雞hmgcr基因多態(tài)性及其與經(jīng)濟性狀相關(guān)性研究

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1、河南農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文雞HMGCR基因多態(tài)性及其與經(jīng)濟性狀相關(guān)性研究姓名:魏楊申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)指導(dǎo)教師:王清義;康相濤201205河南農(nóng)業(yè)大學(xué)2012屆碩士學(xué)位論文摘要3-羥基一3-甲基戊二酸單酰輔酶A還原酶(HMGCR)是膽固醇生物合成過程中的限速酶,并且在內(nèi)源膽固醇生物合成途徑中扮演著重要的角色。本研究中,我們以HMGCR基因為候選基因,使用DNA池測序技術(shù)、PCR擴增技術(shù)、PCR-RFLP技術(shù)和CRS.PCR-RFLP技術(shù)在固始雞一安矗雞F2代資源群及絲毛烏骨雞中檢測遺傳變異情況,

2、并分析了該基因的突變位點與固始雞.安卡雞F2代資源群主要經(jīng)濟性狀和絲毛烏骨雞蛋品質(zhì)及雞蛋膽固醇含量之間的關(guān)聯(lián)性。主要結(jié)果如下:‘1、在固始雞.安卡雞F2代資源群中,在雞3.羥基.3,甲基戊二酸單酰輔酶A還原酶基因上檢測到51個SNPs,具體分析了其中的3個。其中A5816T位點位于內(nèi)含子8內(nèi);G12217T位點處于外顯子17上,導(dǎo)致了谷氨酸一組氨酸的錯義突變;T12684C位點位于外顯子18上i其引起了脯氨酸的同義突變。通過PCR—RFLP或CRS—PCR-RFLP法,對A5816T、G12217T●和T12684

3、C進行分析。群體遺傳學(xué)表明:A5816T、G12217T和T12684C突變位點多態(tài)信息含量均為中度多態(tài)位點;這三個位點的雜合度分別為0.4915、0.4546、0.4774。2、對3個酶切位點多態(tài)性與固始雞.安卡雞資源群F2代群體主要經(jīng)濟性狀關(guān)聯(lián)分析表明,HMGCR基因A5816T位點兩種基因型與出生重、12周齡體重、12周齡胸骨長、8周齡胸深、腿肌剪切力、胸肌剪切力、腿肌纖維直徑、堿性磷酸酶、低密度脂蛋白和乳酸脫氫酶顯著相關(guān)(P<0.1).G12217T位點對屠體重、半凈膛重、全凈膛重、頭重、爪重、心臟重、脾臟

4、重、腿重、腿肌重、爪率、雙翅率、2,4,6,8,10,12周齡體重、12周齡脛長、12周齡脛圍,8,12周齡盆骨寬、4,8,12周齡體斜長、4,8,12周齡胸骨長、腿肌纖維密度、腿肌纖維直徑、胸肌纖維圓度、胸肌纖維直徑、堿性磷酸酶、乳酸脫氫酶、總蛋白和低密度脂蛋白具有顯著影響(P<0.1);T12684C位點不同基因犁對半凈膛重、心臟重、腿肌重、胰腺率、2,4,6,8,12周齡體重、8周齡脛K、4,8,12周齡脛圍、4,12周齡體斜長、12周齡胸骨長、腹脂率、腿肌纖維密度、谷草轉(zhuǎn)氨酶、總蛋白、白蛋白、球蛋白、膽堿酯

5、酶、甘油三酯、乳酸脫氫酶具有顯著影響(P<0.1)。3、在絲毛烏骨雞中驗證雞3.羥基.3.甲基戊■酸單酰輔酶A還原酶基因G12217T和T12684C兩個突變位點,群體遺傳學(xué)表明:G12217T和T12684C突變位點多態(tài)信息含量均為中度多態(tài)位點;這三個位點的雜合度分別為0.499、O.504。4、對2個突變位點多態(tài)性與絲毛烏骨雞蛋品質(zhì)及雞蛋膽固醇含量的關(guān)聯(lián)性進行分析表明,G12217T突變位點僅對雞蛋中膽固醇含量具有顯著的影響(P<0.1);T12684C突變位點三種基因型與蛋黃重顯著相關(guān)(P

6、固始雞一安卡雞資源群Fz代群體:絲毛烏骨雞;3.羥基.3.甲基戊二酸單酰輔酶A還原酶基因(HMGCR)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)『;關(guān)聯(lián)分析河南農(nóng)業(yè)大學(xué)2012屆碩士學(xué)位論文AbstractThe3-hydroxy一3一methylglutarylcoenzymeAreductase(HNIGCR)istherate—limitingenzymeatthemetabolismofcholesterol,anditPlaysanimPortantroleinthePathwayofendogenouscholeste

7、rolbiosynthesis.Inthisstudy,HMGcRwastakenaSacandidate,andDNAsequencingtechnology,PCRamPlification,PCR-RFLPandtheCreatedRestrictionSitePCR-IⅫLP(CRS-PCR-RFLP)methodwereusedtodetectgeneticvariationintheF2resourcePoPulationofGushichickenandAnkabroilersandsilkies,a

8、ndtheassoiationanalysisofthePolyPhorismsinthegenes.withtheeconomictraitsandwasPerformedusingtheleast-squaresanalysis.‘nlemainresultsareasfollows:1.IntheF2resourcePoPulationofGushic

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