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石墨烯 graphene MS建模方法

石墨烯 graphene MS建模方法

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1、1、打開(kāi)materialstudio,新建一個(gè)工程,導(dǎo)入石墨graphite.msi(也可以自己build,然后添加原子)。2、build->makep1(目的是消除對(duì)稱性,這樣才能夠刪除一層原子)。3、刪除一層原子(選中原子->delete)。4、修改晶格參數(shù):build->crystal->rebuildcrystal,設(shè)置方位角,,5、構(gòu)建supercell(方便摻雜,也為了好看):build->symetry->supercell,構(gòu)建一個(gè)5x5x1的超原胞。6、cleavesurface(為了能夠添加真空層):build->surface->cleavesurface,(h,k,

2、l)改為(0,0,-1)7、添加20埃真空層(添加真空層是為了減小層與層之間的影響,至少20埃,大點(diǎn)沒(méi)關(guān)系,最多是計(jì)算時(shí)時(shí)間長(zhǎng)一點(diǎn)):build->srystal->buildvacuum。構(gòu)建好后,模型如下:兩種模型的建立方法:第一種,導(dǎo)入軟件內(nèi)置模型執(zhí)行file–import–structure–ceramics–graphite.msi,獲得雙層石墨烯,層間距為0.34nm,將其擴(kuò)充為6層,選定一層,將其移動(dòng)到模型正中央,模型厚度為0.68*3nm;第二種方法,建立晶胞,選擇模型為第183型,設(shè)置參數(shù)為2.46、2.46和3.4,然后將碳原子添加進(jìn)去,設(shè)置坐標(biāo)為0.333、0.667

3、和0.500,獲得厚度為0.34nm的晶胞,將其擴(kuò)充為6層,因此它的厚度與第一種一樣?,F(xiàn)在要確定兩種模型的結(jié)點(diǎn)個(gè)數(shù),為使體積接近,分別將其擴(kuò)充為145和128個(gè)結(jié)點(diǎn)。如圖,顯而易見(jiàn),第一種模型邊沿布滿結(jié)點(diǎn),而第二種模型邊沿沒(méi)有結(jié)點(diǎn)。為使模型穩(wěn)定,對(duì)它們初步先進(jìn)行幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化。優(yōu)化以前,鍵角都是120°鍵長(zhǎng)均為0.142nm。幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化后,鍵長(zhǎng)和鍵角均發(fā)生了一些輕微變化。(模型一)(模型二)導(dǎo)入石墨結(jié)構(gòu)后,cleavesurface,取石墨的C方向(001),選合適的thickness和position,使之只有一層原子(比如top:1.0,thickness0.6),得到表面后再buil

4、dvacuumslab,選thickness(比如20A),slabposition可以選負(fù)的(比如-10A),這樣就得到了,你還可以重新定義二維晶胞的晶格參數(shù)(build->symmetry->redefinelattice,比如選B為-120,晶格就變成長(zhǎng)方形的了,當(dāng)然也可以在六方晶格的supercell上刪掉一些原子得到長(zhǎng)方形的supercell),使之更適合你的需要。選擇Import

5、Structures

6、ceramicsandimportgraphite.msi.然后選擇,Build

7、Symmetry

8、MakeP1,刪除其中一層,把剩下的一層移到中間,然后選擇Build

9、Symm

10、etry

11、FindSymmetry…

12、FindSymmetry

13、ImposeSymmetry.接下來(lái)選擇Build

14、Symmetry

15、Supercell,創(chuàng)建5*5*1的石墨烯超晶胞.接下來(lái)選擇Build

16、Crystals

17、RebuildCrystal....把C值增加到15,點(diǎn)擊rebuildcrystal.SampleText?優(yōu)化步驟.點(diǎn)擊CASTEP按鈕Calculation打開(kāi)CASTEPCalculation對(duì)話框.把Task從Energy改變?yōu)镚eometryOptimization.點(diǎn)擊More…打開(kāi)CASTEPGeometryOptimization對(duì)話框.把Qualit

18、y改為Fine,然后勾選上theOptimizeCell復(fù)選框.接下來(lái)選擇Electronic,把SCFtolerance改為Fine,然后點(diǎn)擊More…打開(kāi)CASTEPElectronicOption對(duì)話框.在Basis標(biāo)簽下勾選Usecustomenergycutoff并鍵入300.在k-point下點(diǎn)擊theCustomgridparametersradio.在theGridparametersfield下,把a(bǔ)、b、c依次設(shè)置為3、3、1,并關(guān)閉對(duì)話框.最后,點(diǎn)擊Run。布里淵區(qū)積分路徑:diracpoint應(yīng)該出現(xiàn)在K點(diǎn)。但是當(dāng)構(gòu)建超胞的時(shí)候,由于去掉了體系的對(duì)稱性(makeP1

19、),K點(diǎn)不再是MS計(jì)算時(shí)默認(rèn)的高對(duì)稱點(diǎn)了。因此,在計(jì)算BandStructure時(shí),MS的選項(xiàng)里沒(méi)出現(xiàn)K點(diǎn)。有兩種解決方法。一是用MS先確定模型的對(duì)稱性,看看能不能使K點(diǎn)出現(xiàn)。(對(duì)于我選取的n×n的平行四邊形超胞是可以的。)二是計(jì)算BandStructure時(shí)直接指定K點(diǎn)的左邊。K點(diǎn)坐標(biāo)是(-0.333,0.667,0).我的n×n超胞G點(diǎn)在C原子上,能帶計(jì)算是G-->K,能帶在K點(diǎn)相交于fermi面

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