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《豬和雞戊型肝炎病毒基因重組分析》由會員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、２０１６（０５上）：３０－３２，２７９－２８０豬和雞戊型肝炎病毒基因重組分析１２１１１１張躍，馬春麗，王芬，黃宇辰，王典，馬德星（１．東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院，哈爾濱１５００３０；２．東北農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院，哈爾濱１５００３０）中圖分類號：Ｓ８５５．３；Ｑ７８４文獻(xiàn)標(biāo)識碼：Ａ文章編號：１００４－７０３４（２０１６）０５－００３０－０５關(guān)鍵詞：豬；雞；戊型肝炎病毒；基因；重組分析摘要：雞戊型肝炎病毒（ａｖｉａｎＨｅｐａｔｉｔｉｓＥｖｉｒｕｓ，ａＨＥＶ）衣殼蛋白的抗血清可以與豬戊型肝炎病毒（ｓｗｉｎｅＨｅｐａｔｉ
2、ｔｉｓＥｖｉｒｕｓ，ｓＨＥＶ）的衣殼蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)，提示上述兩種病原之間存在某種相關(guān)性。為了研究ｓＨＥＶ和ａＨＥＶ之間是否存在基因重組現(xiàn)象，試驗(yàn)應(yīng)用生物信息學(xué)方法對ｓＨＥＶ和ａＨＥＶ的重組進(jìn)行了系統(tǒng)分析，共收集了具有代表性的６１條ｓＨＥＶｓ全基因組序列，１１條ａＨＥＶｓ全基因組序列，應(yīng)用ＲＤＰ４．２４和ＳｉｍＰｌｏｔ３．５．１生物學(xué)軟件對重組事件進(jìn)行了分析。結(jié)果表明：ａＨＥＶ與ｓＨＥＶ之間沒有發(fā)現(xiàn)明確的重組信號，但ｓＨＥＶ間存在兩個(gè)重組信號，分別存在于ＤＱ４５００７２毒株的１９９３～２７２４位核苷酸堿基和
3、４７４５～５７５４位核苷酸堿基區(qū)間內(nèi)。說明ａＨＥＶ與ｓＨＥＶ之間不存在重組現(xiàn)象。ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｅｎｅｔｉｃｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｉｎｓｗｉｎｅａｎｄａｖｉａｎＨｅｐａｔｉｔｉｓＥｖｉｒｕｓｅｓ１２１１１１ＺＨＡＮＧＹｕｅ，ＭＡＣｈｕｎｌｉ，ＷＡＮＧＦｅｎ，ＨＵＡＮＧＹｕｃｈｅｎ，ＷＡＮＧＤｉａｎ，ＭＡＤｅｘｉｎｇ（１．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＶｅｔｅｒｉｎａｒｙＭｅｄｉｃｉｎｅ，ＮｏｒｔｈｅａｓｔＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｒｂｉｎ１５００３０，Ｃｈｉｎａ；２．Ｃｏｌｌｅｇｅｏｆ
4、Ｆｏｏｄ，ＮｏｒｔｈｅａｓｔＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｒｂｉｎ１５００３０，Ｃｈｉｎａ）Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｓｗｉｎｅ；ａｖｉａｎ；ＨｅｐａｔｉｔｉｓＥｖｉｒｕｓ（ＨＥＶ）；ｇｅｎｅ；ｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓＡｂｓｔｒａｃｔ：ＴｈｅａｎｔｉｓｅｒｕｍａｇａｉｎｓｔｔｈｅｃａｐｓｉｄｐｒｏｔｅｉｎｏｆａｖｉａｎＨｅｐａｔｉｔｉｓＥｖｉｒｕｓ（ａＨＥＶ）ｃｏｕｌｄｃｒｏｓｓｒｅａｃｔｗｉｔｈｔｈｅｃａｐｓｉｄｐｒｏｔｅｉｎｏｆｓｗｉｎｅＨｅｐａｔｉｔｉｓＥｖｉｒｕｓ（ｓ
