基于s rdna dd區(qū)和matk基因序列分析的陽春砂分子鑒別的論文

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1、基于26SrDNAD1D3區(qū)和matK基因序列分析的陽春砂分子鑒別的論文基于26SrDNAD1D3區(qū)和matK基因序列分析的陽春砂分子鑒別的論文作者：黃瓊林,楊錦芬，段中崗，何瑞，詹若挺，徐鴻華，徐暉，陳蔚文【摘要】【目的】建立陽春砂不同栽培品種的dna分子鑒別方法，為陽春砂的優(yōu)良品種選育提供依據?！痉椒ā恳躁柎荷霸耘喾N長果、圓果、“春選”及海南砂為材料，用相應引物對26srdnad1d3區(qū)和matk基因進行聚合酶鏈反應（pcr）擴增和測序，對測序結果進行分析，尋找差異位點，并根據序列構建系統(tǒng)發(fā)生樹?！窘Y果】測序得到的26srdnad1d3序列為739bp，陽春砂與海南砂

2、在該區(qū)域存在4個堿基位點的差異。長果陽春砂與圓果陽春砂序列相同，但它們與“春選”陽春砂存在1個堿基位點的差異，根據26srdnad1d3序列建立的系統(tǒng)發(fā)生樹揭示了“春選”陽春砂與另外2個栽培品種間的區(qū)別。測序得到的matk序列為824bp，陽春砂3個栽培品種的matk序列相同，與海南砂存在1個堿基位點差異?！窘Y論】從分子水平上可鑒別陽春砂的3個栽培品種，“春選”品種比長果（或圓果）品種與海南砂有著更近的親緣關系。【關鍵詞】陽春砂基因序列分析分子鑒定abstract∶objectivetoestablishamolecularidentificationmethodforthre

3、ecultivarsofamomumvillosumlour.(avl),thustoprovidescientificevidencefortheidentification,selectionandbreedingofavl.methodsthefragmentsof26srdnad1d3regionandmatkgeneofthreecultivarsofavlandamomumlongiligularetlwuwereamplifiedbypolymerasechainreaction(pcr)andwithcorrespondingprimers,andthent

4、heirsequenceswereanalyzed,andphylogenetictreewasconstructedbasedonthesequences.resultsweobtained739bpin26srdnad1d3sequence.differencesin4basicsitesof739bpwereshownbetweenavlandamomumlongiligularetlwu.thetwocultivarsofavl,changguoandyuanguo,hadthesamesequence,buttherewasadifferenceinonebasi

5、csiteofchangguoandyuanguofromchunxuan.thephylogenetictreebasedon26srdnad1d3sequencerevealedthedifferencebetweenchunxuanandtheothertwocultivarsofavl.wealsoobtained824bpinmatkgenesequence.thethreecultivarsofavlshowedtheconsistentsequence,buttherewasadifferenceinonebasicsiteofthreecultivarsofav

6、lfromamomumlongiligularetlwu.conclusionwecanidentifythethreecultivarsofavlthroughthesequencedifferencesatthemolecularlevel,andchunxuanhasaclosergeneticrelationshipwithamomumlongiligularetlwu．keywords:amomumvillosumlour.;sequenceanalysis;molecularidentification;砂仁為我國“四大南藥”之一，來源于姜科植物陽春砂amom

7、umvillosumlour.、綠殼砂amomumvillosumlourvarxanthioidestlwuetsenjen或海南砂amomumlongiligularetlwu的干燥成果果實［1］。wWW..cOm中國藥典收載的入藥砂仁的3種藥材中以陽春砂的品質最好，為市場的主流產品［2］。本課題組在陽春砂道地產區(qū)廣東陽春市進行了陽春砂的種質資源調查，發(fā)現當地藥農在長期的生產實踐中將陽春砂栽培品種主要歸納為長果型和圓果型，除此之外，還有在陽春市砂仁試驗示范場種植的