資源描述:
《弓背青鳉線粒體DNA遺傳多樣性分析.pdf》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文弓背青鳉線粒體DNA遺傳多樣性分析摘要弓背青鳉(Oryziascurvinotus)隸屬怪頜鳉科(Adrianichthyidae),青鳉屬(Oryzias),是一種廣鹽性、廣溫性、產(chǎn)卵量大、世代周期短及易于在實(shí)驗(yàn)室飼養(yǎng)的小型魚(yú)類。弓背青鳉(O.curvinotus)是南方沿海分布的土著魚(yú)類,與同屬中研究最為清晰的日本青鳉(Oryziaslatipes)親緣關(guān)系密切,且都具有XX-XY性別控制系統(tǒng),具有極好的理論研究?jī)r(jià)值。對(duì)弓背青鳉(O.curvinotus)生態(tài)學(xué)調(diào)查及其線粒體DNA遺傳多樣性分析,豐富了其生物學(xué)背景研究,為發(fā)展弓
2、背青鳉(O.curvinotus)為模式生物的研究提供支撐。具體研究結(jié)果主要包括五部分:1.弓背青鳉(O.curvinotus)的生態(tài)學(xué)調(diào)查水的理化指標(biāo):鹽度范圍為0.14-33.57;水溫范圍為9.58-40.9℃;pH值范圍為7.2-9.38;溶解氧的范圍為2.11-17.12ppm。弓背青鳉(O.curvinotus)棲息生境特征是:生活在水流平緩并有植物的水域中,一旦食蚊魚(yú)(Gambusiaaffinis)發(fā)展成為優(yōu)勢(shì)種,弓背青鳉(O.curvinotus)的數(shù)量將大大減少。2.鹽度對(duì)弓背青鳉(O.curvinotus)受精卵孵化的影響粵西高橋地區(qū)
3、弓背青鳉(O.curvinotus)的受精卵在淡水到45鹽度范圍內(nèi)均可孵化,在25鹽度時(shí),受精卵的孵化率最高;在20鹽度時(shí),受精卵的孵化周期、培育周期均最長(zhǎng),而低鹽度(0-10)和高鹽度(40-45)周期相對(duì)較短。3.弓背青鳉(O.curvinotus)遺傳性別鑒定開(kāi)發(fā)了1對(duì)可以快速、準(zhǔn)確鑒定弓背青鳉(O.curvinotus)遺傳性別的引物,該對(duì)引物通過(guò)PCR擴(kuò)增和瓊脂糖凝膠電泳可以判定檢測(cè)個(gè)體的遺傳性別,雄性個(gè)體(XY)可以擴(kuò)增出959bp和656bp2條條帶,而雌性個(gè)體(XX)只能擴(kuò)增出1條656bp條帶。4.弓背青鳉(O.curvinotus)線粒
4、體基因組全序列測(cè)定與系統(tǒng)進(jìn)化分析測(cè)定并注釋了弓背青鳉(O.curvinotus)線粒體基因組全序列,結(jié)果表明,弓背青鳉(O.curvinotus)線粒體基因組序列全長(zhǎng)為16676bp,基因排列和構(gòu)成與其他硬骨魚(yú)大體一致,包含37個(gè)基因和1個(gè)控制區(qū)。13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,除了COⅠ基因以GTG為起始密碼子外,其余編碼蛋白基因均以ATG為起始密碼子。22個(gè)tRNA基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)均呈典型的三葉草狀?;?種青鳉屬(Oryzias)魚(yú)類線粒體基因組全序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)表明,弓背青鳉(O.curvinotus)與呂宋青鳉(Oryziasluzonensis)的親緣關(guān)系
5、比較近。5.基于COⅠ基因與D-loop區(qū)的南方沿海弓背青鳉(O.curvinotus)遺傳多樣性I弓背青鳉線粒體DNA遺傳多樣性分析分析基于mtDNACOⅠ基因分析結(jié)果:136條COⅠ基因序列(579bp)中,共發(fā)現(xiàn)77個(gè)變異位點(diǎn),堿基轉(zhuǎn)換/顛換比值(TS/TV)為5.42;平均核苷酸差異數(shù)、核苷酸多樣性、單倍型多樣性及單倍型數(shù)分別為9.709、0.01677、0.967、52;AMOVA分析揭示遺傳差異主要發(fā)生在群體間;基于COⅠ基因序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)絕大多數(shù)個(gè)體按照采樣點(diǎn)進(jìn)行聚類。基于mtDNAD-loop分析結(jié)果:141條D-loop區(qū)序列(507b
6、p)中,共檢測(cè)到37個(gè)變異位點(diǎn),堿基轉(zhuǎn)換/顛換比值(TS/TV)為2.79;平均核苷酸差異數(shù)、核苷酸多樣性、單倍型多樣性及單倍型數(shù)分別為2.923、0.00577、0.911、29;AMOVA分析揭示遺傳差異主要發(fā)生在群體間;基于D-loop區(qū)構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù),多數(shù)個(gè)體沒(méi)能按照采樣點(diǎn)進(jìn)行聚類。研究表明,弓背青鳉(O.curvinotus)線粒體COⅠ基因比D-loop區(qū)具有更多的信息位點(diǎn),更適合用于弓背青鳉(O.curvinotus)的遺傳多樣性研究。根據(jù)COⅠ基因和D-loop區(qū)序列檢測(cè)群體遺傳多樣性的結(jié)果,南方沿海弓背青鳉(O.curvinotus)群體的
7、遺傳多樣性高,群體經(jīng)歷過(guò)群體擴(kuò)張事件,遺傳結(jié)構(gòu)分化明顯,因此需要?jiǎng)澏ūWo(hù)單元。關(guān)鍵詞:弓背青鳉;線粒體;遺傳多樣性II廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文GeneticDiversityAnalysisofMitochondrialDNAinOryziascurvinotusAbstractOryziascurvinotusbelongstotheorderofAdrianichthyidae,Oryzias,whichisbroad-salinity,widetemperature,strongtolerancetohypoxia,largeamountofeggs
8、laid,shortgenerationcycles,andeas