%的表型變異,LOD值為7.78。與以往研究利用F2:。著nRILs群體定位結(jié)果比較,位置一致,雙側(cè)標(biāo)記的間距縮小為9.1cM,LOD值和貢獻(xiàn)率有所增大。BC。F。根據(jù)對(duì)雙親自交系目標(biāo)區(qū)段的小規(guī)模測(cè)序結(jié)果,通過比對(duì)雙親測(cè)序序列找到插入/缺失位點(diǎn),開發(fā)10個(gè)indel標(biāo)記,檢測(cè)不同交換類型單株,結(jié)合表型利用染色體片段代換定位法將qnpGWl限定在標(biāo)記npl一1和umc2532之間相距14.62Mb的區(qū)段內(nèi)。2.采用與qnpGWl相同的方法構(gòu)建qnpGW5的近等基因系。在BC。F,代目標(biāo)單株B9-74的背景恢復(fù)率

4、最高,達(dá)到96.3%。利用構(gòu)建的BC。F?;亟环蛛x群體把目標(biāo)QTLqnpGW5定位于第5染色體umcl274"--umc2296標(biāo)記區(qū)間,距離雙側(cè)標(biāo)記距離分別為1.2cM和4.7cM,可解釋17.73%的表型變異,LOD值為3.31。與以往研究利用F粥、RILs群體定位結(jié)果比較,位置一致,雙側(cè)標(biāo)記的間距縮小為5.9cM,LOD值和貢獻(xiàn)率有所增大。3.采用與馳夠胛相同的方法構(gòu)建qnpGWTI簦]近等基因系。在BC。F。代目標(biāo)單株B12—4的背景恢復(fù)率最高,達(dá)到95.0%。通過構(gòu)建的BCaF-回交分離群體把鍛陽伊碇位于第7染色體umc209

5、2~umcl393標(biāo)記區(qū)間,距離雙側(cè)標(biāo)記距離分別為2.0cM和1.8cM,可解釋16.43%的表型變異,LOD值為3.87。與以往研究利用F。山RILs群體定位結(jié)果比較,位置一致,雙側(cè)標(biāo)記的間距縮小為3.8cM,LOD值和貢獻(xiàn)率有所增大。利用與qnpG耽相同的方法開發(fā)6個(gè)多態(tài)性的indel標(biāo)記,利用染色體片段代換定位方法,將馳刪艮定在標(biāo)記np7—3和np7—5之間相距3.72Mb的區(qū)段內(nèi)。關(guān)鍵詞:玉米;百粒重;QTL;近等基因系;精細(xì)定位河南農(nóng)業(yè)大學(xué)2012屆碩士學(xué)位論文英文摘要NILSDEVELOPMENTANDFINEMAPPING

6、OFTHREEQTLFoR100.GRAINWEIGHTINMAIZESupervisor:Prof.LlYulingMasterCandidate:ShenBingtaoAbstract:Mostofimportantagronomictraitsincropsarcquantitativelyinherited、Ⅳitllcomplexgeneticbasis.Theyareeasilyinfluencebyenvironmentalconditions.Followed謝tllthecompletionofsequencefort

7、hewholemaizegenome,map-basedcloninghasbecomeoneofthemostimportantmethodsusedinQTLcloning.Theconstructionofnear-isogeniclines(NIL)andfinemappingofobjectiveQTListhepreconditionformap-basedcloning.Inthisstuty,threeQTL-NILsfor100-grainweight(qnpGWl,qqnpGW5andqnpGW7)wereconst

8、ructedusingthemarker-assistedselection(MAS)accordingtotheprimaryQTLidentifiedusingtheRILpopulationdevel

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