上海地區(qū)兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究

上海地區(qū)兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究

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1、萬(wàn)方數(shù)據(jù)碩士學(xué)位論文上海地區(qū)兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究姓名:盧麗娟學(xué)科:臨床檢驗(yàn)診斷學(xué)導(dǎo)師:徐錦研究員導(dǎo)師小組成員:林勇副主任技師周丹秋副主任技師萬(wàn)方數(shù)據(jù)目錄中文摘要?????????????????????????????一1英文摘要?????????????????????????????一4第一部分上海地區(qū)住院腹瀉兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究?????12研究對(duì)象與方法????????????????????????12結(jié)果????????????????????????????????????

2、??..16討{念??????????????????????????????????????..30第二部分上海地區(qū)門(mén)診腹瀉兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究?????37研究對(duì)象與方法????????????????????????37結(jié)果??????????????????????????????????????..37討j念??????????????????????????????????????一46結(jié)論?????????????????????????????????????????.49參考文獻(xiàn)

3、?????????????????????????????50附錄一綜述???????????????????????????67附錄二研究生期間發(fā)表的論文???????????????????80致謝?????????????????????????????????????????.81萬(wàn)方數(shù)據(jù)復(fù)旦大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要上海地區(qū)兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究中文摘要目的監(jiān)測(cè)并分析上海地區(qū)住院和門(mén)診腹瀉兒童四種腹瀉病毒的分子流行病學(xué)特點(diǎn),以全面了解及客觀評(píng)估腹瀉病毒在兒童腹瀉發(fā)病中的作用,為腹瀉的防治和相

4、關(guān)疫苗的開(kāi)發(fā)應(yīng)用提供基本數(shù)據(jù)和理論依據(jù)。方法收集2006年1月至2011年12月在復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院住院的腹瀉兒童(年齡S5歲)糞便標(biāo)本674份,并收集2010年7月至2011年12月在復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院門(mén)診就診的腹瀉兒童(年齡S5歲)糞便標(biāo)本436份。采用RT-PCR方法檢測(cè)糞便標(biāo)本中的輪狀病毒(Rotavims,1w)、杯狀病毒(Humancalicivirus,HuCV)、星狀病毒(Humanastrovims,HAstV)及腺病毒(Adenovims,AdV)。采用引物分型的方法確定RV的基因型

5、別,采用基因測(cè)序和進(jìn)化樹(shù)分析的方法確定諾如病毒(Norovirus,NV)、札幌病毒(Sapovirus,SaV)、HAstV和AdV的基因型別。采用SPSSl6.0統(tǒng)計(jì)分析軟件對(duì)研究結(jié)果和臨床資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果一、2006.2011年住院腹瀉兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究結(jié)果如下:1.腹瀉病毒的總檢出情況:四種腹瀉病毒的總檢出率為92.1%(621/674),RV、HuCV、HAstV及AdV的總檢出率分別為89.2%(601/674)、30.6%(206/674)、30.1%(203/674)及4.

6、7%(32/674)。腹瀉兒童單一病毒感染的總檢出率為43.5%(293/674),并以RV的單獨(dú)感染為主,其他三種病毒單獨(dú)感染的總檢出率均<2%。腹瀉兒童多重病毒感染的總檢出率為48.6%(328/674),2006.2011年病毒混合感染的檢出率呈下降趨勢(shì),2011年降為11.7%。多重混合感染中,以RV+HAstV、RV+HuCV及R.V+HuCV+HAstV混合感染的檢出為主。2.院內(nèi)和非院內(nèi)感染腹瀉兒童腹瀉病毒的檢出:院內(nèi)感染引起腹瀉者占50.8%(302/626),以2009年(60.6%)和2

7、008年(60.5%)最多,2011年降至24.5%。非院內(nèi)感染腹瀉者單一病毒的總檢出率(47.8%,147/308)顯著高于院內(nèi)感染腹瀉者(38.1%,121/318)(尸<0.05),單一病毒的感染均以RV為主。院內(nèi)感染腹瀉者感染多重腹瀉病毒的總檢出率(56.9%,181/318)顯著高于非院內(nèi)感染者(42.9%,132/308)(尸<0.05),且均以RV+HAstV及RV+HuCV的混合感染為主。3.RV基因型:①G基因型:雖2006.2011年G基因型以G3型為主,但G3型的流行呈波動(dòng)性下降趨勢(shì),

8、由2006年的64.6%降為2011年的12.8%,而G9和G1型的流行呈上升趨勢(shì),且G9型(51.1%)成為2011年最主要的流行型別,G1型(19.1%)為當(dāng)年的次要流行型別。2006.2011年G混合基因型所占比例為10.3%(62/601),萬(wàn)方數(shù)據(jù)復(fù)旦大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要混合的G基因型種類(lèi)較多,以G1、G3及G9型的兩兩混合為主。②P基因型:2006.2011年P(guān)基因型以P[4】、P[8】及P混合型

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