水稻光殼基因gl-1的圖位克隆和功能初探

水稻光殼基因gl-1的圖位克隆和功能初探

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1、RICELIGHTSHELLGENEGL-1MAP-BASEDCLONINGANDFUNCTIONSWEREDISCUSSED水稻光殼基因gl-1的圖位克隆和功能初探指導老師DIRECTPROFESSOR^:劉自強副教授隊伍成員TEAMMATES^超曉禹、代羽、陳越0X035/12574303?.翻:Abstract:1—>BOW2(―)研究意義2(二)國A外研究現(xiàn)狀21、水稻基因組的測序為基因的圖位克隆提供了條件22、水稻光殼基因的研究進展2二、實驗內(nèi)容及步驟4(―)實驗N容41、水稻光殼基因的7個候選基因測序4(二)實驗步驟41、W才41、PCR43、電

2、泳:擴增產(chǎn)物用1.2%的瓊脂糖凝膠進行電泳5三、結果及分析5(-)關5側6摘要:光殼稻是世界稻種資源中的重要組成部分,本項n組從來源于美國光殼稻晶種“Starbonnet99"的以華粳秈74為背景的單R段代換系(SSSL)鑒定出1個控制稻谷光殼性狀的基因gl-1,并將其候選區(qū)域界定在35.9kb的物理區(qū)域內(nèi),共包含7個候選基因。本項R擬在此工作的基礎上,通過對7個候選基因進行測序分析,將候選基因范圍縮小到2個,為進一步確定H標菇因,進而為丫解水稻稃毛發(fā)育的遺傳葙礎、探明水稻稃毛發(fā)育的分了機理和杏效利用光殼稻資源奠定基礎。關鍵詞光売稻圖位克隆稃毛發(fā)育基因測序F

3、inemappingandcandidategeneanalysisofgenecontrollingtrichomeformationinrice(XiaoyuZhao,YuDai,YueChen)(CollegeofAgriculture,SouthChinaAgriculturalUniversity)Abstract:Glabrousriceisanimportantingredientofworldseedriceresources.Inourstudy,weidentifiedgl-1gene,whichcontrolstrichomeforma

4、tioninriceleavesandhulls,fromasinglesegmentsubstitutionline(SSSL)derivedfromcrossesbyusingHJX74astherecurrentparentandStarbonnet99asthedonor.Finemappingandhigh-resolutionlinkageanalysiswerecarriedout,andthegenewaslocalizedtoa35.9kbgenomicregionthatcontainssevenannotatedgenesaccordi

5、ngtothegenomesequenceofjaponicaNipponbare.Bysequencingthesevencandidategenes,wenarroweddownthecandidategenesfromseventotwo,greatlypromotingthefinalsuccessfulcloningofthisgene,elucidatingthemechanismsoftrichomeformationinriceandfacilitatingitsutilizationinagriculture.KeywordsGlabrou

6、srice;Finemapping;Trichomedevelopment;Genesequencing(一)研究意義光殼稻是世界稻種資源中的一個重要組成部分,我國的云貴高原、印尼爪哇和非洲都冇原始品種(嚴宗卜,1998)。普通栽培稻屮的光殼稻(nuda)屬粳亞種A的一個生態(tài)群,是秈粳分化不徹底的熱帶粳稻,因其穎殼和葉片光滑無毛(無稃毛)而取名為光殼稻或光身稻(Glabrousrice)(程侃聲,1993)。它不僅適合于現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的機械化操作,而且比宥稃毛品種可增加10%?15%的倉貯景(郭龍彪等,1999)。很研究者發(fā)現(xiàn)許多光殼稻品種對秈稻和梗稻均具有良好的

7、親和性(嚴宗卜,1998;郭龍彪等,1999;秦發(fā)蘭等,1994;劉建昌等,1996;曾亞文等,1998、1999;胡培松等,1999;張培江等,1999;劉文炳等,2003)。光殼稻的光殼基因的悶位克隆,對進-?步弄清水稻稃毛發(fā)育的分子機理及有效利用光殼稻資源具有重要意義。(二)國內(nèi)外研究現(xiàn)狀1、水稻基因組的測序為基因的圖位克隆提供了條件水稻基因組的測序積累了大M的序列數(shù)裾,為大規(guī)模分子標記的發(fā)展提供了可能。McCouchetal.(2002)根據(jù)水稻基因組中的微衛(wèi)星序列發(fā)展了2240個微衛(wèi)星標記,使水稻基因組中可以利用的微衛(wèi)呈標記的總數(shù)達到了2740個。

8、Shenetal.(2004)根據(jù)秈粳亞種問的序列差

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