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《昆蟲轉(zhuǎn)錄后的RNA編輯模式的功能研究》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號UDC密級編號中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所博士后研究工作報告昆蟲整丞盾的B盟壘編輯槿式的功能硒究余曜工作完成時間2013年6月報告提交時間2013年6月2摘要IIIIIIIllIlUlIIIILIMIIY2432056RNA編輯是一種重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制,通過對mRNA上核苷酸的改變來影響蛋白質(zhì)翻譯的產(chǎn)物,從而影響其功能。RNA編輯是生物系統(tǒng)中的重要環(huán)節(jié),參與了組織發(fā)育過程,與環(huán)境適應(yīng)密切相關(guān)。在高等動物中,可能與神經(jīng)系統(tǒng)的病變有一定的相關(guān)性。根據(jù)目前的研究,對RNA編輯靶位點(diǎn)的鑒定和進(jìn)化功能分析始終缺乏高效而準(zhǔn)確
2、的方法和理論,且實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證較為困難,RNA編輯的研究目前也主要集中在高等動物中,昆蟲中尚處于起步階段。了解昆蟲RNA編輯機(jī)制的進(jìn)化和功能,對認(rèn)識生物體調(diào)控系統(tǒng)進(jìn)化規(guī)律有重要作用,為研究RNA編輯和表型的關(guān)聯(lián)奠定基礎(chǔ)。在博士后階段的研究中。以高通量測序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),結(jié)合了其他的生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),對昆蟲的RNA編輯機(jī)制進(jìn)行系統(tǒng)化分析。結(jié)合基因家族進(jìn)化分析,初步闡述了RNA編輯在長期進(jìn)化選擇中扮演的角色:從轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)角度探索其在生物學(xué)功能。本工作中建立一套通過大規(guī)模數(shù)據(jù)鑒定RNA編輯靶位點(diǎn),并對其進(jìn)行注釋、進(jìn)化分析、功能分析的技術(shù)方法。AbStrac
3、tRNAeditingisoneoftheimportantmechanismoftranscriptionalregulation,affectingthetranslationoftheproteinproductbychangingnucleotideinthemRNAtoaffectitsfunction.RNAeditingplayskeyroleinthebiologicalsystems,whichisnvolvedintissuedevelopment,andadaptationtotheenvironment.Inhig
4、heranimals,andnervoussystemlesionsmayhavesomerelevancewithRNAeditingAccordingtocurrentresearchonRNAediting,thepredictionoftargetsiteandfunctionalanalysisofevolutionlackofefficientandaccuratemethodsandtheoriesbesidestheexperimentalverificationisverydifficult.Thusthiskindof
5、studyiscurrentlyfocusedonthehigheranimals.ThestudyofinsectsRNAeditingisstillinnfancy.Tounderstandthemechanism,evolutioncharacters,andbiologicalfunctionofRNAeditingininsectsishelpfultotheunderstandingofregulatorysystems.Inthepost-doctoralphaseofmystudy,basedonhigh-throughp
6、utsequencingdatacombinedwithdatafromotherbiologicalexperiments,thesystematicanalysisofRNAeditingmechanismsininsectspeciesisperformed.Combininggenefamilyevolutionanalysis,wepreliminaryelaboratelong-termevolutionofRNAeditinginnatureselectionandexploreitsbiologicalfunctionsf
7、romtheperspectiveoftranscriptionalregulatorynetwork.Thisworkestablishesalarge—scaledatabasedsystemofRNAeditingtargetsiteidentification,annotation,evolutionaryanalysis,andfunctionalanalysis4目錄研究背景?????????????????????????????71.1RNA編輯機(jī)制的發(fā)現(xiàn)????????????????????..71.2RNA編輯在生命
8、系統(tǒng)中的作用????????????????..81.3RNA編輯在動物中的研究??????????????????..91.4RNA編輯靶標(biāo)的確定????????????????????10