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《馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲線粒體全基因組擴(kuò)增與序列分析》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、Universitycode:10223Classifiedcode:S855.9Graduatenumber:XS1233083Confidentialdegree:PublicHeilongjiangBayiAgriculturalUniversityMasterDissertationResearchoncompletemitochondrialgenomeandmolecularphylogenyofStrongylusequinusandOxyurisequiPostgraduate:XuWenwenSupervisor:ProfessorWangChun-Ren
2、Major:VeterinaryPreventionScienceMolecularparasitology&ParasitosisResearchdirection:ControlCollege:GraduateCollegeDaqingChinaJune,2015摘要馬圓形線蟲(Strongylusequinus)是寄生于馬、騾、驢等馬屬動物結(jié)腸和盲腸內(nèi)的一種線蟲,引起貧血、腹瀉、水腫等癥狀。馬尖尾線蟲(Oxyurisequi)俗稱馬蟯蟲,也寄生于馬、驢等馬屬動物的結(jié)腸和盲腸內(nèi),引起胃腸道障礙、營養(yǎng)不良、消瘦等癥狀。感染兩種線蟲均能導(dǎo)致馬屬動物生產(chǎn)性能的下降,且廣泛流行
3、于世界各地,給畜牧業(yè)生產(chǎn)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。目前對馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲的研究僅限于蟲體形態(tài)學(xué)、流行病學(xué)、病原診斷及綜合防治等方面,而關(guān)于兩者的線粒體基因組序列分析及進(jìn)化的研究還未見報道。本研究首先從自然感染的馬大腸內(nèi)采集馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲蟲體,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定后,采用步移PCR方法擴(kuò)增馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲線粒體全基因組,同時進(jìn)行序列分析。結(jié)果表明,獲得的馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲線粒體基因組全長分別為14545bp和13641bp,均含有12個蛋白編碼基因(protein-codinggene)、2個rRNA基因(rRNAgene)、22個tRNA基因以及分別為3個(馬圓形
4、線蟲)和1個(馬尖尾線蟲)非編碼區(qū)(noncodingregion)。馬圓形線蟲線粒體全基因組核苷酸組成為:A=31.06%,G=15.72%,C=6.18%,T=47.07%,A+T含量為78.10%。馬尖尾線蟲線粒體全基因組核苷酸組成為:A=18.89%,G=26.31%,C=5.87%,T=48.93%,A+T含量為67.82%。馬圓形線蟲的線粒體基因組堿基組成明顯偏好堿基T和A,而馬尖尾線蟲明顯偏好堿基T和G,二者的線粒體全基因組中堿基T的含量最高,堿基C的含量最低。馬圓形線蟲的基因排列順序?qū)貵A3型,馬尖尾線蟲的基因排列順序?qū)貵A13型。其次,利用線粒體基因組12
5、個蛋白質(zhì)編碼基因的氨基酸序列構(gòu)建進(jìn)化系統(tǒng)發(fā)生樹,探討馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲在線蟲中的分類地位。以串聯(lián)的12個蛋白質(zhì)編碼基因氨基酸序列為基因標(biāo)記,采MP、ML及BI法分別對兩種蟲體構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。馬圓形線蟲的進(jìn)化樹形成兩個大的分支,寄生于消化系統(tǒng)的線蟲為一個分支,寄生于呼吸系統(tǒng)的為另一分支;馬圓形線蟲位于消化系統(tǒng)的分支上,與普通圓線蟲的親緣關(guān)系最近。馬尖尾線蟲進(jìn)化樹也形成兩個大的分支,絲蟲目為一個分支,蛔目、圓形目和尖尾目為另一分支,且各目又單獨形成一個小的分支,馬尖尾線蟲位于尖尾目的分支上,與Wellcomiasiamensis和蠕形住腸線蟲有較近的親緣關(guān)系。通過本研究,首
6、次獲得了馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲的線粒體全基因組序列,進(jìn)一步豐富了寄生線蟲的線粒體基因組庫。同時,基于線粒體基因氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹,-I-從分子水平上探討馬圓形線蟲和馬尖尾線蟲在線蟲中的分類地位和進(jìn)化關(guān)系。關(guān)鍵詞,馬圓形線蟲;馬尖尾線蟲;線粒體全基因組;系統(tǒng)發(fā)生IIAbstractStrongylusequinusisthemostcommonblood-feedingnematodesinthececaandcolonofequus(suchashorses,mulesanddonkey),whichmayleadtoanemia,diarrheaandedema.
7、Oxyurisequiisknownaspinworm,whichalsoinhabitlargeintestinalofequus,whichmaycauserapidweightloss,malnutritionandgastrointestinaldysfunction.S.equinusandO.equinematodescandecreaseproductionperformanceinequus,andthetwonematodediseasesareworldwidedistribution,sowh