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《牡丹論文：牡丹 est-ssr引物 聚類分析 親緣關(guān)系》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、牡丹論文：牡丹EST-SSR引物開發(fā)及其親緣關(guān)系分析【中文摘要】牡丹(PaeoniasuffruticosaAndrews.)花大形美,色艷香濃,不僅具有很高的觀賞價值,而且還有極高的藥用價值。其種質(zhì)資源極為豐富,種質(zhì)資源的保存和評價是其利用的重要前提,其分子水平上的遺傳多樣性研究已取得了較大進展。但是,在揭示種間、種內(nèi)及品種群間遺傳關(guān)系和栽培牡丹起源問題上并未取得一致性結(jié)論。因此,開發(fā)適用于牡丹的EST-SSR標記應(yīng)用于牡丹遺傳圖譜的構(gòu)建、物種間親緣關(guān)系鑒定、輔助育種等方面具有重要意義。利用公共數(shù)據(jù)庫中數(shù)量增加的表達序列標簽(expr
2、essedsequencetag,EST)資源來開發(fā)微衛(wèi)星分子標記(SimpleSequenceRepeat,SSR)已廣泛地應(yīng)用在許多動植物的基因組分析。EST-SSR是通過對EST序列進行分析,找到含有重復(fù)單元的位置,在兩側(cè)設(shè)計引物而開發(fā)得到的,因此,EST-SSR反映基因的編碼部分,可直接獲得基因的表達信息,并可對一些重要性狀進行直接鑒定。本研究利用NCBI數(shù)據(jù)庫中牡丹EST序列信息,在了解牡丹EST的SSR信息的基礎(chǔ)上,首次建立了牡丹EST-SSR標記,同時利用篩選出的29對引物對55份牡丹品種親緣關(guān)系...【英文摘要】Tree
3、peoniesarefamousornamentalflowersallovertheworldbecauseitsflowerislarge,bright-coloredandstrongfragrance.Theyarenotonlyhavehighornamentalvalue,butalsoahighmedicinevalue.Therearesomanycultivarsandthegermplasmresourcesareveryabundant.Theconservationanduseofevaluationisanim
4、portantprerequisiteforuse.Thegeneticrelationshipatthemolecularlevelresearchhasmadegreatprogress.However,inrevealingthegeneticrelationshipsofinterspecificspecies...【關(guān)鍵詞】牡丹EST-SSR引物聚類分析親緣關(guān)系【英文關(guān)鍵詞】TreePeonyEST-SSRprimerClusteranalysisGeneticrelationship【索購全文】聯(lián)系Q1：138113721Q
5、2：139938848【目錄】牡丹EST-SSR引物開發(fā)及其親緣關(guān)系分析摘要2-4ABSTRACT4-5符號表6-9第1章文獻綜述9-231.1牡丹概述91.2分子標記概述9-131.2.1RFLP標記10-111.2.2RAPD標記111.2.3AFLP標記111.2.4SNP標記11-121.2.5ISSR標記121.2.6SSR標記12-131.3SSR分子標記研究發(fā)展131.4EST-SSR分子標記的研究發(fā)展13-201.4.1EST分子標記的類型14-151.4.2EST分子標記的特點151.4.3EST分子標記的開發(fā)策略15
6、-171.4.4EST-SSR的頻率及特點171.4.5EST-SSR標記在植物比較基因組學(xué)上的應(yīng)用17-191.4.6EST-SSR標記在基因功能上的應(yīng)用191.4.7EST-SSR標記的發(fā)展趨勢及前景19-201.5本文的研究內(nèi)容與意義20-231.5.1選題的依據(jù)20-211.5.2研究的目的及意義21-221.5.3研究的技術(shù)路線22-23第2章牡丹EST資源的SSR信息分析及引物開發(fā)23-312.1材料與方法23-242.1.1牡丹EST序列的來源23-242.1.2牡丹EST序列的前期處理242.1.3SSR位點的篩選242
7、.1.4牡丹EST-SSR引物開發(fā)242.2結(jié)果與分析24-282.2.1牡丹EST-SSR的發(fā)掘242.2.2牡丹EST-SSR的頻率和分布密度24-252.2.3牡丹EST中SSR的基元類型及比例25-262.2.4牡丹EST-SSR的重復(fù)次數(shù)26-272.2.5牡丹EST-SSR的重復(fù)長度272.2.6牡丹EST-SSR引物的開發(fā)27-282.3討論28-31第3章部分牡丹品種的親緣關(guān)系分析31-443.1材料與方法31-363.1.1試驗材料31-323.1.2試驗儀器及試劑32-333.1.3試驗方法33-363.2結(jié)果與分析
8、36-413.2.1基因組DNA的質(zhì)量檢測363.2.2多態(tài)性EST-SSR引物的篩選36-373.2.3EST-SSR擴增產(chǎn)物多態(tài)性分析37-383.2.4聚類分析38-41第4章結(jié)論與討論414.1結(jié)論
