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1、FISH-熒光原位雜交實驗(原位雜交)1.實驗?zāi)康摹 ⊥ㄟ^實驗了解熒光原位雜交技術(shù)的基本原理和在生物學(xué)、醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。掌握原位雜交技術(shù)的操作方法,熟練掌握熒光顯微鏡的使用方法。2.實驗原理 熒光原位雜交(FluorescenceinsituhybridizationFISH)是一門新興的分子細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù),是20世紀(jì)80年代末期在原有放射性原位雜交技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種非放射性原位雜交技術(shù)。目前這項技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動植物基因組結(jié)構(gòu)研究、染色體精細(xì)結(jié)構(gòu)變異分析、病毒感染分析、人類產(chǎn)前診斷、腫瘤遺傳學(xué)和基因組進(jìn)化研究等許多領(lǐng)域。FIS
2、H的基本原理是用已知的標(biāo)記單鏈核酸為探針,按照堿基互補的原則,與待檢材料中未知的單鏈核酸進(jìn)行特異性結(jié)合,形成可被檢測的雜交雙鏈核酸。由于DNA分子在染色體上是沿著染色體縱軸呈線性排列,因而可以將探針直接與染色體進(jìn)行雜交從而將特定的基因在染色體上定位。與傳統(tǒng)的放射性標(biāo)記原位雜交相比,熒光原位雜交具有快速、檢測信號強、雜交特性高和可以多重染色等特點,因此在分子細(xì)胞遺傳學(xué)領(lǐng)域受到普遍關(guān)注?! ‰s交所用的探針大致可以分為三類:1)染色體特異重復(fù)序列探針,例如a衛(wèi)星、衛(wèi)星III類的探針,其雜交靶位常大于1Mb,不含散在重復(fù)序列,與靶位結(jié)合緊密,雜交信
3、號強,易于檢測;2)全染色體或染色體區(qū)域特異性探針,其由一條染色體或染色體上某一區(qū)段上極端不同的核苷酸片段所組成,可由克隆到噬菌體和質(zhì)粒中的染色體特異大片段獲得;3)特異性位置探針,由一個或幾個克隆序列組成。探針的熒光素標(biāo)記可以采用直接和間接標(biāo)記的方法。間接標(biāo)記是采用生物系標(biāo)記的dUTP(biotin-dUTP)經(jīng)過缺口平移法進(jìn)行標(biāo)記,雜交之后用藕聯(lián)的熒光素的抗生物系的抗體進(jìn)行檢測,同時還可以利用幾輪抗生物素蛋白—熒光素、生物素化的抗—抗生物素蛋白、抗生物素蛋白—熒光素的處理,將熒光信號進(jìn)行放大,從而可以檢測500bp的片段。而直接標(biāo)記法是
4、將熒光素直接與探針核苷酸蔌磷酸戊糖骨架共價結(jié)合,或在缺口平移法標(biāo)記探針時將熒光素核苷三磷酸摻入。直接標(biāo)記法在檢測時步驟簡單,但由于不能進(jìn)行信號放大,因此靈敏度不如間接標(biāo)記的方法。3.實驗用具及材料 Y染色體探針、人外周血中期染色體細(xì)胞標(biāo)本、恒溫水浴鍋、培養(yǎng)箱、染色缸、載玻片、NikonE-400、熒光顯微鏡、蓋玻片、封口膜、200mL移液器、20mL移液器、暗盒、指甲油、甲酰胺、氯化鈉、檸檬酸鈉、氫氧化鈉、吐溫20。4.實驗方法及步驟1)探針及標(biāo)本的變性(1)探針變性將探針在75℃怛溫水浴中溫育5min,立即置0℃,5~10min,使雙鏈
5、DNA探針變性。(2)標(biāo)本變性①將制備好的染色體玻片標(biāo)本于50℃培養(yǎng)箱中烤片2~3h。(經(jīng)Giemsa染色的標(biāo)本需預(yù)先在固定液中退色后再烤片)②取出玻片標(biāo)本,將其浸在70~75℃的體積分?jǐn)?shù)70%甲酰胺/2×SSC的變性液中變性2~3min。③立即按順序?qū)?biāo)本經(jīng)體積分?jǐn)?shù)70%、體積分?jǐn)?shù)90%和體積分?jǐn)?shù)100%冰乙醇系列脫水,每次5min,然后空氣干燥。2)雜交將已變性或預(yù)退火的DNA探針10mL滴于已變性并脫水的玻片標(biāo)本上,蓋上18×18蓋玻片,用Parafilm封片,置于源潮濕暗盒中37℃要交過夜(約15~17h)。由于雜交液較少,而且雜交
6、溫度較高,持續(xù)時間又長,因此為了保持標(biāo)本的濕潤狀態(tài),此過程在濕盒中進(jìn)行。3)洗脫此步驟有助于除去非特異性結(jié)合的探針,從而降低本底。(1)雜交次日,將標(biāo)本從37℃溫箱中取出,用刀片輕輕將蓋玻片揭掉。(2)將已雜交的玻片標(biāo)本放置于已預(yù)熱42~50℃的體積分?jǐn)?shù)50%甲酰胺/2×SSC中洗滌3次,每次5min。(3)在已預(yù)熱42~50℃的1×SSC中洗滌3次,每次5min。(4)在室溫下,將玻片標(biāo)本2×SSC中輕洗一下。4)雜交信號的放大(1)在玻片的雜交部位加150mL封閉液I,用保鮮膜覆蓋,37℃溫育20min。(2)去掉保鮮膜,再加150mL
7、avidin-FITC于標(biāo)本上,用保鮮膜覆蓋,37℃繼續(xù)溫育40min。(3)取出標(biāo)本,將其放入已預(yù)熱42~50℃的洗脫液中洗滌3次,每次5min。(4)在玻片標(biāo)本的雜交部位加150mL封閉液II,覆蓋保鮮膜,37℃溫育20min。(5)去掉保鮮膜,加150mLantiavidin于標(biāo)本上,覆蓋新的保鮮膜,37℃溫育40min。(6)取出標(biāo)本,將其放入已預(yù)熱42~50℃的新洗脫液中,洗滌3次,每次5min。(7)重復(fù)步驟(1)、(2)、(3),再于2×SSC中室溫清洗一下。(8)取出玻片,自然干燥。(9)取200mLPI/antifade染
8、液滴加在玻片標(biāo)本上,蓋上蓋玻片。5)封片可采用不同類型的封片液。如果封片中不含有Mowiol(可使封片液產(chǎn)生自封閉作用),為防止蓋片與載片之間的溶液揮發(fā),可使用指甲油將蓋片周圍封