DNA序列判別分類模型.pdf

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1、DNA序列判別分類模型王顯金陽軍寧波大紅鷹學(xué)院,浙江寧波315175[目的]結(jié)合生物學(xué)知識和數(shù)學(xué)方法構(gòu)建DNA序列判別分類模型。[方法]根據(jù)氨基酸分子中側(cè)鏈基的極性性質(zhì),從不同序列中氨基酸含量不同提煉出能從堿基含量和堿基排列情況兩方面代表序列特征的氨基酸類別信息,用一個四維向量來表征,用馬氏距離法和FISHER判別法對給定序列進行分類。[結(jié)果]該模型中,2種分類方法所得的樣本回代率均達100%,分類一致率為90%。[結(jié)論]該模型算法簡單,分類結(jié)果精度較高,優(yōu)于僅基于堿基含量的判別分類模型。DNA序列;密碼子;判別分析;頻率S188A05

2、17-6611(2011)23-13955-03DNASequenceIdentificationClassificationModelWANGXian-jin寧波大紅鷹學(xué)院2011年科研課題(CF102601)。王顯金(1978-),男,江西興國人,講師,從事數(shù)學(xué)教育和數(shù)學(xué)應(yīng)用研究。2011-04-07(2)@@[1]韓軼平,余杭,劉威,等.DNA序列的分類[J].數(shù)學(xué)的實踐與認(rèn)識,2001,31(1):38-45.@@[2]呂金翅,馬小龍,曹芳,等.DNA序列分類的數(shù)學(xué)模型[J].數(shù)學(xué)的實踐與認(rèn)識,2001,31(1):46-53.

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