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《谷子AuxIAA家族基因干旱脅迫響應(yīng)表達(dá)模式分析.pdf》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、中國科技論文在線http://www.paper.edu.cn谷子Aux/IAA家族基因干旱脅迫響應(yīng)表達(dá)模#式分析1211341,2**劉晶,王俊杰,程璐,陳利青,禾璐,候蕊,韓淵懷5(1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山西太谷030801;2.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生物工程研究所,山西太谷030801;3.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院玉米研究所,山西忻州034000;4.山西省晉城市城區(qū)農(nóng)業(yè)委員會,山西晉城048400)10摘要:Aux/IAA是重要的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄因子,廣泛參與植物生長素介導(dǎo)的應(yīng)答作用,同時參與植物的脅迫和防御響應(yīng)。本文
2、通過分析Aux/IAA家族基因在干旱脅迫中的表達(dá)情況,探索谷子的抗旱與Aux/IAA家族基因的關(guān)系。本文對谷子Aux/IAA家族基因理化性質(zhì)、蛋白親疏水性、啟動子功能元件等進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并對抗旱(GG)和干旱敏感(JF16)谷子品種在澆水和干旱脅迫下基因的表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。結(jié)果顯示:谷子Aux/IAA家族基因均15含有多個與脅迫相關(guān)的功能元件,且5個基因編碼的蛋白均為親水性蛋白;干旱脅迫處理后,GG和JF16中5個基因的表達(dá)變化趨勢有所不同,Seita.5G126200、Seita.1G02840
3、0、Seita.3G109400表達(dá)量均下調(diào),Seita.1G356800基因的表達(dá)量明顯上調(diào)。谷子Aux/IAA家族基因參與調(diào)控谷子干旱脅迫,且其調(diào)控過程比較復(fù)雜,可作為參與谷子抗旱的候選基因。本研究結(jié)果為進(jìn)一步探究谷子中Aux/IAA與抗旱機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。20關(guān)鍵詞:谷子;Aux/IAA;干旱脅迫;生物信息學(xué)分析中圖分類號:S515ExpressionanalysisofAux/IAAfamilymembersinresponsetodroughtstressinfoxtailmillet12113
4、425LIUJing,WANGJunjie,CHENGLu,CHENLiqing,HELu,HOURui,HAN1,2Yuanhuai(1.CollegeofAgriculture,ShanxiAgricultureUniversity,Taigu030801,China;2.InstituteofAgriculturalBioengineering,ShanxiAgricultureUniversity,Taigu030801,China;3.MaizeResearchInstitutetoShanxi
5、AcademyofAgricultureSciences,Xinzhou034000,China;304.UrbanAgricultureCommitteeofShanxiJincheng,Jincheng048400,China)Abstract:Aux/IAAisanimportanttranscriptionfactorprotein.Itiswidelyinvolvedinplantauxin-mediatedresponse,plantstressanddefenseresponse.There
6、lationshipbetweendroughtresistanceandAux/IAAfamilymemberswasstudiedbyanalyzingtheexpressionofAux/IAAfamilymembersunderdroughtstressinfoxtailmillet.Thebioinformaticsanalysiswascarriedouton35thephysicochemicalproperties,proteinhydrophobicityandcis-actingele
7、mentsoftheAux/IAAfamilymembersinfoxtailmillet.ThenweanalyzedtheexpressionofAux/IAAfamilymembersunderdroughtstress.Theresultsshowedthattherewereanumberofstress-relatedfunctionalelementsintheAux/IAAfamilymembersinfoxtailmille,andtheproteinstheycodewereallhy
8、drophilic.Theexpressionlevelsofgenesweresignificantlydifferentbetweendrought-tolerantanddrought-sensitive40varietiesunderdroughtstress.TheexpressionlevelsofSeita1.5G126200,Seita.1G028400andSeita.3G109400weredown-reg