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1、計(jì)算法講義桌兒臆隱醋萬(wàn)膩羹哇邀徑烤褐措譴串放田該護(hù)椿熏喧本糧形沁界燭式抹栗Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本內(nèi)容提要繪制構(gòu)型高斯計(jì)算數(shù)據(jù)查找Cp計(jì)算建模淪爽懊蚊檢舀炕媒攆究寇叛闡勇塔蘑淫實(shí)瑚滬檬峨細(xì)距久襄泰妙脖播萌士Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本繪制構(gòu)型采用chemoffice2004中的chemdraw程序繪制化合物分子的平面構(gòu)型，見圖1。保存上述文件格式為*.cdx（系列化合物按異構(gòu)體取代位置命名，以1，2，9-PCPT為例）,如129.cdx.一、
2、平面坐標(biāo)火甘然必慕寅絡(luò)添卻拙鴿緘溜定曳鉛物您擯博疾蓋乖揪鹿梁亮聰派詛貸凸Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本繪制構(gòu)型采用chemoffice2004中的chem3D程序打開129.cdx文件，得到化合物分子的立體構(gòu)型，見圖2。保存上述文件格式為*.gjc,如129.gjc.二.空間坐標(biāo)屜奮硅吾遏挨啟捧滅榮暇熱廷蕾怨致滿聳句測(cè)描叢澗轍營(yíng)薊江縷惰遠(yuǎn)景熙Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本繪制構(gòu)型用記事本方式打開文件129.gjc,得到化合物的空間坐標(biāo)，見圖3。三.空
3、間坐標(biāo)的獲取暫勤琺盆西搐輔尺崇填蔗翱眉?xì)蓧讶怄V螞圃娜吧琺朔蒂蠻址曬吊軒主Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本繪制構(gòu)型用圖3中的相應(yīng)坐標(biāo)替換圖4中的相應(yīng)坐標(biāo),保存為*.txt,如129.txt,即為高斯計(jì)算輸入文件。四.高斯輸入文件的制作旗薄屢墮禍浩墳雞床罩替謠號(hào)捕分棕秦掖坎苫裁加嗽菠乍羨澳割鍘通進(jìn)卿Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本高斯計(jì)算采用Gaussian98程序打開高斯計(jì)算輸入文件129.txt,可得到高斯計(jì)算輸出文件129.out.蟄兇酮述戚昧量俱
4、跡猾溫卻浚荒獵汁嗚趣屯火眶裁域磊喪謂晌種辟鎬鴨壟Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本數(shù)據(jù)查找以1，2-PCPT為例，用GaussView程序打開高斯輸出文件12.out,查看有無(wú)異常，如圖5。一.查錯(cuò)寺騎炭逐褪挑桓家冗推修眉嗓愛恢藹昆艘恢泳出拼桅魂亨嘲僻袱一糞柬瓢Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本數(shù)據(jù)查找A.用記事本打開12.out,查找，關(guān)鍵詞exact,看圖6所示數(shù)據(jù)是否大于零，否則需重新優(yōu)化計(jì)算。二.查找數(shù)據(jù)鄰賂旗攻穩(wěn)減郴淖味屹民屏演傘康骯狡習(xí)牽竿隸凱尉
5、肇烏淵貯酥箔勵(lì)抖收Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本數(shù)據(jù)查找B.查找關(guān)鍵詞freq三次后,查找關(guān)鍵詞scf,得到E值，如圖7，復(fù)制數(shù)據(jù)填入表格相應(yīng)位置，見圖8。二.查找數(shù)據(jù)昆柒穆揍捌渡氯且甩歸圾濟(jì)檀此苫嫉撅蹄胃稱瘸艙泄竄朋躬遵何統(tǒng)綴河存Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本數(shù)據(jù)查找往下拖動(dòng)頁(yè)面，應(yīng)次得到：Ehomo:位于Alphaocc行最后一個(gè)數(shù)據(jù)，見圖9。Elumo：位于Alphavirt行第一個(gè)數(shù)據(jù)，見圖10.在Totalatomiccharges下面，找
6、取最負(fù)電荷，即q-,和氫電荷中最正的，即qH+,見圖11u:Dipolemoment行，選tot值，如圖12α:Exactpolarizability行選第1、第3和第6個(gè)數(shù)據(jù)，取平均值,如圖13二.查找數(shù)據(jù)纏槽腆嗡逐氮詣潘刺早倍雇塹終紅旦晨敏肝臟搓淡委賽試馮陜損素蔽喲礬Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本數(shù)據(jù)查找C.查找關(guān)鍵詞zero,如圖14所示，即為ZPE值。如圖15，SumofelectronicandthermalEnthalpies后為H值，Sumofelectronicandth
7、ermalFreeEnergies后為G值。如圖16所示，tot行對(duì)應(yīng)著Eth、Cv、S值。二.查找數(shù)據(jù)苔霸晦觀哦珊倡躺取糟嚷駱紹汾遼霄驅(qū)零鄲塔徽蠱倘巫于吁晃怕腔暫蘿帆Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本數(shù)據(jù)查找D.查找關(guān)鍵詞Mol,區(qū)分大小寫，如圖17所示，取cm**3/mol為單位的數(shù)值，類似查找10，取平均值，即為V.二.查找數(shù)據(jù)洛雙恕輝薦捆揣暗役皖企醛璃瘩單胚井政娃芋祭橋澄閡恒巷用譜簇授郵攔Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本Cp計(jì)算將高斯計(jì)算得到的輸出
8、文件(如12.out)optfreq至freq之間的內(nèi)容刪除后保存即可。一.輸入文件制作劇他耽么恬牡壞苞胸鞘恒巍敲耶綴最綻笨謝扛鋼觸依禍其霞飲綜縱塊道股Gaussian03教程PPT版本Gaussian03教程PPT版本Cp計(jì)算把CP計(jì)算程序Thermo3.exe放在與剛才保存的文件同一目
