小鼠肝炎病毒A59毒株結構蛋白基因的克隆-論文.pdf

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1、AnimalHusbandry&VeterinaryMedicine2014Vo1.46No.8小鼠肝炎病毒A59毒株結構蛋白基因的克隆陳曉娟,衛(wèi)振,劉迪文(浙江大學實驗動物中心,浙江杭州310058)摘要:為獲得小鼠肝炎病毒(mousehepatitisvirus,MHV)結構蛋白基因s1、s2、M及N,分別構建了4個重組質粒。依據(jù)GenBank公布的MHVA59毒株RNA全序列設計4對特異性引物,以A59RNA反轉錄得到的eDNA為模板,通過PCR擴增出Sl、s2、M及N這3個結構蛋白基因的4個片段,分別將其通過A—T連接入pMD一20

2、T載體后,雙酶切鑒定正確后,送出測序確認。將測序結果與GenBank序列比對,確認擴增得到的s1、s2、M及N的核酸序列與其相似度分別為100%,99%,100%和99%。試驗成功擴增出s1、s2、M及N的核酸序列,其構建的重組質??梢宰鳛闄z測MHV的陽性對照,為建立RT—PCR快速檢測試驗小鼠MHV的方法提供生物材料。關鍵詞:小鼠肝炎病毒;RT~PCR;克隆中圖分類號:$852.6文獻標志碼:A文章編號:0529-5130(2014)08-0080—03小鼠肝炎是實驗小鼠常見的傳染病之一,其病原只能在P2生物安全實驗室進行操作,這就限制了

3、一體小鼠肝炎病毒(mousehepatitisvirus,MHV)多呈般實驗動物飼養(yǎng)管理機構對MHV日常檢測方法的建隱性或亞I臨床感染,但嚴重干擾小鼠試驗結果的準確立J。本試驗以MHVA59毒株的RNA為模板,設性,是清潔級及以上動物必須排除的微生物,也是國計了4對特異性引物擴增s1、s2、M和N蛋白的基標規(guī)定的實驗大小鼠必檢項目。小鼠肝炎病毒在分類因序列,并分別構建重組質粒,避免直接使用病毒作上屬于冠狀病毒科冠狀病毒屬的單股正鏈RNA病毒,為陽性對照樣品的危害性,為早期快速診斷MHV建基因組大小約31kb,包括3個主要的結構蛋白,即立安全

4、、敏感、可靠的檢測方法打下了基礎。s蛋白、M蛋白和N蛋白?。s蛋白(刺突糖蛋白)1材料與方法約1300個氨基酸,構成病毒胞膜上的突起部分,以第717氨基酸分為2個部分,即Sl和S2。S1較易變1.1病毒RNA化,位于蛋白的氨基端,形成一個球狀結構,含有受A59小鼠肝炎病毒RNA由上海市實驗動物質量體結合位點;s2相對保守,位于蛋白的羧基端,形監(jiān)督檢驗站饋贈。成一個穿膜的棒狀結構,含有3個螺旋結構j。M1.2主要試劑蛋白(膜糖蛋白)約230個氨基酸,分信號肽、膜MiniBESTUniversalRNAExtractionKit、RT-PCR外

5、區(qū)、跨膜區(qū)、胞外區(qū)等5個功能區(qū)。N蛋白(核衣Kit、PrimeSTARHSDNAPolymerase、DNAA—Tailing殼蛋白)約450個氨基酸,與基因組RNA特異性結Kit、T—VectorpMD一20、DNALigationKit、MiniBEST合,位于病毒顆粒的核心。PlasmidPurificationKit、NdeI、SacI(均為TaKaRa目前,實驗室診斷MHV主要是ELISA等檢測特產(chǎn)品),DH5oL感受態(tài)(北京全式金)。異性抗體,但動物感染病毒后需經(jīng)過一段時間才能產(chǎn)1.3引物設計生抗體,導致檢測的滯后性,不能及時反

6、映機體攜帶根據(jù)GenBank中MHVA59全基因序列病毒情況,造成結果誤判。此外,樣本量較少時檢測(AY700211.1)[93,用PrimerPremier5.0軟件設計4抗體會增加經(jīng)濟成本,不利于日常檢測。與此相比,對引物,見表1。引物由上海英濰捷基(上海)貿(mào)易RT—PCR技術以其快速、準確、樣本量小等優(yōu)點,成有限公司合成。為目前微生物檢測的研究熱點。MHV核酸檢測多以1.4eDNA模板制備其標準毒株作為陽性對照特異性檢測結構蛋白的部分RNA測定濃度后,進行eDNA制備。反轉錄體基因片段,由于病毒培養(yǎng)和提取的特殊性,以致于其系:MHV總

7、RNA1Ixg,5×PrimeScriptbuffer4L,PrimeScriptRTenzymemixI1IxL,OligodTPrimer(50收稿13期:2014—06—16~mol/L)1L,Random6mers(100i~mol/L)1IxL,作者簡介:陳曉娟(1983一),女,助理實驗師,碩士加RnasefreedHO至20L。混勻后置于42℃水浴1通信作者:劉迪文,研究員,主要從事實驗動物研究、管理及h,85℃5min,冰浴冷卻備用。教學工作,E—mail:liudiwen2004@163.son·82·AnimalHusb

8、andry&VeterinaryMedicine2014Vo1.46No.840470480《Y皇0ZAT00:§§00AQ窘警A§A0£鬣S蕊。s蠢箴£芏毽毽蕊ATS圖3N基因

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