myod1基因與豬肉質(zhì)性狀相關(guān)性分析

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1、河北農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文MyoD1基因與豬肉質(zhì)性狀相關(guān)性分析姓名:趙廣珍申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):動(dòng)物遺傳育種與繁殖指導(dǎo)教師:賈青20120520摘要IIIIIHIIIIMillIIIIII

2、\2143232肌分化基因(MyoDl)對(duì)豬的生長(zhǎng)和肌肉的產(chǎn)生起著關(guān)鍵的作用,可使許多類型的細(xì)胞(如成纖維細(xì)胞、脂肪細(xì)胞等)轉(zhuǎn)化為成肌細(xì)胞并分化為成熟的肌纖維。目前在國(guó)內(nèi)還未見(jiàn)關(guān)于豬的MyoDl基因外顯子1的突變位點(diǎn)的報(bào)道,國(guó)外鮮有報(bào)道。分析MyoDl基因結(jié)構(gòu),研究該基因的變異,探討變異位點(diǎn)與豬肉質(zhì)性狀的關(guān)系,可為豬的肉質(zhì)改良提供分子基礎(chǔ)。隨機(jī)選

3、擇140頭杜×長(zhǎng)×大三元商品雜交豬屠宰。常規(guī)方法測(cè)定滴水損失、pH、肉色、大理石花紋、剪切力、肌內(nèi)脂肪含量;運(yùn)用Bioe(1it、BLAST、SMART、ProtParam、SOPMA等軟件和在線工具,對(duì)豬MyoDl基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。采用PCR-SSCP技術(shù)分析MyoDl基因第1外顯子的單核苷酸多態(tài)性,一般線性模型分析基因型與豬肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性。顯微鏡觀察肌肉石蠟切片并測(cè)定肌纖維的密度、直徑、面積、長(zhǎng)徑、短徑和長(zhǎng)短徑比,分析肌肉組織學(xué)特性與肉質(zhì)性狀的關(guān)系。所構(gòu)建不同物種的聚類圖顯示豬與牛羊的MyoDl基因結(jié)構(gòu)最為相似:MyoD

4、l基因存在較強(qiáng)的密碼子偏愛(ài)性;MyoDl蛋白由BASIC(堿性)結(jié)構(gòu)、HLH結(jié)構(gòu)域和Pfam:Myf5結(jié)構(gòu)域和由2個(gè)低復(fù)雜度區(qū)域(LCR)組成;該二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無(wú)規(guī)則卷曲和u螺旋構(gòu)成,在該蛋白上沒(méi)有發(fā)現(xiàn)合適的信號(hào)肽;磷酸化位點(diǎn)主要發(fā)生在Set、Thr和Tyr上。在MyoDl基因5'UTR的119bp處發(fā)現(xiàn)G>A的突變,在其第l外顯子387bp處發(fā)現(xiàn)C>T突變,經(jīng)檢測(cè)這2個(gè)突變均為AA和AB基因型,2個(gè)變異位點(diǎn)在群體中都是從型為優(yōu)勢(shì)基因型,各位點(diǎn)基因頻率均符合Hardy-Weinberg平衡。在5'UTR上的突變對(duì)豬肌肉的肌內(nèi)脂肪含量

5、和pH呈顯著影響(p0.05)。對(duì)肌纖維特性進(jìn)行相關(guān)分析結(jié)果顯示,密度與剪切力和大理石花紋呈負(fù)相關(guān)(pA突變對(duì)豬肌肉的肌內(nèi)脂肪和pH有顯著影響,在MyoDl基因外顯子1上的C>T突變?yōu)橥x突變對(duì)肉質(zhì)性狀無(wú)顯著影響;肌纖維特性對(duì)大理石花紋有顯著影響;MyoDl基因的AA純合基因型可使肌纖維的直徑、長(zhǎng)徑、短徑和面積增大,使密度降低。關(guān)鍵詞:豬:MyoDl基

6、因;肉質(zhì)性狀;PCR-SSCP;肌纖維RelationshipAnalysisbetweenMyoDlGeneandMeatQualityTraitsinPigPostgraduate:ZhaoGuangzhenMajor:AnimalGeneticsBreedingandReproductionDirection:AnimalGeneticsTutor:JiaQingAbstractPorcinemyogenicdifferentiationgenes(MyoDl)playakeyroleingrowthandmuscledeve

7、lopment.Lotsofothertypesofcell(suchasfibroblasts,adiposecells)weretransformedtomyoblastswhichweredifferentiatedintomaturemusclefibers.NoreportonthemutationalsitesinMyoDlgeneexonlhasbeenfoundinpigindomestic,andlessreportinabroad.TheAnalyzingthestructureofMyoD1gene,explo

8、ringitsvariationandresearchingontheinfluenceofthevariationlociwithporkqualitytraitswillprovideafuthermolecularbasisforporcinemeatqualityimproved.140Duroc×LandracexYorkhybridpigswererandomselectedandslaughtered.Meatqualitytraitsincludedriploss,pHvaluefleshcolorshearforc

9、eandIMFweremeasuredbyconventionalmethod.Bioinformaticalanalysiswasexecutedwiththeaidofthesol[wareandonlinetools,inclu

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