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《福建省h3n2亞型流感病毒分子流行病學(xué)特征分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號：R373.2學(xué)校代碼：10392學(xué)科專業(yè)代碼：100401學(xué)號：200903215福建醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文福建省H3N2亞型流感病毒分子流行病學(xué)特征分析MolecularEpidemiologicalCharacteristicsofH3N2SubtypeInfluenzaVirusStrainsfromFujianProvince,1996-2011學(xué)位類型：醫(yī)學(xué)碩士所在學(xué)院：公共衛(wèi)生學(xué)院申請人：謝劍鋒學(xué)科、專業(yè)：流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學(xué)導(dǎo)師：嚴延生教授研究起止日期：2010年9月至2012年3月答辯日期：2012年6月7日二○一二年六月萬方數(shù)據(jù)萬方數(shù)據(jù)目錄中文摘要1英
2、文摘要2主要英文縮寫詞3第一部分引言4第二部分流感病毒概述41.流感病毒的結(jié)構(gòu)特點和類型42.流感病毒的命名63.流感病毒基因和功能64.流感病毒的復(fù)制95.流感病毒的抗原性變異96.流感病毒分子流行病學(xué)研究進展10第三部分福建省流感監(jiān)測數(shù)據(jù)分析131.監(jiān)測內(nèi)容和監(jiān)測方法132.監(jiān)測情況132.1流感樣病例報告情況132.2流感病毒分離情況152.3流感樣病例聚集性事件監(jiān)測163.討論17第四部分福建省H3N2亞型流感病毒分子流行病學(xué)特征分析191.材料191.1標本來源191.2主要試劑和用品201.3主要儀器211.4主要溶液配制212.方法222.1MDCK細胞傳代2
3、22.2流感病毒MDCK細胞分離23萬方數(shù)據(jù)2.3流感病毒雞胚接種與收獲232.4紅細胞凝集試驗（HA）242.5制備4個血凝單位抗原252.6紅細胞凝集抑制試驗（HAI）鑒定未知病毒252.7福建省H3N2亞型流感病毒HA1區(qū)基因擴增262.8基因序列拼接和分析比較293.結(jié)果293.1福建省H3N2亞型流感病毒分離鑒定結(jié)果293.2福建省H3N2亞型流感病毒HA1區(qū)基因PCR擴增結(jié)果303.3福建省H3N2亞型流感病毒HA1區(qū)基因測序結(jié)果313.3.1同源性結(jié)果比較323.3.2基因進化樹分析結(jié)果333.3.3氨基酸序列分析結(jié)果364.討論414.1核苷酸和氨基酸同源性
4、與進化樹分析414.2HA1抗原性分析424.3HA1蛋白上二硫鍵和糖基化位點分析444.4疫苗保護效果分析455.結(jié)論46參考文獻48附錄51致謝58萬方數(shù)據(jù)福建省H3N2亞型流感病毒分子流行病學(xué)特征分析摘要為了了解福建省H3N2亞型流感病毒基因進化過程，從分子生物水平上認識其變異特征和規(guī)律，并分析疫苗對福建省人群保護的效果，本次研究對1996~2011年福建省流感監(jiān)測情況進行了描述，同時選用了64株分布于1996~2011年間的福建省H3N2亞型流感毒株來進行分子流行病學(xué)特征研究。首先通過MDCK細胞和雞胚分離的方法來擴容病毒量少的病毒株，采用紅細胞凝集（HA）和紅細胞
5、凝集抑制（HI）試驗來對病毒株進行鑒定和分型，其次通過PCR和測序方法獲得64株H3N2亞型流感病毒HA1區(qū)序列，最后運用生物信息學(xué)和統(tǒng)計學(xué)軟件來分析獲得的序列資料，在此基礎(chǔ)上進行分子流行病學(xué)研究，結(jié)合監(jiān)測數(shù)據(jù)來揭示H3N2亞型流感在福建省的流行規(guī)律和特征。結(jié)果顯示，福建省流感流行存在冬春季和夏季兩個高峰，ILI%的異常增加在一定程度上可以提示流感流行的風(fēng)險。1996~2011年期間，福建省流感流行優(yōu)勢株存在H1N1、H3N2和B型流感之間交替的規(guī)律。福建省1996年以來的H3N2亞型流感病毒基因進化可以分為兩個譜系，1996~2000年譜系和2002~2011年譜系，其進
6、化規(guī)律都是沿著樹枝主干隨著時間推移向上延伸，序列的差異和年代成正比，初步判斷2000~2002年福建省H3N2亞型流感病毒抗原性發(fā)生較大轉(zhuǎn)變。1996年以來福建省H3N2亞型流感病毒HA1區(qū)共計在91個位點出現(xiàn)過變異，其中有25個氨基酸位點變異發(fā)生5個抗原決定簇上；7個變異位點發(fā)生在受體結(jié)合位點（RBS）及其附近；59個變異位點發(fā)生在抗原決定簇和RBS以外的位點，其中13個位點變異涉及年代間流感毒株的轉(zhuǎn)換，值得高度關(guān)注。與WHO推薦疫苗株比較，1996~1999年和2005~2009年疫苗對福建省H3N2亞型流感的保護效果較好，而2000~2004年疫苗保護效果不佳，存在滯
7、后現(xiàn)象。從HA1蛋白結(jié)構(gòu)上分析，1996~2011年潛在糖基化位點有增多的趨勢，而5個二硫鍵位點氨基酸密碼子仍然保守，這均為維持HA蛋白的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定起到重要作用。本次研究較詳細地對1996~2011年福建省H3N2亞型流感病毒進行分子流行病學(xué)分析，闡明了HA1基因的特征和進化情況，結(jié)合福建省流感日常監(jiān)測可為我省流感流行的預(yù)測、傳染源追蹤、疫苗篩選和流感防控提供科學(xué)依據(jù)，同時為今后進一步開展流感分子生物學(xué)研究奠定重要基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：流感；H3N2亞型；HA1基因；進化；分子流行病學(xué)1萬方數(shù)據(jù)MolecularEpidem
