鯉連鎖圖譜及生長、肉質(zhì)性狀qtl定位研究

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1、學(xué)校代碼：10264研究生學(xué)號：D090101013上上上海海海海海海海海洋洋洋洋大大大大學(xué)學(xué)學(xué)學(xué)博博士學(xué)位論文博士學(xué)位論文題題題題目目目目：：：：鯉連鎖圖譜及生長、肉質(zhì)性狀QTL定位研究GeneticLinkageMapandQTLAnalysisof英文題目英文題目：英文題目：：：Growth-relatedandMeatQualityTraitsinCommonCarp專專專專業(yè)業(yè)業(yè)業(yè)：：：：水產(chǎn)養(yǎng)殖研究方向研究方向：研究方向：：：水產(chǎn)生物技術(shù)與遺傳育種姓姓姓姓名名名名：：：：鄭先虎指導(dǎo)教師指導(dǎo)

2、教師：指導(dǎo)教師：：：孫效文研究員二二二O一一一二一二二二年年年年五五五五月月月月上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：我恪守學(xué)術(shù)道德，崇尚嚴(yán)謹(jǐn)學(xué)風(fēng)。所呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)明確注明和引用的內(nèi)容外，本論文不包含任何其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品及成果的內(nèi)容。論文為本人親自撰寫，我對所寫的內(nèi)容負(fù)責(zé)，并完全意識到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名：日期：年月日上海海洋大學(xué)

3、學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱或借閱。本人授權(quán)上海海洋大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密□，在年解密后適用本版權(quán)書。本學(xué)位論文屬于不保密□學(xué)位論文作者簽名：指導(dǎo)教師簽名：日期：年月日日期：年上海海洋大學(xué)博博士學(xué)位論文博士學(xué)位論文答辯委員會成員名單姓名工作單位職稱備注嚴(yán)云勤東北農(nóng)業(yè)大學(xué)教授主席孫中武東

4、北林業(yè)大學(xué)教授委員滕春波東北林業(yè)大學(xué)教授委員梁利群黑龍江水產(chǎn)研究所研究員委員尹家勝黑龍江水產(chǎn)研究所研究員委員張曉峰黑龍江水產(chǎn)研究所副研究員秘書答辯地點(diǎn)黑龍江水產(chǎn)研究所答辯日期2012-05-25鯉連鎖圖譜及生長、肉質(zhì)性狀QTL定位研究摘要鯉（Cprinuscarpio）作為世界性的養(yǎng)殖魚類，以年產(chǎn)340萬噸，約占全球淡水養(yǎng)殖魚類產(chǎn)量的14%，而在世界水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)占據(jù)重要地位。鯉也是我國主要養(yǎng)殖魚類，同時(shí)也是培養(yǎng)出品種最多的水產(chǎn)養(yǎng)殖種，養(yǎng)殖歷史悠久，養(yǎng)殖產(chǎn)量高，在過去的幾十年里大大促進(jìn)了我國水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)

5、展，極大的滿足了人們對動物蛋白的需求。但隨著人們消費(fèi)水平的提高，對水產(chǎn)品質(zhì)量的需求已超過了對數(shù)量的需求。改善肉質(zhì)不僅是畜禽行業(yè)面臨的問題，也是水產(chǎn)行業(yè)不得不面臨的問題。因此，對鯉肌肉品質(zhì)性狀進(jìn)行選育是十分必要的。魚類的肌肉品質(zhì)是十分復(fù)雜的性狀，受養(yǎng)殖環(huán)境、營養(yǎng)飼料等因素影響較大。傳統(tǒng)的育種手段無法有效解決低遺傳力性狀的改良問題，分子育種技術(shù)的出現(xiàn)使我們對這類性狀的選育成為了可能。在魚類的分子標(biāo)記育種中，要對特定的性狀進(jìn)行選育，一個(gè)首要的前提是獲得控制該性狀發(fā)育的基因，或者是控制性狀發(fā)育的QTL位點(diǎn)?？?/p>

6、以認(rèn)為遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及性狀的QTL定位是進(jìn)行分子標(biāo)記育種的前提。自2000年第一張鯉遺傳圖譜問世以來，鯉分子育種工作取得了較快的發(fā)展，目前已經(jīng)構(gòu)建了鯉的第三代連鎖圖譜，獲得了一大批生長、飼料轉(zhuǎn)化率和生理生化等性狀的QTL結(jié)果。但早期的圖譜采用的標(biāo)記大都為顯性標(biāo)記（如RAPD、AFLP等）和少量的微衛(wèi)星標(biāo)記，圖譜的標(biāo)記少，圖距大，分辨率和覆蓋率大都較低，其利用率十分有限。本論文從兩個(gè)方面出發(fā)，第一，利用高分辨率的SNP標(biāo)記構(gòu)建鯉的整合圖譜及與斑馬魚基因組的比較圖譜；利用整合圖譜進(jìn)行多群體QTL比較分

7、析。第二，利用全同胞家系進(jìn)行脂肪酶活力、肌肉脂肪含量、肌肉蛋白含量、灰分等肉質(zhì)性狀的QTL定位研究。具體研究結(jié)果如下：1、采用1536個(gè)SNP標(biāo)記和300個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，對3個(gè)群體的父母本及443個(gè)子代進(jìn)行基因型分析，構(gòu)建連鎖圖譜，并與實(shí)驗(yàn)室先前構(gòu)建的圖譜（68群體）進(jìn)行整合。得到的整合圖譜包含678個(gè)標(biāo)記（421個(gè)SNP和257個(gè)微衛(wèi)星），分布于42個(gè)連鎖群上，圖譜長度為2371.6cM，圖譜覆蓋率為86.7%，標(biāo)記間平均間隔為3.7cM，連鎖群平均標(biāo)記為16個(gè)，連鎖群長度范圍3.2-201.0cM，

8、標(biāo)記范圍為3-41個(gè)，連鎖群平均間隔為1.4-24.1cM，連鎖群內(nèi)標(biāo)記最大間隔為1.7-43.7cM。2、將整合圖譜的標(biāo)記序列與5種模式魚的基因組進(jìn)行比對，其同源標(biāo)記分別I為斑馬魚（Daniorerio）72.9%（489/671）、紅鰭東方鲀（Takifugurubripes）30.6%（205/671）、黑青斑河豚（Tetraodonnigroviridis）28.9%（194/671）、青鳉（Oryziaslatips）25.2%（169/671