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《致病疫霉中致病相關(guān)mirna的挖掘及功能分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、碩士學(xué)位論文致病疫霉中致病相關(guān)miRNA的挖掘及功能分析IdentificationandFunctionalAnalysisofPathogenicmicroRNAsinPhytophthoroinfestans學(xué)21118075完成日期：2Q!壘生壘月大連理工大學(xué)DalianUniversityofTechnology
2、JIlllJlllJlllIJlllllllrrlllllllllllJllJY2592086大連理工大學(xué)學(xué)位論文獨創(chuàng)性聲明作者鄭重聲明：所呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下進(jìn)行研
3、究工作所取得的成果。盡我所知，除文中已經(jīng)注明引用內(nèi)容和致謝的地方外，本論文不包含其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表的研究成果，也不包含其他已申請學(xué)位或其他用途使用過的成果。與我一同工作的同志對本研究所做的貢獻(xiàn)均已在論文中做了明確的說明并表示了謝意。學(xué)位論文題目：絲塑塑鍪之絲壟塑堡圭=堅絲塑墮至望堡蘭壘作者簽名：豸至籩硇日期：壟!!年—互月—t日大連理工大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要microRNA(miRNA)是一類長約22nt的非編碼小RNA分子，參與真核生物的生長發(fā)育和脅迫響應(yīng)等過程。近年來，越來越多的研究表明，miRN
4、A在病原物與植物互作過程中起著重要的調(diào)節(jié)作用。致病疫霉(Phytophthorainfestans)可侵染番茄和馬鈴薯，造成嚴(yán)重的晚疫病，該病發(fā)生面廣，影響甚大。但是，致病疫霉中miRNA的研究甚少，更沒有與致病相關(guān)miRNA的挖掘報道?；谏鲜鰻顩r，本研究利用生物信息學(xué)方法，系統(tǒng)地預(yù)測了致病疫霉中致病相關(guān)的miRNA，并通過生物學(xué)實驗驗證了它們的功能。首先，借助計算機數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)，共計預(yù)測到128個致病相關(guān)的miRNA，它們隸屬于66個miRNA家族。通過致病相關(guān)miRNA關(guān)系網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建，初步篩選到能
5、形成網(wǎng)絡(luò)的33個miRNA家族。分別挑選位于網(wǎng)絡(luò)核心和邊緣的各2個miRNA進(jìn)行檢測，順利地驗證到了pi．miR466和pi．miRl918。其次，通過實時定量分析pi．miR466和pi．miRl918的表達(dá)特性，發(fā)現(xiàn)二者的表達(dá)量均在致病疫霉處理番茄后的第二天變化明顯，說明它們是致病相關(guān)的miRNA，可能在致病疫霉的致病過程中發(fā)揮著重要作用。最后，以擬南芥miRl59a的前體為骨架序列，成功地構(gòu)建了amiR466表達(dá)載體及番茄葉片瞬時表達(dá)體系。過表達(dá)miR466可抑制晚疫病的發(fā)生，提高番茄的抗性。本研
6、究首次系統(tǒng)地預(yù)測并驗證了致病疫霉中致病相關(guān)的miRNA，為闡明病原物與植物互作的分子機制奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：miRNA；致病疫霉；番茄；生物信患學(xué)；病原物與植物互作致病疫霉中致病相關(guān)miRNA的挖掘及功能分析IdentificationandFunctionalAnalysisofPathogenicmicroRNAsinPhytophthorainfestansAbstractBeingonel(indofapproximately22ntlongsmallRNAs．microRNAs(miRNAs)
7、haveshowntheirpivotalrolesinbothgrowthdevelopmentandstressresponses．Inrecentyears，moreandmoreresearcheshaveshownthatmiRNAsparticipateinregulatingtheprocessofpathogenandplantinteractions．Phytophthorainfestans(尸．infestans)isamajorpathogenthatcausesdevastat
8、inglateblightofpotatoandtomato．However，therehavebeenfewsystematicresearchesonmiRNAsinP．infestans，letaloneresearchesonpathogenicmiRNAs．Basedontheabove，byusingbioinformaticstrategies，wecomprehensivelypredictedandidentifiedpathogenicmiRNAsthatmayexistin尸．in
9、festans．Then，weanalysedthefunctionofpathogenicmiRNAinP．infestans,viamolecularbiologyexperiment．First，atotalof128putativemiRNAsbelongingto66miRNAfamilieswereidentifiedbybioinformaticapproaches．33vitalpathogenicmiRNAswerescr
