肉食螨論文：基于線粒體coⅰ和12srrna基因的常見肉食螨系統分析

《肉食螨論文：基于線粒體coⅰ和12srrna基因的常見肉食螨系統分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內容在學術論文-天天文庫。

1、肉食螨論文：基于線粒體COⅠ和12SrRNA基因的常見肉食螨系統分析【中文摘要】本論文基于線粒體COⅠ基因、12SrRNA基因對肉食螨亞科常見的3屬5種肉食螨(馬六甲肉食螨、強壯肉食螨、轉開肉食螨、鱗翅觸足螨及中華真扇毛螨)的系統關系進行分析,主要研究內容和結果如下：1、五種肉食螨的COⅠ基因系統分析對五種肉食螨的堿基組成研究發(fā)現,堿基組成存在明顯的偏向性,A+T含量明顯高于G+C含量,這一現象在其他無脊椎動物線粒體DNA序列中也普遍存在；對五種肉食螨的COⅠ基因序列進行對比,可以看出：在核苷酸位點中,沒有插入、缺失及終止密碼子出現,共檢測到348個變異位點,179個簡約信息位點。從mtD

2、NA-COI分子水平上對馬六甲肉食螨與近緣種間的遺傳關系的初步研究表明：馬六甲肉食螨與強壯肉食螨親緣關系非常近,兩者遺傳距離為0～0.039,屬于馬六甲肉食螨9個不同地理種群間的遺傳距離范圍內；從變異位點來分析,馬六甲肉食螨與強壯肉食螨COⅠ基因序列差異非常小,共有44個變異位點,僅增加8個新的變異位點；從系統進化樹來看,強壯肉食螨5個地理種群聚在馬六甲肉食螨9個地理種群內,而不是獨立成一支,并且采自同一地區(qū)的這兩種螨首先聚在一起,然后不同地理種群的這兩種螨聚在一起,再與轉開肉食螨聚在一起,故認為強壯肉食螨與馬六甲肉食螨差異是屬于種內水平。在對肉食螨線粒體DNA的COⅠ基因序列進行測定和分

3、析的基礎上,對肉食螨亞科5種肉食螨包括肉食螨屬3種、觸足螨屬1種和真扇毛螨屬1種,構建了分子系統發(fā)育樹,從NJ和MP樹顯示,拓撲結構一致,肉食螨科3個屬間的系統關系為(肉食螨屬+觸足螨屬)+真扇毛螨屬；5種肉食螨的系統關系為{+鱗翅觸足螨}+中華真扇毛螨。2、五種肉食螨的12SrRNA基因系統分析對五種肉食螨的12SrRNA基因部分序列進行測定和分析。擴增的片段在堿基組成存在明顯的偏向性,A+T含量明顯高于G+C,這一現象也在其他蜱螨類中普遍存在。馬六甲肉食螨6個不同地理種群的基因序列僅有一個堿基的差異,轉開肉食螨的2個地理種群沒有差異,遺傳分化程度很小,肉食螨屬內不同種之間(遺傳距離為0

4、-0.047)和不同屬之間(遺傳距離為0.074-0.118)有一定的分化現象,并且置信度較高,表明12SrRNA基因序列適合作為肉食螨種間、屬間系統發(fā)生研究的分子標記,預示該基因不適合用于肉食螨種下遺傳分化的分子標記?；?2SrRNA基因分子水平上對五種肉食螨遺傳關系的初步研究表明：馬六甲肉食螨與強壯肉食螨親緣關系非常近,同一地理種群的兩種肉食螨的序列是完全相同的,而馬六甲肉食螨與另外三種肉食螨在系統進化樹上可以很好的分開。故認為強壯肉食螨與馬六甲肉食螨是屬于種內水平。從NJ、MP系統樹看出,肉食螨屬的三種肉食螨首先聚在一起,然后與觸足螨屬的鱗翅觸足螨聚在一起,再與真扇毛螨屬的中華真扇

5、毛螨聚在一起?；?2SrRNA基因構建的系統樹顯示肉食螨科3屬間關系為：(肉食螨屬+觸足螨屬)+真扇毛螨屬?！居⑽恼縏hisdissertationdealswiththephylogeneticrelationshipsamong5speciesof3generaofcheyletids(Cheyletusmalaccensis,Cheyletusfortis,Cheyletusaversor,CheletomorphalepidopterorumandEucheyletiasinensis)byusingthemitochondrialCOⅠgeneand12SrRNAgene.

6、Themaincontentsandresultsareasfollows:1SystemsanalysisbasedonCOⅠgeneoffivespeciesofcheyletidsTheresearchoffivespeciesofcheyletidspresentobviousbiasinbasecomposition,A+TcontentissignificantlyhigherthanthatofG+C.ThisphenomenonisalsocommoninotherinvertebratesmitochondrialDNAsequences.TheCOⅠgenesequen

7、ceoffivespeciesofcheyletidsshowsthat:Therearenoinsertion/deletion/terminationcodonsinnucleotidesites.348variablesitesand179parsimonyinformativesitesaredetected.PreliminarystudyofCheyletusmalaccensisgeneticrelatio