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《spm5_自學(xué)自練手冊(cè)》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫(kù)。
1、Lab1常用數(shù)據(jù)處理軟件的安裝和介紹實(shí)驗(yàn)內(nèi)容òMatlab7.1介紹μ主界面μ基本命令òSPM5安裝以及界面，功能介紹μ安裝μ界面μ大致功能òMRIcron基本使用方法μ安裝μ圖像顯示μDICOM數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換所需軟件1.Matlab(version:7.1R14)2.SPM5(updates_958)3.MRIcron(version:beta7)Matlab7.1介紹1.Matlab主界面在所有實(shí)驗(yàn)中，我們都將使用Matlab7.1軟件包(TheMathWorks,Inc.)。在安裝完畢后，雙擊快捷方式圖標(biāo)打
2、開(kāi)Matlab。點(diǎn)擊Matlab窗口上方的View菜單，勾選CommandWindow,CommandHistory,CurrentDirectory和Workspace。這時(shí)，Matlab將呈現(xiàn)四個(gè)子窗口：1)CommandWindow：位于右下方。即指令窗口，是鍵入指令的地方，也是Matlab顯示計(jì)算結(jié)果的地方；2)CommandHistory：位于左下方。即歷史命令窗口，存放歷史輸入命令；3)CurrentDirectory：位于左上方。即當(dāng)前工作目錄，顯示當(dāng)前目錄下的文件信息；4)Workspace：位
3、于右上方。即工作空間，存放變量在內(nèi)存中。Fig.1就是Matlab的標(biāo)準(zhǔn)工作界面，上述四個(gè)子窗口可以自由拖動(dòng)改變位置。Fig.1Matlab7.1的主界面此時(shí)，Matlab處于準(zhǔn)備接受命令的狀態(tài)，可以在命令窗口（右下方的子窗口）中直接輸入命令語(yǔ)句。2.Matlab基本命令1.設(shè)置當(dāng)前工作路徑(currentdirectory)1)在Windows下建立一個(gè)新文件夾，如：D:workdicom_convert2)在Matlab的指令窗口中鍵入：cd‘D:workdicom_convert’這樣，就將M
4、atlab的當(dāng)前工作路徑設(shè)置在上述路徑下了。3)在Matlab的指令窗口中鍵入：“pwd”，然后回車(chē)4)這時(shí)，Matlab的指令窗口中顯示出當(dāng)前工作路徑信息：ans=D:workdicom_convert2.添加搜索路徑(setpath)1)點(diǎn)擊Matlab最上方的“File”菜單，在下拉菜單中選擇“SetPath”2)在彈出的路徑設(shè)置窗口中選擇“AddwithSubfolders”，瀏覽并點(diǎn)選目標(biāo)文件夾（如Fig.2所示），然后點(diǎn)“確定”3)點(diǎn)擊“Save”按鈕4)檢查該路徑是否添加到右側(cè)的搜索路徑列表
5、中5)點(diǎn)擊“Close”按鈕Fig.2添加搜索路徑3.其他常用命令及功能1)load載入變量到內(nèi)存2)clear清除內(nèi)存中所有的變量3)clc清屏4)exit退出Matlab5)helpwin打開(kāi)幫助窗口SPM5介紹和安裝SPM5是一款功能強(qiáng)大的神經(jīng)影像計(jì)算軟件，由WellcomeDepartmentofImagingNeuroscience小組開(kāi)發(fā)，可以對(duì)PET,EEG,fMRI等圖像進(jìn)行處理。對(duì)fMRI數(shù)據(jù)的處理可以由預(yù)處理，個(gè)體統(tǒng)計(jì)分析，組分析來(lái)實(shí)現(xiàn)。將SPM5程序解壓縮后，得到一個(gè)名為“spm5”的文件
6、夾，文件夾里含有若干子文件夾和許多文件。假設(shè)這個(gè)文件夾在“D:spm5”目錄下，下面介紹如何安裝及打開(kāi)SPM5。1.打開(kāi)Matlab7.1，將SPM5所在目錄“D:spm5”加入到Matlab的搜索路徑中（利用“添加搜索路徑”所示的方法，將spm5及其所有子文件夾添加到Matlab的搜索路徑中）；2.在Matlab指令窗口中輸入“spmfmri”，會(huì)出現(xiàn)三個(gè)窗口；3.屏幕左上方的窗口是SPM5的按鈕窗口，如圖Fig.3：Fig.3按鈕窗口Fig.4左下方的窗口4.屏幕左下方的窗口可以控制結(jié)果呈現(xiàn)，也可輸入用
7、戶指定的參數(shù)(Fig.4)5.屏幕右邊的窗口是交互窗口(Fig.5)，用戶可以在這個(gè)窗口中進(jìn)行處理流程指定。該窗口左側(cè)一欄用樹(shù)型結(jié)構(gòu)顯示處理流程，雙擊可以擴(kuò)展和縮起分支（用+/-表示），需要用戶指定參數(shù)的處理項(xiàng)目用“X”表示，整個(gè)處理流程可以用該窗口內(nèi)的“Save”,“Load”,“Run”按鈕進(jìn)行保存，調(diào)入和執(zhí)行。該窗口右上方一欄表示當(dāng)前處理項(xiàng)目的可選子項(xiàng)，F(xiàn)ig.5交互窗口Fig.6文件選擇窗口用戶可以在這里改變處理流程，也可以輸入指定數(shù)值。該欄下方是當(dāng)前項(xiàng)目的數(shù)值的顯示欄。最下方一欄是幫助欄，顯示當(dāng)前處理
8、項(xiàng)目的信息。6.SPM5有時(shí)會(huì)彈出文件選擇窗口(Fig.6)，用戶可以選擇指定的文件進(jìn)行分析和處理。MRIcron軟件的基本使用MRIcron軟件可以進(jìn)行MRI圖像的顯示，疊加，也可以使用它附帶的軟件進(jìn)行DICOM原始數(shù)據(jù)的格式轉(zhuǎn)換，下面分別介紹：1.安裝：解壓后雙擊“InstallMR.exe”進(jìn)行MRIcron的安裝，安裝時(shí)選擇全部安裝。完畢后進(jìn)入安裝路徑，雙擊“mricron.e
