茶樹(shù)亞硝酸還原酶基因csnir的克隆及表達(dá)分析

茶樹(shù)亞硝酸還原酶基因csnir的克隆及表達(dá)分析

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1、園藝學(xué)報(bào),2016,43(7):1348–1356.ActaHorticulturaeSinica1348doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0324;http://www.ahs.ac.cn茶樹(shù)亞硝酸還原酶基因CsNiR的克隆及表達(dá)分析*張芬,王麗鴛,成浩,韋康,胡娟,張成才,劉圓,吳立赟,李海琳(中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所,國(guó)家茶樹(shù)改良中心,杭州310008)摘要:以‘龍井43’茶樹(shù)葉片的cDNA為模板,利用RTPCR技術(shù)克隆了茶樹(shù)亞硝酸還原酶基因(CsNiR),得到完整的ORF全長(zhǎng)為1764bp,編碼

2、587個(gè)氨基酸;所推導(dǎo)的氨基酸序列與垂枝樺(Betulapendula)、擬南芥(Arabidopsisthaliana)、菠菜(Spinaciaoleracea)和水稻(Oryzasativa)的同源性均大于76%。生物信息學(xué)分析表明,CsNiR分子量為68.648kD,等電點(diǎn)為6.12,為親水性的非分泌蛋白;二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)顯示,CsNiR具有完整的NiR蛋白結(jié)構(gòu),含血紅素蛋白β–化合物區(qū)域和4Fe-4S區(qū)域。實(shí)時(shí)熒光定量結(jié)果表明,該基因在成熟葉片中表達(dá)量高于一芽二葉和根。采用營(yíng)養(yǎng)液水培3個(gè)茶樹(shù)品種,-1在氮饑餓兩周后分別供應(yīng)正常氮素和低

3、氮素(1和0.1mmol·LNH4NO3),qRT-PCR測(cè)定發(fā)現(xiàn),正常氮素處理的2h和6h,誘導(dǎo)根CsNiR表達(dá)量顯著增加,葉片中的表達(dá)量變化延遲到24h之后,且變化幅度存在基因型之間的差異;低氮處理對(duì)CsNiR表達(dá)量的影響相對(duì)較小。因此,研究CsNiR基因的表達(dá)特性及其在茶樹(shù)氮素利用中所發(fā)揮的作用,需結(jié)合茶樹(shù)基因型、組織部位、供氮水平等進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)。關(guān)鍵詞:茶樹(shù);亞硝酸還原酶;克隆;基因表達(dá);氮素中圖分類號(hào):S571.1文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):0513-353X(2016)07-1348-09MolecularCloningandExp

4、ressionAnalysisofNitriteReductaseGeneCsNiRinTeaPlant*ZHANGFen,WANGLi-yuan,CHENGHao,WEIKang,HUJuan,ZHANGCheng-cai,LIUYuan,WULi-yun,andLIHai-lin(TeaResearchInstitute,theChineseAcademyofAgriculturalSciences,NationalCenterforTeaImprovement,Hangzhou310008,China)Abstract:Teanitr

5、itereductase(CsNiR)wasclonedbyRT-PCRfromcDNAisolatedfromleavesofcultivar‘Longjing43’.ThecompleteORFoftheCsNiRwas1764bpencoding587aminoacids.AlignmentofaminoacidsequencesshowedthatCsNiRsharingmorethan76%similaritiestoNiRinBetulapendula,Arabidopsisthaliana,Spinaciaoleraceaan

6、dOryzasativa.BioinformaticsanalysisindicatedthattheCsNiRwasahydrophilicnon-secretoryproteinwithmolecularweight68.648kDandtheoreticalpI6.12.PredictionresultsbyInterProScanshowedthesecondarystructureofCsNiRproteincomprisedofahemoproteinbetacomponentanda4Fe-4Sregion,andits3Ds

7、tructurewasalsopredicted收稿日期:2016–05–26;修回日期:2016–07–05基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31570695);國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金項(xiàng)目(CARS-23);浙江省農(nóng)業(yè)新品種選育重點(diǎn)專項(xiàng)(2012C2905-4)*通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:chenghao@tricaas.com)張芬,王麗鴛,成浩,韋康,胡娟,張成才,劉圓,吳立赟,李海琳.茶樹(shù)亞硝酸還原酶基因CsNiR的克隆及表達(dá)分析.園藝學(xué)報(bào),2016,43(7):1348–13

8、56.1349bySwissModel.qRT-PCRanalysisrevealedthattheexpressionabundanceofCsNiRinmatureleave

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