侵染番茄的黃瓜花葉病毒、煙草花葉病毒和馬鈴薯s病毒cp基因克隆及序列分析

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1、侵染番茄的黃瓜花葉病毒、煙草花葉病毒和馬鈴薯S病毒CP基因克隆及序列分析于沛?zhèn)b趙薏湛劉勇王德直生顏冰山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護研宄所摘要:以山西省晉中地區(qū)表現(xiàn)褪綠黃化、卷曲、葉脈變黑癥狀的番茄植株葉片為試材,采用雙鏈RNA(double-strandedRNA,dsRNA)技術(shù)和非序列依賴PCR擴增(Sequence-independentamplification,SIA)方法,對侵染番茄病樣的病毒病原進行檢測,以期為山西省番茄病毒病的防治提供參考依據(jù)。結(jié)果表明:該病樣由黃瓜花葉病毒(C

2、MV)、煙草花葉病毒(TMV)和馬鈴薯S病毒(PVS)3種病毒復(fù)合侵染,將其分別命名為CMV-SXFQ、TMV-FQ和PVS-SXFQ。為明確CMV-SXFQ、TMV-FQ和PVS-SXFQ的分類地位,進一步克隆到丫這3個病毒的CP基因序列并進行相似性比較,發(fā)現(xiàn)CMV-SXFQ與CMV各亞組代表株系相似性為74.9%98.8%,氨基酸序列的相似性為82.5%99.5%;TMVFQ與TMV代表株系相似性為74.4%99.8%,氨基酸序列的相似性為83.6%l00.0%;PVS-SXFQ與PVS代表株系相似性為93

3、.2%°9.3%,氨基酸序列的相似性為92.4%l00.0%;系統(tǒng)進化分析表明:CMV-SXFQ分離物與亞組IB的CH、HLJ、XJ2、Am、As株系親緣關(guān)系最近;TMV-FQ分離物與1M、Jimo、SXEQ株系親緣關(guān)系最近;PVSSXFQ分離物與Cm、St株系親緣關(guān)系最近。關(guān)鍵詞:番茄;復(fù)合侵染;煙草花葉病毒;黃瓜花葉病毒;馬鈴薯S病毒;作者簡介:于沛?zhèn)b(1992-),男,碩士研究生,研究方向為分子植物病毒學(xué)。E-mail:13546640863@163.com.作者簡介:牛顏冰(1968-),女,博士,教授

4、,現(xiàn)主耍從事分子植物病毒學(xué)和中藥GAP等研究工作。E-mail:niuyan-bingbest@163.com.收稿日期:2017-07-24基金:公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項資助項目(201303028)CloningandSequenceAnalysisofCoatProteinGenesofCMV,TMVandPVSFromLycopersiconesculentumMill.PlantYUPeixiaZHAOHuiqiLIUYongWANGDefuNIUYanbingCollegeofLifeScienc

5、es,ShanxiAgriculturalUniversity;HunanPlantProtectionInstitute,HunanAcademyofAgriculturalScience;Abstract:Theleavesoftomato(Lycopcrsiconesculentum)fromJinzhongregionofShanxiProvinceshownchloroticyellows,curly,blackleafpathogenwereusedasmaterials,thetechnology

6、ofdoublestrandedRNA(dsRNA)andsequence-independentamplification(SIA)wasusedtoidentifytheviruspathogenthatinducedtomato,inordertoprovidereferenceforthepreventionandcontrolofvirusdiseaseinfectingtomatoinShanxiProvince.Theresultsshowedthatsamplesofplantswereinfe

7、ctedwithtobaccomosaicvirus(TMV),cucumbermosaicvirus(CMV)andpotatovirusS(PVS)respectivelyandnamedCMV-SXFQ,TMV-FQandPVS-SXFQ.TofurthercharacterizetheisolateofCMV-SXFQ,TMV-FQandPVS-SXFQ,thecoatprotain(CP)ofCMV-SXFQ,TMV-FQandPVSSXFQwereclonedandanalyzed.Sequence

8、alignmentsshowedthatthenucleotidehomologysimilaritybetweenCMV-SXEQandCMVsubgroupviruswere74.9%-98.8%,andtheaminoacidesequencesimilaritywere82.5%-99.5%.ThenucleotidehomologysimilartitybetweenTMV-

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