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《基于ITS2序列的積雪草及其混偽品的分子鑒定》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫。
1、基于ITS2序列的積雪草及其混偽品的分子鑒定陳曉辰I,陳倩2,韓建萍I(1.屮國醫(yī)學(xué)科學(xué)院,北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥用植物研究所,北京100193;2.湖北中醫(yī)藥大學(xué),武漢430061)摘要:冃的快速準(zhǔn)確的鑒別中藥積雪草及其混偽品。方法采用1TS2序列片段,對(duì)其進(jìn)行PCR擴(kuò)增、測序,運(yùn)用CodonCodeAligner.MEGA4.1等軟件進(jìn)行序列拼接和分析,構(gòu)建積雪草及其混偽品的NJ樹。應(yīng)用Koetschan等建立的ITS2數(shù)據(jù)庫及其網(wǎng)站預(yù)測ITS2二級(jí)結(jié)構(gòu)。結(jié)果積雪草及其混偽品ITS2序列之間存在明顯差異,種間遺傳距離大于種內(nèi)遺傳距離,不同積雪
2、草樣品在NJ樹上獨(dú)立聚為一支。結(jié)論運(yùn)用ITS2序列可以準(zhǔn)確鑒定積雪草及其偽品。關(guān)鍵詞:積雪草;ITS2;混偽品;分子鑒定中圖分類號(hào):R282.5MolecularidentiHcationofCentellaasiaticaanditsadulterantsusingITS2DNAbarcodeCHENXiaochem,CHENQiam,HANJianpingi(1.PlantDevelopment,ChineseAcademyofMedicalSciences,PekingUnionMedicalCollege,Beijing100193
3、;2.HuibeiUnivercityofChineseMedicine,WuHan430061)Abstract:ObjectiveToidentifyCentellaasiaticaanditsadulterantsinafastandspecificway.Methods1TS2regionsasDNABarcodewereamplifiedandsequensed?SequenceassemblyandconsensussequencegenerationwereperformedusingtheCodonCodeAligner.S
4、equeneeanalyseswerecarriedoutbyMEGA4.1.Thephylogenetictreewasconstructedusingtheneighbor-joiningandKimura2-parametermethods.ResultsAsignificantdifferencewasobservedintheITS2sequencesbetweenCentellaasiaticaanditsadulterants?In"r?specificgeneticdistanceishigherthanintra-spec
5、ificone,ITS2sequencesandsecondarystructureofITS2candistinguishCentellaasiaticafromitsadulterants?ConclusionITS2canserveasavaluablemarkerforidentifyingCentellaasiaticaanditsadulterants?Keywords:Centellaasiatica;ITS2;adulterants;molecularidentification0引言積雪草為傘形科植物積雪草(Centell
6、aasiatica)的干燥全草。具有清熱利濕、解毒消腫的作用,臨床上主要用于治療濕熱黃疸、屮暑腹瀉、石淋血淋、癰腫瘡毒、跌撲損傷⑴。文獻(xiàn)已報(bào)道過的混偽品主要有天胡荽(HydrocotylesibthorpioidesLam),連錢草(Glechomalongituba(Nakai)Kupr.),過路黃(LysimachiachristinaeHance),馬蹄金(DichondrarepensForst)等目前已有文獻(xiàn)報(bào)道的鑒別積雪草及其混偽品的方法主要有性狀鑒別、顯微鑒別、導(dǎo)數(shù)紫外吸收光譜法、差熱分析法等4一幕DNA條形碼是指用短的、標(biāo)準(zhǔn)
7、的DNA片段作為物種標(biāo)記而建立的一種新的生物鑒定方法。ITS2序列作為條形碼序列之一,以其序列片段較短,物種水平變異較快等優(yōu)勢被廣泛應(yīng)用于藥用植物及生藥鑒定15⑹。本文選取ITS2序列鑒定積雪草及其混偽品,以期為臨床用基金項(xiàng)高等學(xué)校博士學(xué)科點(diǎn)專項(xiàng)科研基金(200800231066)作者簡介:陳曉辰,(1988?),女,碩士研究生,中藥資源學(xué)。通信聯(lián)系人:韓建萍,(I977-),女,副硏究員,中藥資源學(xué)。E-mail:jphan@implad.ac.cn幼安全提供可靠保障。1材料與方法1.1材料表1研究所用材料信息表拉丁學(xué)名Latinname
8、標(biāo)木號(hào)SpecimenNO.登錄號(hào)拉丁學(xué)名Latinname標(biāo)本號(hào)登錄號(hào)C.asiaticaPS1212MT01GQ434697C.asiaticaPS1212MT04GQ434