華南野生蓖麻遺傳多樣性分析與核心種質(zhì)構(gòu)建

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1、廣東海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：所呈交的論文是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下獨(dú)立進(jìn)行研究所取得的研究成果。除了文中特別加以標(biāo)注引用的內(nèi)容外，本論文不包含任何其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫的成果作品。對(duì)本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人和集體，均已在文中以明確方式標(biāo)明。本人完全意識(shí)到本聲明的法律后果由本人承擔(dān)。作者簽名：弓長(zhǎng)舟2010年4月20日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留并向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱和借閱。本

2、人授權(quán)廣東海洋大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。本學(xué)位論文屬于1、保密口，在年解密后適用本授權(quán)書。2、不保密團(tuán)。作者簽名：導(dǎo)師簽名：(請(qǐng)?jiān)谝陨舷鄳?yīng)方框內(nèi)打“4")2010年4月20日華南野生蓖麻遺傳多樣性研究與核心種質(zhì)構(gòu)建摘要本文以258份華南野生蓖麻材料為基礎(chǔ)，開展了基于表型標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)、SRAP分子標(biāo)記數(shù)據(jù)和SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)的遺傳多樣性研究，初步構(gòu)建了華南野生蓖麻核心種質(zhì)。主要結(jié)果如下：一、利用13個(gè)性狀的標(biāo)準(zhǔn)

3、化數(shù)據(jù)、29對(duì)SRAP引物數(shù)據(jù)和30對(duì)SSR引物數(shù)據(jù)分別對(duì)194份、258份、258份華南野生蓖麻材料進(jìn)行了遺傳多樣性分析。1、三種聚類結(jié)果的平均遺傳距離分別為為7．144、9．249和6．519，平均Shannon指數(shù)分別為7．486、0．428和0．287，表明SRAP數(shù)據(jù)能更有效地反應(yīng)群體的遺傳多樣性，基因型值數(shù)據(jù)能更全面地反映群體的變異度。2、SRAP標(biāo)記檢測(cè)到的平均等位基因數(shù)與SSR標(biāo)記幾乎相等(分別為1．996和2)，但平均有效基因基因數(shù)高于SSR標(biāo)記(分別為1．367和1．182)

4、，表明SRAP標(biāo)記檢測(cè)到的等位基因在群體中分布更均勻。SRAP標(biāo)記的平均Nei’S基因多樣性值(0．263)和平均Shannon指數(shù)(0．428)高于SSR(0．287和O．153)，SRAP標(biāo)記比SSR標(biāo)記更能反映出群體的遺傳分化度和遺傳變異度。3、三種聚類結(jié)果均表明，材料的親緣關(guān)系與地理遠(yuǎn)近沒有直接關(guān)系，但小范圍內(nèi)，材料親緣關(guān)系往往較近。同一地區(qū)的材料在小組中成組趨勢(shì)明顯。4、廣東的材料遺傳多樣性最豐富，廣西次之，海南最低。二、采用混合線性模型，用最小范數(shù)二階無(wú)偏估算法(MinimumNor

5、mQuadraticUnbiasedEstimation，MINQUE)估計(jì)各項(xiàng)隨機(jī)效應(yīng)方差，用調(diào)整無(wú)偏預(yù)測(cè)法(AdjustedUnbiasedPrediction，AUP)估算數(shù)量性狀的基因型值，用UPGMA法聚類后，分別以5％、10％、15％、20％、25％、30％的抽樣比例，以最小距離逐步取樣法(LDSS)抽樣，構(gòu)建了6個(gè)初級(jí)核心子集，經(jīng)代表性評(píng)價(jià)后從中確定初選核心種質(zhì)；在此基礎(chǔ)上，以6種壓縮方式(基因型值、SRAP、SSR、基因型值+SRAP、基因型值+SSR、基因型值+SRAP+SSR

6、)和3種取樣策略(最小距離逐步聚類隨機(jī)取樣(LDSRS)、最小距離逐步聚類優(yōu)先取樣(LDSPS)和最小距離逐步聚類偏離度取樣(LDSDS))構(gòu)建備選核心子集，根據(jù)對(duì)備選核心子集的代表性評(píng)價(jià)結(jié)果建立備選核心種質(zhì)和核心種質(zhì)。1、抽樣比例為25％的初級(jí)核心子集代表性最好，宜作為初選核心種質(zhì)。2、初選核心種質(zhì)的平均Shannon(I)指數(shù)達(dá)到原群體的72．96％，平均Simpson(H)指數(shù)達(dá)原群體的98．49％，F(xiàn)值和t值均不顯著，數(shù)量性狀的方差、均值和極差的相關(guān)系數(shù)均高于O．98，數(shù)量性狀變異系數(shù)的

7、相關(guān)系數(shù)為0．5496，均值差異百分率為0．00，方差差異百分率為100％，極差符合率為94．39％，變異系數(shù)變化率為120．59％，對(duì)原始群體有較好的代表性。3、對(duì)六種壓縮方式和三種取樣策略的比較分析結(jié)果顯示，以“基因型值+SRAP+SSR”結(jié)合最小距離逐步聚類優(yōu)先取樣法構(gòu)建核心種質(zhì)效果最佳。4、根據(jù)評(píng)價(jià)參數(shù)及遺傳多樣性分析結(jié)果，初步確定194份華南野生蓖麻的核心種質(zhì)由以下12份材料組成：HN．HKl0、HN．LV55、HN．LV58、GX21、GX29、GX73、DHD66、ZJ95、LZ2

8、3、LZ36、YJ2、HYl，占原群體的6．19％。5、核心種質(zhì)的平均Shannon(I)指數(shù)為0．648，平均Shannon(I)指數(shù)為2．013，F(xiàn)值和t值均不顯著，數(shù)量性狀的方差、均值和極差的相關(guān)系數(shù)均高于0．99，數(shù)量性狀變異系數(shù)的相關(guān)系數(shù)為O．8946，均值差異百分率為0．00，方差差異百分率為100％，極差符合率為91．37％，變異系數(shù)變化率為120．51％。關(guān)鍵詞：華南野生蓖麻，SRAP，SSR，種質(zhì)資源，遺傳多樣性，核心種質(zhì)GeneticDiversityandCoreColle