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《藏綿羊dqa和dqb座位基因克隆、表達及其適應性進化研究》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在學術論文-天天文庫。
1、分類號密級UDC單位代碼10733甘肅農業(yè)大學博士學位論文藏綿羊DQA和DQB座位基因克隆、表達及其適應性進化研究TheDQAandDQBgenescloning,expressionandAdaptionEvolutionAnalysisfortheTibetansheep劉秀指導教師姓名羅玉柱教授(甘肅農業(yè)大學蘭州730070)學科專業(yè)名稱動物遺傳育種與繁殖研究方向動物育種理論與技術論文答辯日期2015年5月28日學位授予日期2015年6月答辯委員會主席王建林教授評閱人張紅平教授陳斌教授呂麗華教授2015年6月ThesisforD
2、octoralDissertationTheDQAandDQBgenescloning,expressionandAdaptionEvolutionAnalysisfortheTibetansheepLiuXiuSupervisor:Prof.LuoYuzhuMajor:AnimalGeneticsBreedingandReproductionResearchField:AnimalBreedingTheoryandApplicationCollegeofAnimalScience&TechnlgyGansuAgriculturalU
3、niversityLanzhou,730070,P.R.ChinaJune,2015甘肅農業(yè)大學2015屆博士學位論文本研究由以下科研項目資助完成:國家自然科學基金項目(編號:31260546)TheNationalNaturalScienceFoundationofChina國家國際科技合作專項(編號:2011DFG33310)TheInternationalScienceandTechnologyCooperationProgramofChina國家科技支撐計劃項目(編號:2012BAD13B05)TheNationalKeyTe
4、chnologyResearchandDevelopmentProgramofChina甘肅省創(chuàng)新研究群體計劃項目(編號:1210RJIA005)TheProgramforCreativeResearchGroupsofGansuProvince甘肅農業(yè)大學2015屆博士學位論文摘要藏綿羊是中國最古老的綿羊品種之一,主要分布在海拔2500m以上的青藏高原及其毗鄰的高寒牧區(qū),是青藏高原的主要畜種資源,也是當?shù)厝嗣袢罕姷闹饕詈蜕a資料。由于近年來自然和人工因素的影響,藏綿羊的生產性能、抗病及抗逆等高原適應特性呈現(xiàn)一定程度的下降趨勢。因
5、此,開展藏綿羊的遺傳多樣性及其不同地理生態(tài)群體所采取的適應性進化機制研究對藏綿羊的保護利用和種質創(chuàng)新以及遺傳改良是十分必要的。主要組織相容性復合體(MHC)是脊椎動物中與機體免疫系統(tǒng)具有重要作用的功能基因家族之一,其所編碼的MHC分子具有遞呈抗原并觸發(fā)免疫反應以及維持機體世代適應環(huán)境變化的能力和功能,也是研究脊椎動物適應性進化研究的最佳遺傳標記。本研究以5個藏綿羊生態(tài)群體(甘肅3個群體和青海2個群體)為研究對象,克隆測定藏綿羊DQA和DQB座位基因序列并進行生物信息學分析,采用實時熒光定量PCR技術檢測DQA1、DQA2、DQB1和D
6、QB2基因mRNA在18月齡甘南藏綿羊背最長肌等17個組織中的相對表達量,以及利用PCR-SSCP技術分析DQA1、DQA2、DQB1和DQB2基因遺傳特征,以期揭示其與藏綿羊高原適應性進化的機制。主要研究結果及結論如下:1.藏綿羊DQA和DQB座位基因克隆測序及生物信息學分析(1)藏綿羊DQA1和DQA2基因CDS區(qū)片段長度為768bp,編碼255個氨基酸,蛋白質分子質量分別為28.23KD和29.83KD,理論等電點(PI)分別為5.20和4.76。生物信息學預測發(fā)現(xiàn)DQA座位的2個基因蛋白都屬分泌蛋白,且都具有較強的親水性,主要
7、分布在內質網(wǎng)、高爾基體和細胞膜中;在2個基因蛋白中共發(fā)現(xiàn)了27個磷酸化位點,但未發(fā)現(xiàn)糖基化位點;預測還發(fā)現(xiàn),在DQA蛋白中存在3個結構域和1個跨膜結構域;二級結構是以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主的混合型;基于氨基酸序列進行的進化分析,其與牛、山羊、馬等物種的同源性較低,與其親緣關系的遠近一致。(2)藏綿羊DQB1和DQB2基因CDS區(qū)片段長度為786bp,編碼261個氨基酸,蛋白質分子質量分別為29.91KD和30.05KD,理論等電點(PI)分別為5.52I甘肅農業(yè)大學2015屆博士學位論文和8.83。DQB座位的2個基因蛋白都屬分泌蛋
8、白,且都具有較強的親水性,主要存在于細胞外、細胞膜和內質網(wǎng)中;在2個基因蛋白中共發(fā)現(xiàn)了38個磷酸化位點和4個糖基化位點;預測還發(fā)現(xiàn),在DQB蛋白中存在4個結構域和2個跨膜螺旋區(qū)域;二級結構是以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主的混