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《馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)線粒體全基因組擴(kuò)增與序列分析》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、Universitycode:10223Classifiedcode:S855.9Graduatenumber:XS1233083Confidentialdegree:PublicHeilongjiangBayiAgriculturalUniversityMasterDissertationResearchoncompletemitochondrialgenomeandmolecularphylogenyofStrongylusequinusandOxyurisequiPostgraduate:XuWenwenSupervisor:ProfessorWangChun-Ren
2、Major:VeterinaryPreventionScienceMolecularparasitology&ParasitosisResearchdirection:ControlCollege:GraduateCollegeDaqingChinaJune,2015摘要馬圓形線蟲(chóng)(Strongylusequinus)是寄生于馬、騾、驢等馬屬動(dòng)物結(jié)腸和盲腸內(nèi)的一種線蟲(chóng),引起貧血、腹瀉、水腫等癥狀。馬尖尾線蟲(chóng)(Oxyurisequi)俗稱馬蟯蟲(chóng),也寄生于馬、驢等馬屬動(dòng)物的結(jié)腸和盲腸內(nèi),引起胃腸道障礙、營(yíng)養(yǎng)不良、消瘦等癥狀。感染兩種線蟲(chóng)均能導(dǎo)致馬屬動(dòng)物生產(chǎn)性能的下降,且廣泛流行
3、于世界各地,給畜牧業(yè)生產(chǎn)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。目前對(duì)馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)的研究?jī)H限于蟲(chóng)體形態(tài)學(xué)、流行病學(xué)、病原診斷及綜合防治等方面,而關(guān)于兩者的線粒體基因組序列分析及進(jìn)化的研究還未見(jiàn)報(bào)道。本研究首先從自然感染的馬大腸內(nèi)采集馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)蟲(chóng)體,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定后,采用步移PCR方法擴(kuò)增馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)線粒體全基因組,同時(shí)進(jìn)行序列分析。結(jié)果表明,獲得的馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)線粒體基因組全長(zhǎng)分別為14545bp和13641bp,均含有12個(gè)蛋白編碼基因(protein-codinggene)、2個(gè)rRNA基因(rRNAgene)、22個(gè)tRNA基因以及分別為3個(gè)(馬圓形
4、線蟲(chóng))和1個(gè)(馬尖尾線蟲(chóng))非編碼區(qū)(noncodingregion)。馬圓形線蟲(chóng)線粒體全基因組核苷酸組成為:A=31.06%,G=15.72%,C=6.18%,T=47.07%,A+T含量為78.10%。馬尖尾線蟲(chóng)線粒體全基因組核苷酸組成為:A=18.89%,G=26.31%,C=5.87%,T=48.93%,A+T含量為67.82%。馬圓形線蟲(chóng)的線粒體基因組堿基組成明顯偏好堿基T和A,而馬尖尾線蟲(chóng)明顯偏好堿基T和G,二者的線粒體全基因組中堿基T的含量最高,堿基C的含量最低。馬圓形線蟲(chóng)的基因排列順序?qū)貵A3型,馬尖尾線蟲(chóng)的基因排列順序?qū)貵A13型。其次,利用線粒體基因組12
5、個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因的氨基酸序列構(gòu)建進(jìn)化系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),探討馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)在線蟲(chóng)中的分類(lèi)地位。以串聯(lián)的12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因氨基酸序列為基因標(biāo)記,采MP、ML及BI法分別對(duì)兩種蟲(chóng)體構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)。馬圓形線蟲(chóng)的進(jìn)化樹(shù)形成兩個(gè)大的分支,寄生于消化系統(tǒng)的線蟲(chóng)為一個(gè)分支,寄生于呼吸系統(tǒng)的為另一分支;馬圓形線蟲(chóng)位于消化系統(tǒng)的分支上,與普通圓線蟲(chóng)的親緣關(guān)系最近。馬尖尾線蟲(chóng)進(jìn)化樹(shù)也形成兩個(gè)大的分支,絲蟲(chóng)目為一個(gè)分支,蛔目、圓形目和尖尾目為另一分支,且各目又單獨(dú)形成一個(gè)小的分支,馬尖尾線蟲(chóng)位于尖尾目的分支上,與Wellcomiasiamensis和蠕形住腸線蟲(chóng)有較近的親緣關(guān)系。通過(guò)本研究,首
6、次獲得了馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)的線粒體全基因組序列,進(jìn)一步豐富了寄生線蟲(chóng)的線粒體基因組庫(kù)。同時(shí),基于線粒體基因氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),-I-從分子水平上探討馬圓形線蟲(chóng)和馬尖尾線蟲(chóng)在線蟲(chóng)中的分類(lèi)地位和進(jìn)化關(guān)系。關(guān)鍵詞,馬圓形線蟲(chóng);馬尖尾線蟲(chóng);線粒體全基因組;系統(tǒng)發(fā)生IIAbstractStrongylusequinusisthemostcommonblood-feedingnematodesinthececaandcolonofequus(suchashorses,mulesanddonkey),whichmayleadtoanemia,diarrheaandedema.
7、Oxyurisequiisknownaspinworm,whichalsoinhabitlargeintestinalofequus,whichmaycauserapidweightloss,malnutritionandgastrointestinaldysfunction.S.equinusandO.equinematodescandecreaseproductionperformanceinequus,andthetwonematodediseasesareworldwidedistribution,sowh