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1、棉花學報CottonScience2009,21(5):420～426棉花種質資源遺傳多樣性的TRAP分析1132222苗培明,范玲,師維軍,烏買爾江,徐利民,馬君(1.新疆農業(yè)科學院核技術生物技術研究所,烏魯木齊830091;2.新疆農業(yè)科學院經(jīng)濟作物研究所,烏魯木齊830091)摘要:應用TRAP分子標記方法對65份棉花種質資源進行遺傳多樣性分析。從100對引物中篩選出10對引物,用TRAP2PCR的方法共擴增出252條帶,其中210條為多態(tài)帶,比率為83.33%。利用NTSYSpc2.1遺傳學統(tǒng)計分析軟件中的UPMGA法對所獲得的數(shù)據(jù)進行聚
2、類分析,建立了65份棉花種質資源的親緣關系樹狀圖。當遺傳相似性系數(shù)(GS)為0.84時,65份種質資源可以分為6大類群。所獲得的聚類結果與種質資源的地域來源和形態(tài)特征有一定的相關性。說明TRAP型的分子標記方法在棉花種質資源鑒定、分類等方面的研究上具有良好的應用前景。關鍵詞:棉花;種質;遺傳多樣性;TRAP中圖分類號:S562.024文獻標識碼:A文章編號:100227807(2009)0520420207AnalysisofGeneticDiversityinCottonGermplasmbyTRAPMarkers1132222MIAOPei2
3、ming,FANLing,SHIWei2jun,Wumaierjiang,XULi2min,MAJun(1.InstituteofNuclearandBiologicalTechnologies,XinjiangAcademyofAgriculturalSciences,Urumqi830091,China;2.InstituteofEconomicCrops,XinjiangAcademyofAgriculturalSci2ences,Urumqi830091,China)Abstract:Thegeneticdiversityamong65l
4、inesofcottongermplasmwasanalyzedbyTRAP(TargetRegionAmplificationPolymorphism)markers.From100pairofprimers,10pairsofpolymorphicprimerswereselected.Atotalof252bandswereamplifiedfrom10pairsofprimersbyTRAP2PCR,ofwhich210bands(about83.33%)werepolymorphic.The65linesofcottongermplas
5、mwereclus2teredintosixgroupsatGS(geneticsimilarities)=0.8431andthelinkmapwassetupbyUPMGAmethodinNTSYSpc2.1(numericaltaxonomyandmultivariateanalysissystem).Theresultsshowedthatthegermplasmclustershadcertainrelationshipwiththegermplasmoriginsandthemorphologiccharacters.Theresul
6、tssuggestedthatthenewtypeofmolecularmakermethod,TRAP,wassuitableforgeneticidentification,clusterofcottongermplasm.Keywords:cotton;germplasm;geneticdiversity;TRAPTRAP(targetregionamplificationpoly2EST序列信息,使用長度為16～20核苷的固定morphism,目標區(qū)域擴增多態(tài)性)方法是2003年引物與隨機引物,固定引物以公用數(shù)據(jù)庫中目標建立起來的一種新型
7、的基于PCR的分子標記方基因的cDNA或EST序列設計而來;隨機引物[1]法,與其它分子標記方法相比較,TRAP方法具是以一段富含AT或GC為核心、可與內含子或有以下特點:(1)操作簡單;(2)重復性好;(3)外顯子區(qū)配對的隨機序列。這一方法目前已經(jīng)在[122][3][4][5]效率高。TRAP方法是基于已知的cDNA或向日葵、小麥、甘蔗、菜豆等農作物得到收稿日期:2008206218作者簡介:苗培明(19802),男,碩士研究生;3通訊作者,fanling@xaas.ac.cn基金項目:國家“863”項目(2006AA10Z184),新疆高技術
8、研究發(fā)展計劃項目(200611101)?5期苗培明等:棉花種質資源遺傳多樣性的TRAP分析421成功應用。研究結果證明該方法對農作物群體
