DNAstar中Seqman拼接序列使用方法

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1、啟動(dòng)Seqman,點(diǎn)擊面板中的Addsequence 按鈕添加將要拼接的序列選中目標(biāo)序列,點(diǎn)擊Add--Done導(dǎo)入目標(biāo)序列?如果導(dǎo)入的是峰圖文件,可以雙擊文件名會(huì)彈出峰形圖,通過移動(dòng)黑色的分隔線可以去除測(cè)序質(zhì)量不高的區(qū)域(黃色區(qū)域),從而避免在拼接過程中產(chǎn)生模棱兩可的數(shù)據(jù)。?數(shù)據(jù)修正后點(diǎn)擊Assemble即拼接,運(yùn)行結(jié)束后會(huì)彈出一個(gè)新對(duì)話框,如果能拼接上,則在Contig一欄有顯示。雙擊Contig可以看到拼接好的完整序列,以及兩個(gè)峰圖的重疊區(qū)域,如果兩個(gè)峰圖的重疊區(qū)域完全匹配,則表明拼接的結(jié)果可靠;如果兩個(gè)峰圖間有不同堿基,則需要比對(duì)兩個(gè)峰圖,

2、選擇峰圖清晰的作為最終結(jié)果。點(diǎn)擊文件前面的三角形可以直接查看序列的峰形圖?點(diǎn)擊菜單欄的Contig--Save?Consense--Single?File?可以保存拼接好的序列。

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