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《鉑類耐藥相關(guān)基因在卵巢癌順鉑耐藥形成過程中表達(dá)量的動(dòng)態(tài)變化-論文.pdf》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫(kù)。
1、·210‘中國(guó)癌癥防治雜志2013年9月第5卷第3期ChinJofOneolPrevandTreat,Sep2013,Vo1.5,No.3鉑類耐藥相關(guān)基因在卵巢癌順鉑耐藥形成過程中表達(dá)量的動(dòng)態(tài)變化石麗君于紅靜李力王琪作者單位:530021南寧廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院實(shí)驗(yàn)研究部;廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院婦瘤科【摘要】目的了解卵巢癌患者在鉑類治療過程中產(chǎn)生獲得性耐藥相關(guān)基因表達(dá)動(dòng)態(tài)變化的情況,為臨床預(yù)后的預(yù)測(cè)及個(gè)體化治療奠定理論基礎(chǔ)。方法采用Benjamini—Hochberg(BH)法對(duì)源于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)(TheCancerGenomeAtlas)的256例敏感
2、和耐藥患者的卵巢癌全基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行差異表達(dá)基因篩選。采用DAVID軟件中的KEGG模塊對(duì)篩選出的差異基因進(jìn)行通路富集,篩選出P<0.05的通路,對(duì)篩選出的通路所包含的基因采用成組f檢驗(yàn)找出差異顯著的基因(P<0.05)。對(duì)篩選出的基因采用COREMINE工具進(jìn)行文本挖掘,找出與多藥耐藥及腫瘤耐藥存在線性相關(guān)的基因,將其與患者預(yù)后進(jìn)行分析,確定存在差異顯著的基因。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)所篩選出的基因在裸鼠誘導(dǎo)耐藥模型不同給藥階段的表達(dá)變化情況。結(jié)果BH法共篩選出306個(gè)差異表達(dá)基因,其中上調(diào)基因110個(gè),下調(diào)基因196個(gè)。DAVID軟件的KEGG模塊分
3、別篩選出5條上調(diào)及4條下調(diào)通路,成組t檢驗(yàn)篩選出有差異的基因共37個(gè),其中上調(diào)基因18個(gè),下調(diào)基因19個(gè)。COREMINE工具檢索出與多藥耐藥及腫瘤耐藥存在線性相關(guān)的上調(diào)基因?yàn)镮TPA、IMPDH2、RPS7、PDE5A和PDE4D,下調(diào)基因?yàn)镚NAS、CFTR、BUB3、PRKDC、RBL2、SMC1A、CALR、CCNE2及CHEK1。生存分析結(jié)果提示CALR及PRKDC基因的表達(dá)與患者生存時(shí)間有關(guān),CALR和PRKDC基因高表達(dá)組的患者生存時(shí)間長(zhǎng)于低表達(dá)組。qRTPCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn),CALR和PRKDC基因隨順鉑注射次數(shù)增多,在SKOV3一GFP及SKOV3
4、/DDPii腫瘤組織中的表達(dá)量逐漸降低。結(jié)論CALR與PRKDC基因可能與卵巢癌鉑類耐藥及患者的預(yù)后密切相關(guān),且隨著耐藥的產(chǎn)生,CALR和PRKDC基因的表達(dá)量逐漸降低?!娟P(guān)鍵詞】卵巢腫瘤;卵巢上皮性癌;耐藥相關(guān)基因;順鉑;基因表達(dá);動(dòng)態(tài)變化【中圖分類號(hào)】R737.31【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A【文章編號(hào)】1674—5671(2013)0306D0I:10.3969/j.issn.1674—5671.2013.03.05DynamicexpressionofresistancegenesduringCisplatinresistanceprocessofovarianc
5、an-CerSHILi—jun,YUHong—ji,LILi,WANGQi(DepartmentofResearch,AfiliatedTumorHospitalofGuangxiMedicalUniversity:DepartmentofGynecologicalOneology,AffiliatedTumorHospitalofGuangxiMedicalUniversity,Nanning530021,P.R.China)Correspondingauthor:WANGQi.E—mail:qi—eatcat@163.con【基金項(xiàng)目】廣西科學(xué)研究與技術(shù)開
6、發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(桂科攻1140003A一34);廣西醫(yī)學(xué)科學(xué)實(shí)驗(yàn)中心開放基金資助項(xiàng)目(KFJJ2010.3)【通信作者】王琪。E-mail:qi—catcat@163.corn2001,127(8):482-488.[13]WongN,LaiP,PangE,eta1.Genomicaberrationsinhumanhepato—[12]MoinzadehP,BreuhahnK,SttitzerH,eta1.Chrom08omeaheraii0nscellularcarcinomasofdifferingetiologies[J].ClinCancerRes,20
7、00,inhumanhepatocellularcarcinomaseorel~ewithaetiologyandhis-6(10):4000—4009.tologicalgrade-resultsofanexplorativeCGHmeta—analysis[J].BrJ[2013.07.19收稿][2013.09.02修回][編輯游雪梅]Cancer,2005,92(5):935.941.中國(guó)癌癥防治雜志2013g-9月第5卷第3期ChinJofOneolPreyandTreat,Sep2013,Vo1.5,No.3·211·【Abstract】Objec
8、tiveTostudythedynam