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《基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法研究》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、電子科技大學(xué)UNIVERSITYOFELECTRONICSCIENCEANDTECHNOLOGYOFCHINA碩士學(xué)位論文MASTERDISSERTATION（電子科技大學(xué)圖標(biāo)）論文題目基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法研究學(xué)科專業(yè)生物醫(yī)學(xué)工程指導(dǎo)教師饒妮妮教授作者姓名王敏班學(xué)號200520901009分類號密級UDC注1學(xué)位論文基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法研究（題名和副題名）王敏（作者姓名）指導(dǎo)教師姓名饒妮妮教授電子科技大學(xué)成都（職務(wù)、職稱、學(xué)位、單位名稱及地址）申請學(xué)位級別碩士專業(yè)名稱生物醫(yī)學(xué)工程論文提交日期2
2、008.5論文答辯日期2008.6學(xué)位授予單位和日期電子科技大學(xué)答辯委員會主席評閱人2008年月日注1：注明《國際十進分類法UDC》的類號。獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得電子科技大學(xué)或其它教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。簽名：日期：年月日關(guān)于論文使用授權(quán)的說明本學(xué)位論
3、文作者完全了解電子科技大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)電子科技大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。（保密的學(xué)位論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定）簽名：導(dǎo)師簽名：日期：年月日摘要摘要在后基因組時代，生物學(xué)所面臨的基本挑戰(zhàn)之一就是理解控制細胞活動的復(fù)雜基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。隨著大量微陣列實驗的進行，給生命科學(xué)的研究帶來了豐富的實驗數(shù)據(jù)，利用這些實驗數(shù)據(jù)構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)
4、絡(luò)使在分子水平上研究細胞的功能成為可能。由于一個基因的表達會受到其他基因的影響，而這個基因又會影響其他基因的表達，這種相互影響相互制約的關(guān)系就構(gòu)成了復(fù)雜的基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。因此，基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)描述了多個基因之間協(xié)同完成不同任務(wù)的關(guān)系。通過構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，可以對某一個物種或組織中的全部基因的表達關(guān)系進行整體的模擬分析和研究，從而在系統(tǒng)的框架下認識生命現(xiàn)象和揭示生命活動的基本規(guī)律。當(dāng)前貝葉斯網(wǎng)絡(luò)方法被廣泛用于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建，然而一些貝葉斯網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)算法需要使用已知的節(jié)點順序進行結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)，如K2和TPDA
5、-∏算法。在先驗信息未知時，節(jié)點間的順序是不可能得到的，若使用隨機的節(jié)點順序進行結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)，其準(zhǔn)確性將非常差，所以這在很大程度上限制了貝葉斯網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)方法的應(yīng)用。本文提出了一種推斷節(jié)點拓撲順序的方法，它彌補了貝葉斯網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)需要節(jié)點順序的不足。將該方法分別與K2算法和TPDA-∏算法進行結(jié)合，形成了兩種推斷貝葉斯網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的新方法，把它們分別叫做NO-K2算法和NO-TPDA-∏算法。最后，分別用基準(zhǔn)數(shù)據(jù)集和酵母基因芯片數(shù)據(jù)對這兩種算法進行仿真實驗，都獲得了較好的效果。關(guān)鍵字：基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，節(jié)點拓撲排序，
6、貝葉斯網(wǎng)絡(luò)，K2算法，TPDA-∏算法IABSTRACTABSTRACTInthepost-genomicera,oneofthefundamentalchallengesinthebiologicalfieldremainsunderstandingthecomplexgeneregulatorynetworksthatcontrolcellularfunctions.Withthedevelopmentofhigh-throughputmicroarraytechnologies,itbringsag
7、reatdealofmicroarraydatatolifescienceresearch,andconstructinggeneregulatorynetworksfromtheseexperimentaldatamakescellularfunctionalresearchpossibleatthemolecularlevel.Becausetheexpressionofonegenewillbeinfluencedbyothergenes,andthegenewillalsoinfluencethe
8、expressionsofothergenes,theseinteractionswillconstructacomplexgeneregulatorynetwork.Sogeneregulatorynetworksdescribetherelationshipsamongmanygeneswhichcompletedifferenttaskscooperatively.Constructinggeneregulatoryne
