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1、學(xué)校代碼:10264研究生學(xué)號(hào):M090101045上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文題目:微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性英文題目:AnalysisofGeneticDiversityonSeveralWildStocksofTaimen(Huchotaimen)byMicrosatelliteMarkersandtheControlRegionofMitochondrialDNA專業(yè):水產(chǎn)養(yǎng)殖研究方向:水產(chǎn)動(dòng)物遺傳與生態(tài)姓名:劉博指導(dǎo)教師:尹家勝二O一二年四月五日上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:我恪守學(xué)術(shù)道德,崇尚嚴(yán)謹(jǐn)學(xué)風(fēng)。所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師的指
2、導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)明確注明和引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品及成果的內(nèi)容。論文為本人親自撰寫,我對(duì)所寫的內(nèi)容負(fù)責(zé),并完全意識(shí)到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名:日期:年月日上海海洋大學(xué)學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,同意學(xué)校保留并向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱或借閱。本人授權(quán)上海海洋大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密□,在年解密后適用本版權(quán)書。本學(xué)位論文
3、屬于不保密□學(xué)位論文作者簽名:指導(dǎo)教師簽名:日期:年月日日期:年月日上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性摘要哲羅魚(Huchotaimen)屬鮭形目(Samoniformes)、鮭科(Salmonidea)、哲羅魚屬(Hucho),是一種大型的珍稀冷水魚類,也是一種優(yōu)良的淡水養(yǎng)殖品種。本研究利用微衛(wèi)星分子標(biāo)記和D-LOOP區(qū)序列分析技術(shù)研究了黑龍江流域幾個(gè)哲羅魚野生群體的遺傳多樣性,主要包括以下研究?jī)?nèi)容:利用20對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)9個(gè)野生哲羅魚群體進(jìn)行了分析。結(jié)果表明:9個(gè)哲羅魚群體的觀測(cè)雜合度在0.0994-0.8882之間,期望雜合度在0.20
4、05-0.8759之間,PIC指數(shù)在0.3432-0.5261之間,其中呼瑪河群體的遺傳多樣性較低。群體間的Fst在0.0246-0.2333(P<0.0001)之間,Nm在0.8216-9.9292之間,群體間遺傳分化較明顯,基因交流少;各群體間的遷移率不一致,遷入率與遷出率不對(duì)稱,有大群體向小群體遷移的趨勢(shì);群體的同胞系比例在27.78%-90.91%之間,說明近交壓力較大,可能經(jīng)歷過遺傳瓶頸或存在這樣的風(fēng)險(xiǎn);AMOVA分析表明群體間各基因座遺傳分化系數(shù)的均值為0.1081;聚類分析和遺傳組成分析結(jié)果均顯示呼瑪河群體與烏蘇里江群體聚為一支,黑龍江中上游群體聚為一支。通過設(shè)計(jì)特異性
5、引物,采用PCR技術(shù)對(duì)10個(gè)野生哲羅魚群體共42個(gè)個(gè)體的mtDNAD-loop區(qū)序列進(jìn)行擴(kuò)增,測(cè)序得到的序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)該42個(gè)序列長(zhǎng)度變異較小,選取共555bp序列進(jìn)行比對(duì)分析。采用MEGA(version4.0)和DnaSP(version4.0)軟件對(duì)序列進(jìn)行分析,結(jié)果顯示:42條哲羅魚線粒體D-LOOP序列中,A、T、G、C堿基的含量平均為30.2%,31.3%,15.8%和22.7%,和已報(bào)道的其他魚類的D-LOOP堿基組成類似。42個(gè)個(gè)體表現(xiàn)為28種單倍型,包括28個(gè)多態(tài)位點(diǎn),單倍型多樣性指數(shù)在0.733-1.000之間,核苷酸多樣性指數(shù)(PI)在0.00156-0.0
6、1444之間。各群體的遺傳多樣性高低差別較大,其中根河群體(GH)具有較高的遺傳多樣性而虎頭江(HT)、抓吉(ZJ)、海青(HQ)、呼瑪(HM)四個(gè)江段的群體遺傳多樣性較低。42個(gè)個(gè)體的聚類分析也表明,即便是地理位置較近的群體間的基因交流也偏少,群體之間具有比較明顯的遺傳分化。I上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文以上結(jié)果表明哲羅魚資源量的減少已經(jīng)影響了群體間的基因交流,應(yīng)該在杜絕對(duì)哲羅魚資源破壞性捕撈的同時(shí)加強(qiáng)群體間基因交流,并且利用遺傳多樣性較高的群體進(jìn)行人工繁殖和增殖放流來提高各野生群體的遺傳多樣性,以期達(dá)到全面保護(hù)野生哲羅魚種質(zhì)資源的目的。關(guān)鍵詞:哲羅魚,野生群體,微衛(wèi)星標(biāo)記,D-LOO
7、P序列,遺傳多樣性II上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文AnalysisofGeneticDiversityonSeveralWildStocksofTaimen(Huchotaimen)byMicrosatelliteMarkersAndtheControlRegionofMitochondrialDNAABSTRACTHuchotaimenwhichbelongstoSamoniformes,Salmonidea,Huchogenusisalargecoldwa