資源描述：
《基于全基因組的玉米lbd轉(zhuǎn)錄因子家族分析及密碼子使用模式分析》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、ShandongAgriculturalUniversityPh．D·DISSERTATIONGenome-wideAnalysisofLBD(LATERALORGANBOUNDARIESDomain)GeneFamilyandCodonUsagePatternsinZeamaysDepartment：College．ofLifeSciencesMajor：BiochemistryandMolecularBiologyPh．D．Candidate：ZhangYueminSupervisor：ZhengChengc
2、hao一June1st，2014＼嘲燃關(guān)于學(xué)位論文原創(chuàng)性和使用授權(quán)的聲明本人所呈交的學(xué)位論文，是在導(dǎo)師指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行科學(xué)研究所取得的成果。對(duì)在論文研究期間給予指導(dǎo)、幫助和做出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人或集體，均在文中明確說(shuō)明。本聲明的法律責(zé)任由本人承擔(dān)。本人完全了解山東農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留和使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留和按要求向國(guó)家有關(guān)部門(mén)或機(jī)構(gòu)送交論文紙質(zhì)本和電子版，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)山東農(nóng)業(yè)大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文和匯編本學(xué)位論文，
3、同時(shí)授權(quán)中國(guó)科學(xué)技術(shù)信息研究所將本學(xué)位論文收錄到《中國(guó)學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù)》，并向社會(huì)公眾提供信息服務(wù)。保密論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定。論文作者簽名：導(dǎo)師簽名：日期：符號(hào)說(shuō)明BLAST：theBasicLocalAlignmentSearchTool，blast序列比對(duì)GWD：genome一、Ⅳideduplication，基因組復(fù)制mn廈：HiddenMarkovModel，隱馬爾科夫模型LOB：LATERALORGANBOUNDARIES，側(cè)生器官分化LBD：LATERALORGANBOUNDARIESDomam
4、，側(cè)生器官分化結(jié)構(gòu)域MEGA：MolecularEvolutionaryGeneticsAnalysis，分子進(jìn)化遺傳分析MUSCEL：MultipleSequenceComparisonbyLog-Expectation，多序列比對(duì)NJ：theneighbor-joiningtree，臨接樹(shù)SMART：SimpleModularArchitectureResearchTool，簡(jiǎn)單的模塊化體系結(jié)構(gòu)研究工具TF：transcriptionfactor,轉(zhuǎn)錄因子Pfam：Proteinfamily,基因家族GSDS
5、，GeneStructureDisplayServeL基因結(jié)構(gòu)繪制工具．NCBI：NationalCenterforBiotechnologyInformation，美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心ORF：OpenReadingFrame，開(kāi)放閱讀框TAIR：TheArabidopsisInformationResource，擬南芥信息數(shù)據(jù)庫(kù)qRT-PCR：real．timequantitativeRT-PCR，熒光定量PCRRSCU：RelativeSynonymousCodonusage，密碼子相對(duì)使用度目錄中文摘要
6、????????????????????????????????．1Abstract???????????????????????????????????????????·31前言????????????????????????????????????????????61．1玉米基因組學(xué)研究進(jìn)展????????????????????????”61．I．1玉米基因組基本信息?????????????????????????61．1．2比較基因組學(xué)研究進(jìn)展????????????????????????81．1．3
7、玉米基因家族研究進(jìn)展????????????????????????91．1．4玉米生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)資源?????????????????????-111．2LBD轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展????????????????????????121．2．1高等植物L(fēng)BD轉(zhuǎn)錄因子家族研究進(jìn)展?????????????????121．2．2LBD轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)域特征?????????????????????·131．2．3LBD基因的功能??????????????????????????”141．3密碼子使用模式????????
8、???????????????????181．3．1遺傳密碼基本特征?????????????????????????·l91．3．2同義密碼子使用模式????????????????????????·191．3．3同義密碼子研究方法????????????????????????·211．3．4同義密碼子分析常用的生物信息學(xué)資源????????????????·241．