5、ＨＥＶ），ｓｕｇｇｅｓｔｉｎｇｔｈａｔｔｈｅｒｅｗａｓｓｏｍｅｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎｂｅｔｗｅｅｎｔｈｅｔｗｏｐａｔｈｏｇｅｎｓ．ＴｏｓｔｕｄｙｗｈｅｔｈｅｒｔｈｅｒｅｗａｓｇｅｎｅｔｉｃｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｐｈｅｎｏｍｅｎｏｎｂｅｔｗｅｅｎｓＨＥＶａｎｄａＨＥＶ，ａｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｍｅｔｈｏｄｗａｓｕｓｅｄｆｏｒｓｙｓｔｅｍａｔｉｃａｌａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｂｅｔｗｅｅｎｓＨＥＶｓａｎｄａＨＥＶｓ，６１ｃｏｍｐｌｅｔｅｇｅｎｏｍｓｅｑｕｅｎｃｅｓｏｆｒｅｐｒ
6、ｅｓｅｎｔａｔｉｖｅｓＨＥＶｓｔｒａｉｎｓａｎｄ１１ｃｏｍｐｌｅｔｅｇｅｎｏｍｓｅｑｕｅｎｃｅｓｏｆｒｅｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｖｅａＨＥＶｓｔｒａｉｎｓｗｅｒｅｃｏｌｌｅｃｔｅｄ，ａｎｄｔｈｅｎｔｈｅｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｅｖｅｎｔｓｗｅｒｅａｎａｌｙｚｅｄｕｓｉｎｇＲＤＰ４．２４ａｎｄＳｉｍＰｌｏｔ３．５．１ｂｉｏｌｏｇｙｓｏｆｔｗａｒｅｓ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｎｏｃｌｅａｒｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｓｉｇｎａｌｗａｓｏｂｓｅｒｖｅｄｂｅｔｗｅｅｎａＨＥＶｓａｎｄｓＨＥＶｓ，ｂｕｔｔ
7、ｈｅｒｅｗｅｒｅｔｗｏｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｓｉｇｎａｌｓｂｅｔｗｅｅｎｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｂａｓｅａｔ１９９３ｔｏ２７２４ｎｔａｎｄ４７４５ｔｏ５７５４ｎｔｉｎｔｈｅｓＨＥＶｓｔｒａｉｎＤＱ４５００７２．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｉｎｄｉｃａｔｅｔｈａｔｔｈｅｒｅｉｓｎｏｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｐｈｅｎｏｍｅｎｏｎｂｅｔｗｅｅｎａＨＥＶｓａｎｄｓＨＥＶｓ．［３］戊型肝炎病毒（ＨＥＶ）屬肝炎病毒科，是一種無Ｈｅｐａｔｉｔｉｓｖｉｒｕｓ，ｓＨＥＶ）核衣殼蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)，包膜的正鏈ＲＮＡ病毒，其基因組大小約為
8、７．２ｋｂ，包但關(guān)于ａＨＥＶ是否可以感染人和家畜迄今尚無確切含３個(gè)互相重疊的開放閱讀框（ＯＲＦ１、ＯＲＦ２、ＯＲＦ３），結(jié)論。為進(jìn)一步探索ａＨＥＶ和ｓＨＥＶ之間的相關(guān)性，［１］主要通過糞—口途徑在易感宿主間傳播。戊型肝試驗(yàn)從生物信息學(xué)角度著手，收集已公布且具有代表炎病毒主要分為５個(gè)基因型，Ⅰ型和Ⅱ型僅發(fā)現(xiàn)于人性的ａＨＥＶ和ｓＨＥＶ全基因組序列，并對ａＨＥＶ、類，Ⅲ型和Ⅳ型為人和家畜共患，Ⅴ型僅發(fā)現(xiàn)于禽ｓＨＥＶ、ｓ
