477份常規(guī)水稻品種的遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析

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1、獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明，所呈交的學(xué)位論文，是在指導(dǎo)教師指導(dǎo)下，通過(guò)我的努力取得的成果，并且是自己撰寫(xiě)的。盡我所知，除了文中作了標(biāo)注和致謝中已經(jīng)作了答謝的地方外，論文中不包含其他人發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研究成果，也不包含在江西農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)獲得學(xué)位或證書(shū)而使用過(guò)的材料。與我一同對(duì)本研究做出貢獻(xiàn)的同志，都在論文中作了明確的說(shuō)明并表示了謝意。如被查有嚴(yán)重侵犯他人知識(shí)產(chǎn)權(quán)的行為，由本人承擔(dān)應(yīng)有的責(zé)任。學(xué)位論文作者親筆簽名：≤綻羔選日期：論文使用授權(quán)的說(shuō)明矽f≥．口歲本人完全了解江西農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即學(xué)校有權(quán)送交論文的復(fù)印件和

2、電子版，允許論文被查閱和借閱；學(xué)?？梢怨颊撐牡娜炕虿糠謨?nèi)容，可以采用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文。保密，在——年后解密可適用本授權(quán)書(shū)?？诓槐Ｃ?，本學(xué)位論文屬于不保密?！?請(qǐng)?jiān)诜娇騼?nèi)打“寸’)學(xué)位論文作者親筆簽名：經(jīng)銎益日期：2望蘭：哆指導(dǎo)教師親筆簽名：日期：翌121魚(yú)目錄摘要??????????????????????????????????．．IIIAbstract????????????????????????????????????IV1文獻(xiàn)綜述??????????????????????????11．1基因定位的重要意

3、義?????????????????????????l1．2基因定位的方法???????????????????????????11．2．1基于連鎖作圖的QTL定位分析????????????????????21．2．2基于連鎖不平衡的關(guān)聯(lián)分析?????????????????????．32實(shí)驗(yàn)分析??????????????????????????72．1材料與方法?????????????????????????????72．1．1實(shí)驗(yàn)材料?????????????????????????????．72．1．2試驗(yàn)方法??????

4、???????????????????????．72．1．3總DNA的提取及質(zhì)量檢測(cè)?????????????????????一72．1．3．1水稻DNA基因組的提取??????????????????????72．1．4PCR擴(kuò)增引物的可行性分析?????????????????????．82．1．5PCR擴(kuò)增?????????????????????????????????????一82．1．6聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物?????????????．．82．1．7擴(kuò)增產(chǎn)物的帶型讀取??????????????????

5、??????．82．1．8數(shù)據(jù)分析?????????????????????????????．92．2結(jié)果與分析?????????????????????????????92．2．1DNA提取樣品的質(zhì)量檢測(cè)??????????????????????92．2．2擴(kuò)增產(chǎn)物及擴(kuò)增引物的可行性分析結(jié)果????????????????102．2．3擴(kuò)增產(chǎn)物的讀帶結(jié)果????????????????????????102．2．4477份水稻群體的遺傳多樣性分析??????????????????．102．2．5水稻不同染色體進(jìn)化分析和同一染色體

6、不同引物間連鎖不平衡分析及染色體突變位點(diǎn)分析??????????????????????????????．132．2．6477份水稻群體的聚類(lèi)分析?????????????????????．132．2．7群體結(jié)構(gòu)分析???????????????????????????152．2．8秈粳稻亞類(lèi)中各亞群的遺傳關(guān)系???????????????????15目錄3小結(jié)與討論????????????????????????．173．1群體結(jié)構(gòu)分析對(duì)關(guān)聯(lián)分析的的重要性和對(duì)其的影響???????????一173．2SSR標(biāo)記的等位基因多樣性???

7、???????????????????173．3秈粳亞種的分化代表著中國(guó)水稻種質(zhì)的群體結(jié)構(gòu)????????????．．17參考文獻(xiàn)??????????????????????????．19致謝????????????????????????????．21附錄????????????????????????????23摘要水稻作為世界上比較重要的糧食作物之一，發(fā)掘控制稻米品質(zhì)優(yōu)異基因并進(jìn)一步用于水稻遺傳育種具有十分重要的意義。本論文以477份水稻材料為研究對(duì)象，構(gòu)建一個(gè)自然變異群體，研究該群體的遺傳多樣性，并深入研究其群體結(jié)構(gòu)。以期以后

8、對(duì)水稻相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析奠定一定的基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下：l、44個(gè)隨機(jī)引物中共擴(kuò)增出186個(gè)等位基因位點(diǎn)，平均每個(gè)位點(diǎn)4．227個(gè)等位基因。各材料間不同位點(diǎn)的等位基因數(shù)大多不等，范圍2(RM6297)．9(RMl235