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《大菱鲆微衛(wèi)星標(biāo)記的群體分析及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、學(xué)校代碼：10264研究生號：M120150343上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文大菱鲆微衛(wèi)星標(biāo)記的群體分析及遺傳連鎖題目：圖譜的構(gòu)建PopulationAnalysisofMicrosatelliteMarkers英文題目：andConstructionofGeneticLinkageMapforTurbot(ScophthatmusmaximusL.)專業(yè)：漁業(yè)研究方向：魚類遺傳育種姓名：王廣寧指導(dǎo)教師：馬愛軍研究員二O一五年五月二十六日上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：我恪守學(xué)術(shù)道德，崇尚嚴謹學(xué)風(fēng)。所呈交的學(xué)位論文
2、，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下，獨立進行研宄工作所取得的成果。除文中己經(jīng)明確注明和引用的內(nèi)容外，本論文不包含任何其他個人或集體己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品及成果的內(nèi)容。論文為本人親自撰寫，我對所寫的內(nèi)容負責(zé)，并完全意識到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名:日期年<月/7>日上海海洋大學(xué)學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱或借閱。本人授權(quán)上海海洋大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保
3、存和匯編本學(xué)位論文。保密□，在年解密后適用本版權(quán)書。本學(xué)位論文屬于不保密d學(xué)位論文作者簽名：3-T3指導(dǎo)教師簽名：jI#曰期:1月/陽曰期：年^?月丨^曰大菱鲆微衛(wèi)星標(biāo)記的群體分析及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建學(xué)位論文完成日期:指導(dǎo)教師簽字:答辯委員會成員簽字:3前i上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文大菱鲆微衛(wèi)星標(biāo)記的群體分析及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建摘要大菱鲆是當(dāng)前我國水產(chǎn)養(yǎng)殖中主要的經(jīng)濟品種之一，為社會產(chǎn)生了巨大的經(jīng)濟效益。實驗對大菱鲆的遺傳育種進行了研究。為開發(fā)大菱鲆的EST-SSR標(biāo)記，通過建立cDNA文庫和測序重組，對大菱鲆轉(zhuǎn)錄組進行了微衛(wèi)星序列分析和初步的篩選
4、。測序后得到了71107條Unigene，從中篩選到39430處含SSR序列，其中含有單堿基重復(fù)序列18013條，二堿基重復(fù)序列8388條，三堿基重復(fù)序列8241條，四堿基重復(fù)序列1518條，五堿基重復(fù)序列1848條，六堿基重復(fù)序列1197條，七堿基重復(fù)序列225條。有4251處SSR序列是可以設(shè)計引物，隨即選取了210處設(shè)計引物，有150對經(jīng)PCR檢測有目的條帶，19對有多態(tài)性，為以后開發(fā)大菱鲆EST-SSR標(biāo)記提供了有價值的信息。對70個微衛(wèi)星位點和19個EST-SSR標(biāo)記在大菱鲆親本后代中的基因型分離方式進行檢測與群體分析。結(jié)果顯示，70個
5、位點共產(chǎn)生了12種分離方式（♀×♂）。70個微衛(wèi)星位點中45個位點符合孟德爾遺傳定律（P≥0.05），有25個位點偏離了孟德爾遺傳定律（P＜0.05）。平均等位基因數(shù)目為2.2，平均有效等位基因數(shù)為1.885。平均期望雜合度和觀測雜合度分別為0.55和0.537。多態(tài)信I上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文息含量為0.182-0.699，平均值為0.361，固定系數(shù)Fis為-0.859-0.957，平均值為-0.215。19個EST-SSR標(biāo)記的共產(chǎn)生了8種分離方式（♀×♂），19個位點中有7個位點顯著偏離了孟德爾遺傳定律（P＜0.05）。各位點的等位基因數(shù)
6、介于2-5個，平均等位基因數(shù)2.316個，觀測雜合度平均值為0.503，多態(tài)信息含量平均值為0.353，固定系數(shù)Fis為-0.405-0.303，平均值為-0.205。以上結(jié)果顯示這些標(biāo)記大部分可以用于大菱鲆進一步的遺傳育種研究。對群體的分析表明，該大菱鲆養(yǎng)殖群體雖然出現(xiàn)了一定程度的退化，但是遺傳多樣性水平還比較高，可用于進一步的良種繁育。本研究利用238個標(biāo)記包括221個微衛(wèi)星分子標(biāo)記和17個EST-SSR標(biāo)記進行了大菱鲆遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建?？ǚ綑z驗表明，母本連鎖圖譜中，嚴重偏分離的（P<0.01）標(biāo)記數(shù)為37個，偏分離比例為21%；父本連鎖圖
7、譜中，嚴重偏分離（P<0.01）的標(biāo)記數(shù)為35個,偏分離比例為21.2%。最后構(gòu)入圖譜中的總標(biāo)記數(shù)為136個，雌性圖譜94個，長度為1099.8cM，20個連鎖群，標(biāo)記間平均間隔為11.7cM；雄性圖譜95個，長度為1214.2cM，22個連鎖群，標(biāo)記間平均間隔12.8cM。并且該圖譜還成功定位了9個EST-SSR，由于EST-SSR標(biāo)記屬于Ⅰ型標(biāo)記，能夠進行物種之間的功能比對，這為相關(guān)性狀的基因篩選，提供了幫助，并且該圖譜還能夠初步滿足QTL定位的研究，為大菱鲆分子標(biāo)記輔助育種的發(fā)展提供了幫助。II上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文關(guān)鍵詞：大菱鲆，EST
8、-SSR，微衛(wèi)星位點，遺傳變異，基因分離，群體分析，連鎖圖譜III上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文PopulationAnalysisofMic
