資源描述：
《微生物基因組學(xué)-基因組研究所》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫(kù)。
1、微生物基因組學(xué)微生物基因組研究概況微生物基因組的特點(diǎn)微生物基因組研究的意義微生物基因組學(xué)微生物基因組研究概況微生物基因組重要紀(jì)事年限事件1994年美國(guó)DOE啟動(dòng)MGP1995年《Science》發(fā)表了第一株細(xì)菌-流感嗜血桿菌全基因組1995年發(fā)表了集胞藻菌株P(guān)CC6803的測(cè)序和注釋1996年《Science》發(fā)表了第一個(gè)完成的古細(xì)菌-詹氏甲烷球菌全基因組序列1996年酵母基因組序列發(fā)表1997年大腸桿菌K-12基因組序列發(fā)表截至2011年4月24日，NCBI上記錄了1534個(gè)細(xì)菌基因組,包括了103個(gè)古細(xì)菌和1431個(gè)真細(xì)菌,其中中國(guó)科學(xué)家完成了44個(gè)P
2、ubMed檢索到的有關(guān)基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的文獻(xiàn)數(shù)TheliteraturenumberretrievedinPubMeddatabaseusing“Genomics”and“Transcriptomics”askeywords年份Year基因組學(xué)文章ArticlesaboutGenomics基因組學(xué)綜述ReviewsaboutGenomics轉(zhuǎn)錄組學(xué)文章ArticlesaboutTranscriptomics轉(zhuǎn)錄組學(xué)綜述ReviewsaboutTranscriptomics200015433832020012072559422002268982618720
3、0335709842313200448101238562320056109141788522006690515591054920077295161313355200881191603162592009855115792347520108986148729670研究現(xiàn)況及內(nèi)容細(xì)菌研究?jī)?nèi)容代表菌株病原菌毒力因子、致病島、耐藥基因、耐藥機(jī)制以及與寄主的關(guān)系等肺炎鏈球菌、致病性大腸桿菌、沙門氏菌等極端環(huán)境生長(zhǎng)的細(xì)菌極端環(huán)境下的生存機(jī)制，如嗜熱菌的熱穩(wěn)定性詹氏甲烷球菌、熱自養(yǎng)甲烷桿菌、甲烷嗜熱菌、騰沖嗜熱菌等工業(yè)和環(huán)境有影響的細(xì)菌CO2固定、固氮、硫氧化和氫代謝等單
4、細(xì)胞藍(lán)細(xì)菌、絲狀藍(lán)細(xì)菌、原綠藻等原核生物基因組的大小原核生物基因組的編碼序列(CDS/ORF)原核生物染色體結(jié)構(gòu)GC含量重復(fù)序列DNA鏈組成的非對(duì)稱性微生物基因組的特點(diǎn)微生物基因組的特點(diǎn)類別特征染色體結(jié)構(gòu)多為一條環(huán)狀閉合雙鏈DNA基因組大小從0.16-13Mb編碼序列占基因組總長(zhǎng)度的90%，平均為1Kb左右GC含量16.6%-74.9%DNA鏈組成的非對(duì)稱分布GCskew、ATskew、基因方向性偏好、密碼子使用偏好CircularrepresentationofthegenomeofT.tengcongensisMB4原核生物基因組的編碼序列占原核生物基
5、因組總序列的90％基因的平均大小為1kbORF原核生物基因組的編碼序列－－ 不同生物編碼序列的比較OrganismGenome(kb)ORFsORFsizeCodingSequence(%)Buchnerasp64058398890Aquifexaeolicus1,5511,51295693Saccharomycescerevisiae12,0696,2941,09257Schizosaccharomycespombe14,0004,8202,03370Caenorhabditiselegans97,00019,0991,31127Arabidopsist
6、haliana115,42825,49846029Homosapiens3,000,00030,0001,340<2原核生物基因組的編碼序列－－ 核生物（高溫菌）基因組的內(nèi)含子SulfolobussolfataricusP2：18個(gè)tRNA基因含有單個(gè)內(nèi)含子一個(gè)胱氨酸t(yī)RNA基因含有2個(gè)內(nèi)含子A.pernixtRNA基因中發(fā)現(xiàn)14個(gè)內(nèi)含子Staphylothermusmarinus和運(yùn)動(dòng)脫硫球菌23SrRNA基因中也發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子染色體結(jié)構(gòu)大多數(shù)原核生物：一條環(huán)狀閉合雙鏈DNABrucellasuis1330：兩條環(huán)狀閉合雙鏈DNA2,107,792bp(Ch
7、rI)1,207,381bp(ChrII)Vibriocholerae:兩條環(huán)狀閉合雙鏈DNA2,961,146bp(ChrI)1,072,314bp(ChrII)BorreliaburgdorferiB31：910,725bp（linearChromosome）21linearandcircularplasmidsTreponemapallidum：一條環(huán)狀閉合雙鏈DNA1,138,006bpGC含量原核生物基因組GC含量為：16.6-74.9%嗜溫菌基因組GC含量與rRNA、tRNA的GC含量成正比嗜熱菌rRNA、tRNA的GC含量與基因組GC含量不成
8、正比，但與OGT（最適生長(zhǎng)溫度）成正比tRNAGC含量總是大于rR
