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1、牡丹論文：牡丹EST-SSR引物開發(fā)及其親緣關(guān)系分析【中文摘要】牡丹(PaeoniasuffruticosaAndrews.)花大形美,色艷香濃,不僅具有很高的觀賞價(jià)值,而且還有極高的藥用價(jià)值。其種質(zhì)資源極為豐富,種質(zhì)資源的保存和評(píng)價(jià)是其利用的重要前提,其分子水平上的遺傳多樣性研究已取得了較大進(jìn)展。但是,在揭示種間、種內(nèi)及品種群間遺傳關(guān)系和栽培牡丹起源問題上并未取得一致性結(jié)論。因此,開發(fā)適用于牡丹的EST-SSR標(biāo)記應(yīng)用于牡丹遺傳圖譜的構(gòu)建、物種間親緣關(guān)系鑒定、輔助育種等方面具有重要意義。利用公共數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)量增加的表達(dá)序列標(biāo)簽(expressedsequencetag,EST)資源來開發(fā)微衛(wèi)星
2、分子標(biāo)記(SimpleSequenceRepeat,SSR)已廣泛地應(yīng)用在許多動(dòng)植物的基因組分析。EST-SSR是通過對(duì)EST序列進(jìn)行分析,找到含有重復(fù)單元的位置,在兩側(cè)設(shè)計(jì)引物而開發(fā)得到的,因此,EST-SSR反映基因的編碼部分,可直接獲得基因的表達(dá)信息,并可對(duì)一些重要性狀進(jìn)行直接鑒定。本研究利用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中牡丹EST序列信息,在了解牡丹EST的SSR信息的基礎(chǔ)上,首次建立了牡丹EST-SSR標(biāo)記,同時(shí)利用篩選出的29對(duì)引物對(duì)55份牡丹品種親緣關(guān)系...【英文摘要】Treepeoniesarefamousornamentalflowersallovertheworldbecauseits
3、flowerislarge,bright-coloredandstrongfragrance.Theyarenotonlyhavehighornamentalvalue,butalsoahighmedicinevalue.Therearesomanycultivarsandthegermplasmresourcesareveryabundant.Theconservationanduseofevaluationisanimportantprerequisiteforuse.Thegeneticrelationshipatthemolecularlevelresearchhasmadegreat
4、progress.However,inrevealingthegeneticrelationshipsofinterspecificspecies...【關(guān)鍵詞】牡丹EST-SSR引物聚類分析親緣關(guān)系【英文關(guān)鍵詞】TreePeonyEST-SSRprimerClusteranalysisGeneticrelationship【索購(gòu)全文】聯(lián)系Q1：138113721Q2：139938848【目錄】牡丹EST-SSR引物開發(fā)及其親緣關(guān)系分析摘要2-4ABSTRACT4-5符號(hào)表6-9第1章文獻(xiàn)綜述9-231.1牡丹概述91.2分子標(biāo)記概述9-131.2.1RFLP標(biāo)記10-111.2.2RAPD標(biāo)
5、記111.2.3AFLP標(biāo)記111.2.4SNP標(biāo)記11-121.2.5ISSR標(biāo)記121.2.6SSR標(biāo)記12-131.3SSR分子標(biāo)記研究發(fā)展131.4EST-SSR分子標(biāo)記的研究發(fā)展13-201.4.1EST分子標(biāo)記的類型14-151.4.2EST分子標(biāo)記的特點(diǎn)151.4.3EST分子標(biāo)記的開發(fā)策略15-171.4.4EST-SSR的頻率及特點(diǎn)171.4.5EST-SSR標(biāo)記在植物比較基因組學(xué)上的應(yīng)用17-191.4.6EST-SSR標(biāo)記在基因功能上的應(yīng)用191.4.7EST-SSR標(biāo)記的發(fā)展趨勢(shì)及前景19-201.5本文的研究?jī)?nèi)容與意義20-231.5.1選題的依據(jù)20-211.5.2
6、研究的目的及意義21-221.5.3研究的技術(shù)路線22-23第2章牡丹EST資源的SSR信息分析及引物開發(fā)23-312.1材料與方法23-242.1.1牡丹EST序列的來源23-242.1.2牡丹EST序列的前期處理242.1.3SSR位點(diǎn)的篩選242.1.4牡丹EST-SSR引物開發(fā)242.2結(jié)果與分析24-282.2.1牡丹EST-SSR的發(fā)掘242.2.2牡丹EST-SSR的頻率和分布密度24-252.2.3牡丹EST中SSR的基元類型及比例25-262.2.4牡丹EST-SSR的重復(fù)次數(shù)26-272.2.5牡丹EST-SSR的重復(fù)長(zhǎng)度272.2.6牡丹EST-SSR引物的開發(fā)27-28
7、2.3討論28-31第3章部分牡丹品種的親緣關(guān)系分析31-443.1材料與方法31-363.1.1試驗(yàn)材料31-323.1.2試驗(yàn)儀器及試劑32-333.1.3試驗(yàn)方法33-363.2結(jié)果與分析36-413.2.1基因組DNA的質(zhì)量檢測(cè)363.2.2多態(tài)性EST-SSR引物的篩選36-373.2.3EST-SSR擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性分析37-383.2.4聚類分析38-41第4章結(jié)論與討論414.1結(jié)論
