基于線粒體控制區(qū)部分序列的大青鯊種群遺傳結(jié)構(gòu)研究

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1、第29卷第5期大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào)Vol.29No.52014年10月JOURNALOFDALIANOCEANUNIVERSITYOct.2014DOI:10.3969/J.ISSN.2095-1388.2014.05.008文章編號(hào):2095-1388(2014)05-0463-06基于線粒體控制區(qū)部分序列的大青鯊種群遺傳結(jié)構(gòu)研究11、21、21、2鄭真真,許強(qiáng)華,戴小杰,朱江峰(1郾上海海洋大學(xué)海洋科學(xué)學(xué)院,上海201306;2郾大洋漁業(yè)資源可持續(xù)開發(fā)省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,農(nóng)業(yè)部大洋漁業(yè)資源環(huán)境科學(xué)觀測(cè)實(shí)驗(yàn)站,國(guó)家遠(yuǎn)洋漁

2、業(yè)工程技術(shù)研究中心,上海201306)摘要:基于線粒體DNA(mtDNA)控制區(qū)部分序列對(duì)采集自太平洋、大西洋、印度洋的5個(gè)大青鯊Prion鄄aceglauca群體165尾成魚樣本進(jìn)行遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明:165尾大青鯊的mtDNA控制區(qū)片段長(zhǎng)為694bp,共得到110個(gè)變異位點(diǎn),定義了145個(gè)單倍型,堿基組成中A為33郾46%,T為36郾40%,C為18郾61%,G為11郾53%,G+C含量為30郾14%;單倍型多樣性指數(shù)(H)在各個(gè)采樣點(diǎn)都較高,平均d值為0郾9973依0郾0014,核苷酸多樣性指數(shù)(仔)為

3、0郾01510依0郾00091,這表明大青鯊群體的遺傳多樣性水平很高,遺傳資源豐富;分子方差分析表明,99郾28%的遺傳變異出現(xiàn)在種群內(nèi),0郾72%的遺傳變異來自于種群間;采用鄰接法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹表明,5個(gè)群體間未形成顯著的遺傳結(jié)構(gòu),群體間的高基因交流值(N)和低遺傳分化指數(shù)(F)揭示了三大洋的大青鯊群體間基因交流頻繁,不存在顯著的遺傳分化。mst關(guān)鍵詞:大青鯊;種群遺傳結(jié)構(gòu);線粒體DNA;控制區(qū)中圖分類號(hào):S917郾4搖搖搖搖文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A[5-6]搖搖大青鯊Prionaceglauca是一種大型中上層鯊研究的重要標(biāo)記。

4、線粒體控制區(qū)(D-loop)具魚,隸屬于真鯊目Carcharhiniformes、真鯊科Car鄄有較高的突變和累積,是研究種內(nèi)遺傳分化的重要charhinidae、大青鯊屬PrionaceCantor,是3種最豐工具,被廣泛應(yīng)用于各物種的遺傳分化和遺傳結(jié)構(gòu)[1][7][8]富的大洋性鯊魚之一。作為一種大型的軟骨魚研究。陳驍?shù)壤镁€粒體控制區(qū)對(duì)中國(guó)南部類,大青鯊廣泛分布于太平洋、大西洋、印度洋海域條紋斑竹鯊Chiloscylliumplagiosum的遺傳多態(tài)(簡(jiǎn)稱三大洋)海域,其分布范圍最北可達(dá)挪威,性進(jìn)行了研究,結(jié)果表明,

5、條紋斑竹鯊的基因流主最南可達(dá)智利。大青鯊在太平洋主要分布于20毅要在淺海近岸水域擴(kuò)散,遺傳變異程度受地理結(jié)構(gòu)[9]N~20毅S,在大西洋主要分布于從紐芬蘭到阿根廷和距離隔離的影響;Mendonca等采用CO玉基因[2-3]的東部海域,以及從挪威到南非的西部海域。部分序列和D-loop部分序列評(píng)估大西洋西部斜鋸根據(jù)大西洋金槍魚養(yǎng)護(hù)委員會(huì)(ICCAT)1990—牙鯊Rhizoprionodonacutus種群核苷酸的差異,結(jié)2010年的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),大青鯊在金槍魚的兼捕種類果表明,大西洋斜鋸牙鯊和加勒比斜鋸牙鯊兩個(gè)不中占的比重最大,

6、大青鯊數(shù)量正在急劇下降,已引同物種之間存在較高水平的遺傳差異;Keeney[4][10]起了ICCAT的重點(diǎn)關(guān)注。結(jié)合當(dāng)前的捕撈情況等利用線粒體控制區(qū)對(duì)大西洋墨西哥灣169個(gè)和資源現(xiàn)狀,保護(hù)大青鯊種群已成為漁業(yè)管理中一黑鰭真鯊Carcharhinuslimbatus幼體樣本的遺傳異項(xiàng)重要任務(wù)。質(zhì)性進(jìn)行了相關(guān)研究,結(jié)果表明,該海域的黑鰭真線粒體DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)呈鯊并沒有出現(xiàn)明顯的種群遺傳結(jié)構(gòu)。共價(jià)閉合的環(huán)狀雙鏈,具有分子小、結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、嚴(yán)近年來,不少學(xué)者對(duì)大青鯊的繁殖生物學(xué)特[11][12-

7、15][16-18]格遵守母系遺傳的特點(diǎn),能有效地揭示群體內(nèi)外的征、資源狀況、行為特性、棲息環(huán)[19][4]遺傳變異,現(xiàn)已成為魚類分子生態(tài)學(xué)、遺傳多樣性境和生長(zhǎng)等進(jìn)行了研究,為大青鯊群體的資搖收稿日期:2014-01-26搖基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金重大研究計(jì)劃培育項(xiàng)目(91131006);上海市教委科研創(chuàng)新項(xiàng)目曙光計(jì)劃(13SG51)搖作者簡(jiǎn)介:鄭真真(1987—),女,碩士研究生。E-mail:zzzheng2013@126郾com搖通信作者:許強(qiáng)華(1974—),女,博士,教授。E-mail:qhxu@shou郾edu

8、郾cn464大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào)搖搖搖搖搖搖搖搖搖搖搖搖第29卷源保護(hù)和可持續(xù)發(fā)展提供了科學(xué)資料。戴小杰2010年9月—2012年2月中國(guó)科學(xué)觀察員在三大[20]等對(duì)東太平洋熱帶海域大青鯊繁殖生物學(xué)特征洋公海海域金槍魚延繩釣漁船的漁獲物。該船作業(yè)的研究表明,大青鯊是繁殖能力很強(qiáng)的大型鯊魚之期間