吉林省豬流感病毒的分離鑒定及分離株ha、na基因序列分析

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1、分類號(hào)：Q93單位代碼：10193密級(jí)：公開學(xué)號(hào)：2012085碩士學(xué)位論文吉林省豬流感病毒的分離鑒定及分離株HA、NA基因序列分析IsolationandidentificationofswinefluvirusinJilinProvinceandIsolatesHA,NAgenesequenceanalysis作者姓名：李雪嬌學(xué)位類別：理學(xué)碩士專業(yè)名稱：微生物研究方向：病原微生物指導(dǎo)教師：張文慧副教授所在學(xué)院：生命科學(xué)院2015年5月獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行研究所取得的成果。盡我所知，除文中特別加以標(biāo)注和致謝所列內(nèi)容外，論文中不包含其

2、他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的研究成果，也不包含為獲得吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過(guò)的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示了謝意。本學(xué)位論文所有內(nèi)容若有不實(shí)之處，本人愿意承擔(dān)一切相關(guān)法律責(zé)任和后果。學(xué)位論文作者簽名：簽字日期：年月日關(guān)于學(xué)位論文使用授權(quán)的聲明1、本人完全了解吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留和使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：研究生在校攻讀學(xué)位期間所完成的論文及相關(guān)成果的知識(shí)產(chǎn)權(quán)屬吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)所有，并同意將本論文的版權(quán)授權(quán)給吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)，學(xué)校有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存

3、、匯編學(xué)位論文。2、本人（同意/不同意，務(wù)必打印后填寫）吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)將本論文版權(quán)授權(quán)給不同媒體進(jìn)行電子出版、多媒體出版、網(wǎng)絡(luò)出版以及其他形式出版（涉密學(xué)位論文解密后應(yīng)遵守此協(xié)議）。3、本人聲明畢業(yè)后若發(fā)表在攻讀研究生學(xué)位期間完成的論文及相關(guān)的學(xué)術(shù)成果，必須以吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)作為第一署名單位。學(xué)位論文作者簽名：簽字日期：年月日指導(dǎo)教師簽名：簽字日期：年月日吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要摘要本研究對(duì)吉林地區(qū)采集到的豬血清樣本7909份、鼻拭子及疑似發(fā)病死亡豬只的肺臟、支氣管等病料5154份，總計(jì)13063份樣本進(jìn)行了病毒分離，并且對(duì)分離到的毒株進(jìn)行亞型鑒定。結(jié)果顯示分離到的三株豬流感病毒均為

4、H1N1亞型豬流感病毒，根據(jù)流感病毒命名標(biāo)準(zhǔn)體系分別命名為A/swine/Jilin/1-1/2011、A/swine/Jilin/1-2/2011和A/swine/Jilin/1-3/2011。對(duì)分離株HA、NA基因進(jìn)行克隆和遺傳進(jìn)化分析?；驕y(cè)序結(jié)果表明，SIV分離株A/swine/Jilin/1-1/2011(H1N1)的HA基因序列全長(zhǎng)為1638個(gè)核苷酸，編碼區(qū)為40-1636bp，編碼532個(gè)氨基酸。NA基因序列全長(zhǎng)為1420個(gè)核苷酸，編碼區(qū)為4-1413bp，編碼470個(gè)氨基酸；分離株A/swine/Jilin/1-2/2011(H1N1)的HA基因序列全長(zhǎng)為1703個(gè)

5、核苷酸，編碼區(qū)為26-1556bp，編碼510個(gè)氨基酸。NA基因序列全長(zhǎng)為1404個(gè)核苷酸，編碼區(qū)為30-1397bp，編碼456個(gè)氨基酸；分離株A/swine/Jilin/1-3/2011(H1N1)的HA基因序列全長(zhǎng)為1745個(gè)核苷酸，編碼區(qū)為17-1722bp，編碼568個(gè)氨基酸。NA基因序列全長(zhǎng)為1458個(gè)核苷酸，編碼區(qū)為21-1430bp，編碼470個(gè)氨基酸。裂解位點(diǎn)顯示三株均為低致病性毒株，糖基化位點(diǎn)均未發(fā)生變異相對(duì)保守，受體結(jié)合位點(diǎn)顯示分離株具有感染禽源的潛力，NA基因耐藥性位點(diǎn)顯示這三株豬流感病毒對(duì)目前使用的神經(jīng)氨酸酶抑制劑類藥物均有效。遺傳進(jìn)化分析結(jié)果顯示A/sw

6、ine/Jilin/1-1/2011和A/swine/Jilin/1-2/2011的HA和NA基因來(lái)源于野禽，與禽流感病毒的親緣關(guān)系較近。其中，A/swine/Jilin/1-1/2011和A/swine/Jilin/1-2/2011的HA基因分別與韓國(guó)2004年分離到的A/wildduck/Korean/SH60/2004的H1N1亞型流感病毒和2005年中國(guó)河北分離到的A/duck/Hebei/843/2005的H1N2亞型流感病毒親緣關(guān)系最近。同時(shí)，這兩個(gè)病毒株的NA基因都與2003年中國(guó)東部的分離到的A/duck/EasternChina/103/2003和A/duck/E

7、asternChina/152/2003的H1N1亞型流感病毒親緣關(guān)系最近。與以上兩個(gè)病毒株明顯不同的是，A/swine/Jilin/1-3/2011的HA和NA基因則主要來(lái)自于人流感病毒和豬流感病毒，其中HA基因與中國(guó)山東、上海、廣東、廣西等地發(fā)現(xiàn)的H1N1病毒亞型親緣關(guān)系最近，NA基因與中國(guó)山東、上海、廣東等地發(fā)現(xiàn)的H1N1病毒亞型有明顯的親緣關(guān)系。關(guān)鍵詞：豬流感病毒H1N1亞型分離鑒定遺傳進(jìn)化III吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文AbstractAbstractInth